应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白modelling找到活性变化的原因
51/1返回列表
查看: 2006  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

huiee

金虫 (正式写手)

[求助] 蛋白modelling找到活性变化的原因

为了验证或者改变目标蛋白的底物特异性，做了几个突变，hplc看到该酶的特异性有所变化，但是一个突变居然使其活性降低了至少10倍，我想通过蛋白modelling的方法来找出催化活性降低的原因。
请各位高手不吝指教。比如用啥软件来做modelling？如何预测ligand等等。
我的蛋白没有结晶，但是相同功能的蛋白已经有晶体结构。
谢谢！！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-12-29 01:54:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

anquren

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking(金币+5): 楼主奖励！ 2011-12-29 18:00:10
有一本书叫《蛋白质结构预测实验指南》，介绍了各种软件，你可以参考一下。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-12-29 17:18:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

amms_8

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以通过结构预测，然后再与底物进行对接，看突变后对它们相互作用的影响。
赞一下 回复此楼
2楼2011-12-29 08:43:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huiee

金虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by amms_8 at 2011-12-29 08:43:05:
可以通过结构预测，然后再与底物进行对接，看突变后对它们相互作用的影响。

谢谢 请问您能说具体点吗？用什么软件之类的！
非常感谢
赞一下 回复此楼
3楼2011-12-29 16:18:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

imyting

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
huiee(金币+5): ★★★很有帮助 2011-12-30 20:57:46
huiee(金币+1): DS是 docking server？ 2011-12-30 20:58:56
DS、PP软件可以用于点突变之后的模建，网上有同源模建swiss-model，但是它是根据序列同源性预测的，估计不会得到你想要的结果DS和PP虽然是收费的，但是也有破解版的，只是版本低点，但是在预测方面还是没有障碍的。可以一试……
赞一下 回复此楼
悠哉游哉做实验，成兮败兮我随便
5楼2011-12-30 13:17:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +7 scalable 2026-08-24 7/350 2026-08-24 23:01 by anata1209
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +7 图啦图啦 2026-08-24 8/400 2026-08-24 22:00 by maomao_da
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤？
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 估计是周四 +4 archvillain 2026-08-18 4/200 2026-08-24 13:53 by zzuzxg
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +6 炎黄贵胄 2026-08-22 7/350 2026-08-24 11:58 by 6543yes
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 17/850 2026-08-24 10:20 by echo8914667
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭