24小时热门版块排行榜    

查看: 1628  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

年年年2011

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助:DGGE新手,基本问题求助,请教各位高手

各位大侠,才开始了解做DGGE,有些问题一直没明白,金币不多,但请多多指教啊,不甚感激!
背景:现在要分析一个未知环境的微生物多态,求其组成
我想请教下几个基本问题:
1.怎么在NCBI上查到细菌16S rDNA的所有通用引物?
2.通用引物最终选择哪一对呢?看到文献有很多对,各自的选择都不一样,一般选择根据什么依据呢?谢谢哈
3.怎么加GC序列,那个是自己用软件算吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

DGGE

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜: 金币+2, 鼓励热心应助 2012-04-01 17:37:11
年年年2011: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-05-03 10:33:49
引用回帖:
7楼: Originally posted by 年年年2011 at 2012-02-27 22:59:52:
恩,我打算先用这个扩全长,再用P0和P4扩V3区,只是不知道怎么算GC夹子,实在不行,就参考文献了

引物序列给你,直接在公司合成就可以。

细菌16S rDNA V3 region  194 bp
338F:5-CCT ACG GGA GGC AGC AG-3
518 R:5-ATT ACC GCG GCT GCT GG-3
GC338F:5-CGCCCGGGGCGCGCCCCGGGGCGGGGCGGGGGCGCGGGGGG CCT ACG GGA GGC AGC AG-3
9楼2012-04-01 10:33:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

firezhong

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
年年年2011(金币+1): 有帮助 谢谢你的帮助 2012-02-25 09:12:28
16SrDNA的通用引物可以用P0和P6,我们这边都这个做的。
2楼2012-02-25 08:26:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

年年年2011

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by firezhong at 2012-02-25 08:26:15:
16SrDNA的通用引物可以用P0和P6,我们这边都这个做的。

我是分析食品,看到也有文献选择27F和1492R,341F和518R,这个是怎么选择呢,你们也是做食品吗。谢谢,还有能不能给出P0和P6的具体序列,谢谢了
3楼2012-02-25 09:12:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

年年年2011

铜虫 (小有名气)

求高手解答,急急急!感谢
4楼2012-02-25 16:51:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化工专硕342,一志愿大连理工大学,求调剂 +5 kyf化工 2026-02-28 6/300 2026-03-02 10:45 by yuchj
[考研] 材料调剂 +6 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 7/350 2026-03-02 10:42 by Jy?
[考研] 求调剂 +6 yunziaaaaa 2026-03-01 7/350 2026-03-02 10:38 by @飒飒飒飒
[考研] 材料学硕318求调剂 +12 February_Feb 2026-03-01 14/700 2026-03-02 10:32 by 冠c哥
[考研] 0857调剂 +4 一ll半 2026-02-28 5/250 2026-03-02 02:33 by 908055542
[考研] 一志愿郑大材料学硕298分,求调剂 +5 wsl111 2026-03-01 5/250 2026-03-01 23:45 by 暮雨星晴
[考研] 江苏省农科院招调剂1名 +3 Qwertyuop 2026-03-01 3/150 2026-03-01 23:18 by aaadim
[考研] 265分求调剂不调专业和学校有行学上就 +6 礼堂丁真258 2026-02-28 8/400 2026-03-01 22:50 by jian_
[考研] 299求调剂 +3 Y墨明棋妙Y 2026-02-28 5/250 2026-03-01 21:01 by tangxiaotian
[考研] 272求调剂 +6 材紫有化 2026-02-28 6/300 2026-03-01 18:58 by 18137688336
[考研] 0856材料求调剂 +11 hyf hyf hyf 2026-02-28 12/600 2026-03-01 18:57 by 18137688336
[考研] 291分工科求调剂 +9 science饿饿 2026-03-01 10/500 2026-03-01 18:55 by 18137688336
[考研] 321求调剂一志愿东北林业大学材料与化工英二数二 +4 虫虫虫虫虫7 2026-03-01 7/350 2026-03-01 16:52 by caszguilin
[考研] 0856材料求调剂 +4 麻辣鱿鱼 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:51 by caszguilin
[考研] 285求调剂 +8 满头大汗的学生 2026-02-28 8/400 2026-03-01 16:47 by caszguilin
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[考研] 311求调剂 +9 南迦720 2026-02-28 10/500 2026-03-01 10:55 by sunny81
[论文投稿] Optics letters投稿被拒求助 30+3 luckyry 2026-02-26 4/200 2026-03-01 09:06 by babero
[考研] 085600材料工程一志愿中科大总分312求调剂 +8 吃宵夜1 2026-02-28 10/500 2026-02-28 20:27 by L135790
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
信息提示
请填处理意见