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flytime1115

铜虫 (初入文坛)

[求助] 有木有人做过Taqman 探针法Real-Time??已有1人参与

我要检测基因组中插入的某个外源片段的拷贝数,需要做绝对定量。师兄建议不要用sybr 燃料做,建议用探针法做。现在毫无头绪,不知道怎么设计,怎么合成?望各位高人指点一下……
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sandisk411

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜(金币+5, MolEPI+1): Good! 2011-12-24 15:28:26
TaqMAN法和SYB法都可以用于检测拷贝数,关键是你能不能设计出合适的探针。用RT-PCR法鉴定拷贝数需要你对材料非常了解,比如是转基因T0代,如果是单拷贝的,插入目的基因与参考基因(基因组里单拷贝)的比值应是1:2;双拷贝的,就该是1:1;如果T1代,RT-PCR用于单株分析时,情况会很复杂,可以说你将无法准确判断,除非你已知是纯合的单株。
对于遗传背景不清楚的,你最好用SOURTHERN杂交确认,这是最可靠和简单的方法了。
要不,你可以尝试,把插入片段的左、右两边的序列给克隆测序。

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16楼2011-12-24 12:11:26
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love_st

金虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
设计引物探针,构建质粒,定量
2楼2011-12-22 16:45:28
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shaquila

金虫 (正式写手)

★ ★
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流。 2011-12-22 18:29:07
楼主做的是专基因检测吗?如果是,那不建议用荧光定量,主流的方法用SOUTHERN杂交。TAQMAN可以让公司设计合成,sybr法也能做,两种方法没有质变
3楼2011-12-22 18:04:14
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flytime1115

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by shaquila at 2011-12-22 18:04:14:
楼主做的是专基因检测吗?如果是,那不建议用荧光定量,主流的方法用SOUTHERN杂交。TAQMAN可以让公司设计合成,sybr法也能做,两种方法没有质变

是做转基因检测,southern杂交在做,可是无法确定拷贝数,仅仅根据灰度值判断,觉得不太靠谱
4楼2011-12-22 19:37:05
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