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如何克隆一个在小鼠、大鼠中序列已知,但在人未知的基因?
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hs2451
木虫
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如何克隆一个在小鼠、大鼠中序列已知,但在人未知的基因?
RT,请教各位大侠,用神马方法啊?
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中国是不朽的
1楼
2011-11-23 15:49:36
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凡子1985
银虫
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+3): 鼓励交流!对于两个序列都知道的物种,先用生物信息学的方法比对,省时省力。如果基因不大,用基因组DNA也可以了,cDNA涉及RNA提取和反转录,要麻烦些,成本也高些。 2011-11-23 20:44:16
wanhscn(金币+6, MolEPI+1): 完全正确,以cDNA模板为先,后再拿基因组序列,因为有可能内含子很大!授予专家指数! 2011-11-25 12:01:49
引用回帖:
4楼
:
Originally posted by
hs2451
at 2011-11-23 17:08:17:
谢谢您!还想请教下,可不可以分别将大小鼠的这个基因与人类的全基因组进行比对呢,这样能不能找出人类中的这个基因啊?或者,可以将大小鼠的同源性序列与人类基因组比对从而得到结果吗?麻烦了!
2楼是错误的 但凡能PCR出来的 你用序列比对 做电子克隆 就都知道了 何必去做这个实验呢 那都是后续的事情 你首先要做的 是比对出可能的序列来 而且 后续也不是以染色体基因组为模版 而是以cDNA为模版
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6楼
2011-11-23 19:55:39
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hs2451
木虫
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专业: 生物信息学
肿么木有大侠帮忙啊?
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中国是不朽的
2楼
2011-11-23 16:30:20
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lxj341401
至尊木虫
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【答案】应助回帖
★ ★ ★
西瓜(金币+3): Good! 2011-11-23 20:38:47
hs2451(金币+5): 谢谢帮助 2011-11-23 21:57:23
比较小鼠和大鼠中该基因的同源性,根据同源区设计引物,以人染色体为模板扩增获得该基因的部分片段,测序后做RACE获得全长基因。
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3楼
2011-11-23 16:52:37
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hs2451
木虫
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专业: 生物信息学
引用回帖:
3楼
:
Originally posted by
lxj341401
at 2011-11-23 16:52:37:
比较小鼠和大鼠中该基因的同源性,根据同源区设计引物,以人染色体为模板扩增获得该基因的部分片段,测序后做RACE获得全长基因。
谢谢您!还想请教下,可不可以分别将大小鼠的这个基因与人类的全基因组进行比对呢,这样能不能找出人类中的这个基因啊?或者,可以将大小鼠的同源性序列与人类基因组比对从而得到结果吗?麻烦了!
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中国是不朽的
4楼
2011-11-23 17:08:17
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