应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白modelling找到活性变化的原因
71/1返回列表
查看: 2121  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

huiee

金虫 (正式写手)

[求助] 蛋白modelling找到活性变化的原因

为了验证或者改变目标蛋白的底物特异性，做了几个突变，hplc看到该酶的特异性有所变化，但是一个突变居然使其活性降低了至少10倍，我想通过蛋白modelling的方法来找出催化活性降低的原因。
请各位高手不吝指教。比如用啥软件来做modelling？如何预测ligand等等。
我的蛋白没有结晶，但是相同功能的蛋白已经有晶体结构。
谢谢！！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-12-29 01:54:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

amms_8

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以通过结构预测，然后再与底物进行对接，看突变后对它们相互作用的影响。
赞一下 回复此楼
2楼2011-12-29 08:43:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huiee

金虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by amms_8 at 2011-12-29 08:43:05:
可以通过结构预测，然后再与底物进行对接，看突变后对它们相互作用的影响。

谢谢 请问您能说具体点吗？用什么软件之类的！
非常感谢
赞一下 回复此楼
3楼2011-12-29 16:18:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

anquren

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking(金币+5): 楼主奖励！ 2011-12-29 18:00:10
有一本书叫《蛋白质结构预测实验指南》，介绍了各种软件，你可以参考一下。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-12-29 17:18:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

imyting

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
huiee(金币+5): ★★★很有帮助 2011-12-30 20:57:46
huiee(金币+1): DS是 docking server？ 2011-12-30 20:58:56
DS、PP软件可以用于点突变之后的模建，网上有同源模建swiss-model，但是它是根据序列同源性预测的，估计不会得到你想要的结果DS和PP虽然是收费的，但是也有破解版的，只是版本低点，但是在预测方面还是没有障碍的。可以一试……
赞一下 回复此楼
悠哉游哉做实验，成兮败兮我随便
5楼2011-12-30 13:17:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

imyting

至尊木虫 (正式写手)
内容已删除
回复此楼
悠哉游哉做实验，成兮败兮我随便
6楼2011-12-30 21:43:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hls85915

荣誉版主 (文坛精英)

科研工具版——沙漠之胡

优秀版主优秀版主
用discovery studio
赞一下 回复此楼
哈哈
7楼2011-12-30 21:59:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 huiee 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭