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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求助：DGGE新手，基本问题求助，请教各位高手
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年年年2011

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助：DGGE新手，基本问题求助，请教各位高手

各位大侠，才开始了解做DGGE，有些问题一直没明白，金币不多，但请多多指教啊，不甚感激！
背景：现在要分析一个未知环境的微生物多态，求其组成
我想请教下几个基本问题：
1.怎么在NCBI上查到细菌16S rDNA的所有通用引物？
2.通用引物最终选择哪一对呢？看到文献有很多对，各自的选择都不一样，一般选择根据什么依据呢？谢谢哈
3.怎么加GC序列，那个是自己用软件算吗？
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1楼 2012-02-24 22:32:45
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firezhong

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
年年年2011(金币+1): ★有帮助 谢谢你的帮助 2012-02-25 09:12:28
16SrDNA的通用引物可以用P0和P6，我们这边都这个做的。
赞一下 回复此楼
2楼2012-02-25 08:26:15
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firezhong

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

年年年2011(金币+1): ★有帮助 2012-02-27 23:01:13
27F和1492R就是P0和P6

我这边做微生物
应该其他引物也是可以测的
自己选一个做  测序是提供相同的引物就可以了
赞一下 回复此楼
5楼2012-02-27 08:24:21
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