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xwxttt

银虫 (小有名气)

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注册: 2009-04-27
专业: 生物化学

[求助] 蛋白理论分子量和质朴分子量有差异

我用大肠杆菌表达的蛋白根据氨基酸序列去掉第一个Met后用http://web.expasy.org/cgi-bin/compute_pi/pi_tool的Compute pI/Mw
计算所得分子量比MALDI-TOF/TOF MS测出来的少了12Da
我检查了重组质粒的序列，并没有突变~~
请教一下可能的原因？
这是正常误差范围之内吗？
敬请指点~~~

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1楼 2011-11-28 10:52:08

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0624410024

金虫 (正式写手)

Begging for knowledge

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性别: GG
专业: 抗体工程学

【答案】应助回帖

计算的东西只能作为参考哈！个人感觉这个结果在误差范围之内！~个人意见~

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每天坚持多一点，以后困难少一点！

2楼2011-11-28 13:42:53

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chaijudi

至尊木虫 (著名写手)

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性别: MM
专业: 生物无机化学

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): 鼓励应助 2011-11-28 18:00:39

引用回帖:

1楼: Originally posted by xwxttt at 2011-11-28 10:52:08:
我用大肠杆菌表达的蛋白根据氨基酸序列去掉第一个Met后用http://web.expasy.org/cgi-bin/compute_pi/pi_tool的Compute pI/Mw
计算所得分子量比MALDI-TOF/TOF MS测出来的少了12Da
我检查了重组质粒的 ...

1200感觉差别太大了，我原来的一个蛋白质测过一个质谱，蛋白大小11KD，质谱给出的峰位有理论分子量的、有多几个缓冲离子的，还有不容易解释的峰！但差别也就是几十吧！
估计你的蛋白在表达过程中被某个酶剪切了几个氨基酸残基吧，猜测！

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3楼2011-11-28 17:36:21

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