24小时热门版块排行榜    

查看: 2064  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

huiee

金虫 (正式写手)

[求助] 蛋白modelling找到活性变化的原因

为了验证或者改变目标蛋白的底物特异性,做了几个突变,hplc看到该酶的特异性有所变化,但是一个突变居然使其活性降低了至少10倍,我想通过蛋白modelling的方法来找出催化活性降低的原因。
请各位高手不吝指教。比如用啥软件来做modelling?如何预测ligand等等。
我的蛋白没有结晶,但是相同功能的蛋白已经有晶体结构。
谢谢!!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

imyting

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
huiee(金币+5): ★★★很有帮助 2011-12-30 20:57:46
huiee(金币+1): DS是 docking server? 2011-12-30 20:58:56
DS、PP软件可以用于点突变之后的模建,网上有同源模建swiss-model,但是它是根据序列同源性预测的,估计不会得到你想要的结果DS和PP虽然是收费的,但是也有破解版的,只是版本低点,但是在预测方面还是没有障碍的。可以一试……
悠哉游哉做实验,成兮败兮我随便
5楼2011-12-30 13:17:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

amms_8

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以通过结构预测,然后再与底物进行对接,看突变后对它们相互作用的影响。
2楼2011-12-29 08:43:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huiee

金虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by amms_8 at 2011-12-29 08:43:05:
可以通过结构预测,然后再与底物进行对接,看突变后对它们相互作用的影响。

谢谢 请问您能说具体点吗?用什么软件之类的!
非常感谢
3楼2011-12-29 16:18:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

anquren

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking(金币+5): 楼主奖励! 2011-12-29 18:00:10
有一本书叫《蛋白质结构预测实验指南》,介绍了各种软件,你可以参考一下。
4楼2011-12-29 17:18:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 10/500 2026-09-02 11:35 by 大不刘6
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +8 瞬息宇宙 2026-08-31 15/750 2026-09-02 11:13 by ma0526
[基金申请] 我不理解! +18 Edward_pc 2026-08-26 26/1300 2026-09-02 11:01 by shanzhipu
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +4 瞬息宇宙 2026-09-01 8/400 2026-09-02 10:35 by 瞬息宇宙
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
信息提示
请填处理意见