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sanylt

银虫 (小有名气)

[求助] 有什么软件可以输入原子坐标判断空间群的?

如果知道了一个晶胞里的所有原子的坐标,怎么判断他属于哪个空间群?
ps:因为是自己构建的超晶胞,在初始晶胞上做了掺杂和畸变,对称性已经改变了,结构很大,包含数百个原子,很难手动验算对称性……

[ Last edited by sanylt on 2012-8-3 at 16:21 ]
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gxmczl88

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
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linhua0402313: 金币+1, 感谢参与交流,希望对楼主有帮助 2012-08-03 23:15:35
sanylt: 金币+5, 就是未知相,现在还没有一个权威的结构,随着掺杂应该有多个相变(很可能是多个结构类似的相共存),粉末法怎么解啊,关键是我的样品不好,做不出纯相来,杂质很多,用GSAS拟合的结果不太好,不知你有什么好的建议? 2012-08-03 23:42:58
没听过,不过有点疑惑,你都得到原子坐标呢?怎么还不能判断空间群?一般对于已知相通过findit或toth即可查询空间群,如果对于未知相那就有点麻烦,但是可以利用粉末法通过相应的软件求解。
2楼2012-08-03 21:37:04
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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linhua0402313: 金币+1, 感谢参与交流,希望对楼主有帮助 2012-08-03 23:15:45
sanylt: 金币+5, 有帮助, 对啊,我也知道这个笨办法,但是单胞里原子数太多,一个个对实在工程量浩大 2012-08-03 23:37:37
没听说有这样的软件, 但是你可以人工确定。

比如用你的坐标的规律。 x, y, z    x +1/2 , y + 1/2, z + 1/2 之类的。 去书上找找, 比较费力,但是应该是可以确定的。

楼主好运
学无止境
3楼2012-08-03 23:12:11
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metong

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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sanylt: 金币+3, 有帮助, 什么高斯?是不是用于第一性原理计算的Gaussian,不过我没用过,要学的话感觉会很痛苦…… 2012-08-03 23:47:33
高斯应该可以了吧?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2012-08-03 23:24:02
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sanylt

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by metong at 2012-08-03 23:24:02
高斯应该可以了吧?

好像Gaussian是用于计算电子结构的吧,我不需要那么高级,只要简单地验算一下,找到我设计的超晶胞的最高对称空间群就够了,因为目前结构还处于猜的状态,很可能会经过多次调整,最麻烦的是我的样品不好,如果能做出单相就完全没这么烦恼了
5楼2012-08-03 23:54:37
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gxmczl88

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


lijunjie84: 金币+1, 感谢应助!!!!! 2012-08-04 10:04:50
引用回帖:
2楼: Originally posted by gxmczl88 at 2012-08-03 21:37:04
没听过,不过有点疑惑,你都得到原子坐标呢?怎么还不能判断空间群?一般对于已知相通过findit或toth即可查询空间群,如果对于未知相那就有点麻烦,但是可以利用粉末法通过相应的软件求解。

如果不是纯相或者不接近纯相的XRD,任何方法是根本解不出来的,对于未知相粉末法是通过TEM、EDS、XRD甚至第一性原理等方法确定纯相的元素比,即确定元素的化学式。随后利用powerdx、EXPO、Lebai方法、RIETAN/FULLPROL等软件对纯相的XRD进行解结构,解出点阵参数、所属晶系、空间群、原子占位、热力学参数等。最终确定物质的具体结构参数。我对如何得到纯相的xrd有点不懂,我记得我的导师做过的XRD里曾有过好多相,然后他又采取了措施对选择的未知相区域进行XRD测试,得到未知相的XRD,而后进行解,请你找这方面的专家咨询一下,这个我也要学习一下。
6楼2012-08-04 08:56:31
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sanylt

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by gxmczl88 at 2012-08-04 08:56:31
如果不是纯相或者不接近纯相的XRD,任何方法是根本解不出来的,对于未知相粉末法是通过TEM、EDS、XRD甚至第一性原理等方法确定纯相的元素比,即确定元素的化学式。随后利用powerdx、EXPO、Lebai方法、RIETAN/FULLP ...

叹气,如果能做出单晶就不会像现在这么烦恼了,或者能做出单相的粉晶也好啊,现在问题是材料本身就是多相共存的,转变焓很低,而且又有掺杂原子的干扰……


“采取了措施对选择的未知相区域进行XRD测试”

这个好像很有问题吧,XRD是宏观的,他怎么能够只让其中某个相反射,而排除其他相的干扰?

TEM倒是可以选区域保证单相,但是这个技术上比较麻烦,主要是你要找到你想要的相比较不容易,而且在多个结构类似的相中,你也没法说明你找到的那个相就是你想研究的那个相
7楼2012-08-04 13:48:11
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yyqu0306

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可以尝试一下Gaussview中的点群结构判断,我做金属簇的时候用过,不知对你的体系是否适用。
8楼2013-04-16 20:58:40
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