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zplipeng

金虫 (著名写手)


[交流] Western Blot实验的蛋白条带都连在一起

如题:
探测内参actin的时候,各个条带并不很浓,但都连在一起,看不出泳道来。
会是什么原因。
另:有时转膜会出现星星样的小点,布满整个凝胶。
    大分子量蛋白往往有转移不好的情况,虽然并不影响自己探测的蛋白。
以下附上WB的详细步骤:
1、        细胞总蛋白的提取
A、        用培养皿(10cm)或培养瓶(75cm2)将细胞(Hela或HepG2)培养至约80-90%的平铺率;
B、        倒去培养基,并用PBS冲洗2-3次;
C、        加入0.5-1ml胰酶,37℃消化3-10min;
D、        加入3mL无血清培养基终止消化反应,并用枪头反复吹打至细胞从培养壁上脱落;
E、        收集细胞悬液至15mL离心管中,1500rpm离心10min收集细胞体(约100uL体积大小);
F、        用500uL PBS重悬细胞并转移至1.5mL离心管中,3000-5000rpm离心5min收集细胞;
G、        弃去上清并用枪头吸干液体,加入50-200uL裂解液(RIPA已加入蛋白酶抑制剂),吹打均匀后,冰上放置20min,液氮反复冻融2-3次;
H、        14000×g离心15min,将上清收集到新的离心管中;
I、        以BSA为基准测定蛋白吸光度及浓度(约5-35mg/mL)。
2、        SDS-PAGE
A、        配置12%的分离胶(20mL)和3%的浓缩胶(10mL);
B、        用2×Loading buffer(15uL)与蛋白提取液(15uL)等体积混匀后,沸水浴中煮5-10min;
C、        每孔上样20uL样品,5uL预染蛋白Marker,没有样品的孔加入5uL 2×Loading buffer;
D、        调节电压100V(或先80V再120V)电泳90-120min;
E、        转膜的胶水中暂存,另一块可以直接染色(考马斯亮蓝染液中煮沸5-10min,脱色)。
3、        转膜
A、        用转膜缓冲液浸湿转膜器件(夹子、滤纸、垫片)并依次排好;
B、        将剪好的PVDF膜(0.45um)(比胶略大但比滤纸小)先在甲醇中浸湿(不超过15s),后覆盖在正极滤纸上;
C、        随后将胶覆盖在PVDF膜上;
D、        再放上一层滤纸后,用玻璃棒或15mL离心管赶出气泡;
E、        夹好夹子,放入转移槽,加满转移缓冲液;
F、        20V转移过夜,一块膜时电流大约为13-15mA,用的是六一的转移槽;
G、        转好的膜放入TBST缓冲液中。
4、        免疫印迹
A、        用TBST配置的5%脱脂奶封闭膜(4℃过夜或37℃ 1hr);
B、        用TBST配置的5%脱脂奶作为稀释液,加入一抗(1:300(β-actin)),37℃孵育1hr(或4℃过夜);
C、        TBST洗涤膜5min,2次,然后用TBST配置的5%脱脂奶作为稀释液,加入二抗(1:5000,牛抗兔二抗),37℃孵育1hr;
D、        TBST洗涤膜5min,2次,用于显色反应。
5、        发光反应
A、        加入一定量ECL(整块膜大约需要2.5-3mL的ECL混合液),将膜全部覆盖;
B、        5min后,移入暗室准备压片(光片剪角),视荧光强度选择压片时间;
C、        压片10s-2min,后分别显影(可在灯下观察显影强度,控制显影时间),定影(2min即可);
D、        膜保存在TBST中,可反复利用。

总蛋白SDS-PAGE后用考马斯亮蓝染色:可见泳道间扩散相连



actin的WB结果 连成一条线而看不出泳道



转膜后的凝胶用考马斯亮蓝染色 有时会出现星星样的点点



但大部分还是这种情况:90kD一下蛋白转移较好,而大分子量蛋白往往转移不好(20V overnight)



[ Last edited by zplipeng on 2011-12-8 at 14:34 ]
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cixinkejian

金虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
zplipeng(金币+1): 界面不好???这个可有办法解决? 2011-12-08 14:54:14
或许是因为配胶的时候,分离胶和浓缩胶的界面结合的不好造成的呢。
7楼2011-12-06 00:05:37
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vine010

银虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
zplipeng(金币+1): 蛋白量感觉也不多,因为最后的WB条带并不粗。我用的12%的分离胶。 2011-12-08 14:36:40
量加多了,胶的浓度是不是有问题。
5楼2011-12-05 16:30:26
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cuier124

金虫 (初入文坛)


★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
lstt09nk(金币+2): 感谢参与 2011-12-06 12:18:37
zplipeng(金币+1): 用的RIPA提取缓冲液,网上找的配方。您的意思是Loading buffer中溴酚蓝质量有问题还是量加的可能不对? 2011-12-08 14:38:38
zplipeng(金币+2): 我们的抗体是博奥森公司的(国产),1:1000的做过,出不来条带。ECL的量也有影响吗?个人觉得只要铺满整个膜是不是就可以了!转膜在300mA中转1.5h我也用过,效果也是如此。另外询问一个问题,您做过信号转导方面的东西,是不是磷酸化蛋白检测时需要的浓度时比较大的?我用非磷酸化抗体探测时可以探测到条带(也不粗),但是磷酸化蛋白的抗体总是探测不到条带,不知是真的没有表达,还是探测的问题。 2011-12-08 20:49:10
zplipeng(金币+5): 我们老板购买的Roche的蛋白酶抑制剂,他说他们做蛋白磷酸化就用这个,不用再加磷酸酶抑制剂。我表示怀疑。 2011-12-12 19:30:24
照你说的情况看,是你的蛋白样品在胶里扩散性太强了,所以可能是你样品制作的有问题吧,检查一下loading buffer的配制可有问题,特别使样品下沉的溴酚蓝;还有就是电泳时的电压和时间也会影响电泳结果;如果实验室的此实验条件不成熟,还要好好摸索啊,祝你好运!


我个人认为是Loading buffer中溴酚蓝的量的问题,质量有问题肯定也有影响;
从你的方法和图片看,个人认为:你actin抗体的浓度可能大了(我们实验室内参一抗浓度1:1000,当然具体要看抗体来源和说明),ECL的量和压片时间没把握好,导致你actin的WB显影结果连成一条线而看不出泳道;
转膜大分子转不过来应该是你转膜条件不佳(我们实验室是300mA冰中转1.5h)
你再查些资料看看问题到底在哪儿吧,祝好运!


我觉得磷酸化的蛋白是不太好检测,蛋白少信号弱可适当加大上样量,做磷酸化的蛋白RIPA一定要加磷酸酶抑制剂,我们的RIPA是购买的含磷酸酶抑制剂的,您自己配制也应该加进去

[ Last edited by cuier124 on 2011-12-12 at 09:13 ]
6楼2011-12-05 21:58:28
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晴天1882

木虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
zplipeng(金币+1): 请看图。谢谢! 2011-12-08 14:39:03
上个图,感觉问题有可能在电泳。
8楼2011-12-06 09:45:51
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