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求索寻觅

金虫 (小有名气)

[求助] 大家帮忙分析下双向电泳结果不好的原因(有图)

裂解液配方是:7M尿素,2M硫尿,4%CHAPS,0.3% Bio-lyte,65 mM DTT,加入了罗氏蛋白酶抑制剂。大鼠肝脏在液氮中研磨,大约0.1 g肝脏加入了1ML裂解液,然后冰浴超声了1分钟(就是放进去超声零点几秒然后拿出1秒,再放进去,搞了1分钟)。冰上裂解1h后,35000 g离心 90 min(这个转速已经是我们实验的极限了)。吸取上清做后续实验。
    测定了蛋白浓度大概为20mg/ml,水化时吸取了100ul 加入400ul 水化缓冲液(水化缓冲液配方和裂解液一致),上样450ul进行水化,我做的是24cm的胶条,ph 3-10。我做了三根胶条,2根在水化缓冲液家了DTT,第三根加了 TBP(据说TBP可以很好的解决碱性端横纹的问题)。水化了大概14h,然后进行等点聚焦。程序如下
   100v  缓慢 1h
   200v 缓慢 1h
   500v 缓慢  1h
  1000v 缓慢 1h
10000v 线性 4h
10000v 快速 100000v.H
500 v    快速  24h
   聚焦后用的gel胶为10%的,先用50v,再用200v跑完。
    结果如下图,分别为1,2,3,左边是正极端。请大家帮忙分析下原因,不甚感激。
ps:我已经做了几个月了,结果总这样差不多烂,别人论文里面也是这样,但是图谱上蛋白点多很多,也分散的均匀,实在想不明白。






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求索寻觅

金虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by zjkown at 2011-12-22 06:44:19:
碱性端聚焦不好; 100000V.H 好像有点多,可以尝试缩短聚焦V.H数。(缩短后有可能会造成酸性端又聚焦不够,所以可能需要找到平衡点)。 二向可以试试4-5%的浓缩胶+10-12%的分离胶。

第二向还能再用浓缩胶吗?能不能给点这方面的资料。谢谢你的建议。
5楼2011-12-30 22:27:46
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求索寻觅

金虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by Rubisco580 at 2011-12-22 16:35:41:
1.裂解液水化液不加 IPGBuffer?
2.上样量怎么那么大?我做的时候上200~300 ug,聚焦50000Vhrs。只有质谱的时候才上这么大量聚焦100000 Vhrs。
3.胶条行不行?有时候差的胶条聚焦是会不好的。
希望有帮助

我是准备做好了就挖点做质谱的,所以想把量加大点。
我的胶条是今年上半年买的,一直放在-20度保存,应该没什么问题。想麻烦您具体说下IPG Buffer,因为以前我和师兄做植物蛋白的时候,提取的蛋白是固体,就是用buffer溶解,而现在我做的动物组织蛋白,蛋白样品是在裂解液里,是液体,所以buffer就是裂解液配方大致相同了。
6楼2011-12-30 22:36:42
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