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xwxttt

银虫 (小有名气)

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[求助] 蛋白理论分子量和质朴分子量有差异

我用大肠杆菌表达的蛋白根据氨基酸序列去掉第一个Met后用http://web.expasy.org/cgi-bin/compute_pi/pi_tool的Compute pI/Mw
计算所得分子量比MALDI-TOF/TOF MS测出来的少了12Da
我检查了重组质粒的序列，并没有突变~~
请教一下可能的原因？
这是正常误差范围之内吗？
敬请指点~~~

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1楼 2011-11-28 10:52:08

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chaijudi

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): 鼓励应助 2011-11-28 18:00:39

引用回帖:

1楼: Originally posted by xwxttt at 2011-11-28 10:52:08:
我用大肠杆菌表达的蛋白根据氨基酸序列去掉第一个Met后用http://web.expasy.org/cgi-bin/compute_pi/pi_tool的Compute pI/Mw
计算所得分子量比MALDI-TOF/TOF MS测出来的少了12Da
我检查了重组质粒的 ...

1200感觉差别太大了，我原来的一个蛋白质测过一个质谱，蛋白大小11KD，质谱给出的峰位有理论分子量的、有多几个缓冲离子的，还有不容易解释的峰！但差别也就是几十吧！
估计你的蛋白在表达过程中被某个酶剪切了几个氨基酸残基吧，猜测！