| ²é¿´: 773 | »Ø¸´: 2 | ||
shijipeiͳæ (³õÈëÎÄ̳)
|
[ÇóÖú]
namdÖиöÎļþ¶¼´æ´¢Ê²Ã´ÄÚÈݰ¡
|
| namdÖеÄpdb£¬psf£¬vel£¬coor£¬restar£¬xscµÈ¶¼´æ´¢Ê²Ã´ÐÅÏ¢°¡ |
» ²ÂÄãϲ»¶
0703×Ü·Ö331Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ6È˻ظ´
085600£¬321·ÖÇóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ7È˻ظ´
325Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ4È˻ظ´
085600£¬320·ÖÇóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ12È˻ظ´
Ò»Ö¾Ô¸0817»¯Ñ§¹¤³ÌÓë¼¼Êõ£¬Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ27È˻ظ´
Ò»Ö¾Ô¸±±¾©»¯¹¤085600 310·ÖÇóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ8È˻ظ´
Ò»Ö¾Ô¸¹þ¶û±õ¹¤Òµ´óѧ085600Ó¢Ò»Êý¶þ337·ÖÇóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ10È˻ظ´
22408Çóµ÷¼Á 354·Ö ¿É¿çרҵ
ÒѾÓÐ3È˻ظ´
277¹¤¿ÆÇóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ4È˻ظ´
Ò»Ö¾Ô¸»¦9£¬ÇóÉúÎïѧµ÷¼Á£¬326·Ö
ÒѾÓÐ3È˻ظ´
» ±¾Ö÷ÌâÏà¹Ø¼ÛÖµÌùÍÆ¼ö£¬¶ÔÄúͬÑùÓаïÖú:
NAMDµÄtopÎļþ¶Ô½á¹ûµÄÓ°Ïì
ÒѾÓÐ4È˻ظ´
namdÄÜÁ¿×îС»¯Íê³Éºó¸øÎÒµÄÊ®¼¸¸öÎļþÔõôûÓÐpdb¸ñʽµÄѽ
ÒѾÓÐ6È˻ظ´
¼ÈÈ»NAMDÊÇÄ£Äâ¶àëĵĽṹ£¬ÎªÊ²Ã´ÓÐÐèÒªÒ»¸öpdbÎļþ×÷ΪinputÄØ£¿
ÒѾÓÐ4È˻ظ´
ÔÚVMDÖÐÈçºÎ°Ñ·Ö×Ó¹¹ÐÍ´æ³ÉͼƬ¸ñʽ
ÒѾÓÐ5È˻ظ´
NAMD°²×°ÖеÄnanotubes.confÎļþÈçºÎ±àд
ÒѾÓÐ3È˻ظ´
ÇóÖúnamdµÄÅäÖÃÎļþµÄÐ޸ģ¬Ö÷ÒªÊÇÈçºÎÌí¼ÓÔ¼Êø
ÒѾÓÐ5È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿ÔÚNAMDÔËÐÐÖÐʹÓÃCHARMM¸ñʽµÄÁ¦³¡Îļþ£¬µ«Á¦³¡²ÎÊýÀ´×ÔAMBERÁ¦³¡£¬»á³öÎÊÌâÂ
ÒѾÓÐ4È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿NAMDºÍVMDÁªÓÃÈçºÎ²úÉúligandµÄtopologyºÍparameterÎļþ
ÒѾÓÐ8È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿ÈõÎÊ£ºÔõÑù²ÅÄÜÒÆÖ²MSµÄPDBÎļþµ½NAMDÖÐ
ÒѾÓÐ4È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿Ö»ÊÇÓÅ»¯ºóÎļþ£¬Ã»ÓÐrestartÎļþ£¬ÄܼÌÐøÅÜÂð
ÒѾÓÐ22È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿namdºÍvmd¾ÍÖ»ÄÜʶ±ð.pdb.psf.coor.velµÈÎļþÂð
ÒѾÓÐ6È˻ظ´

loudonghua
Òø³æ (³õÈëÎÄ̳)
- Ä£ÄâEPI: 1
- Ó¦Öú: 9 (Ó×¶ùÔ°)
- ½ð±Ò: 496.8
- ºì»¨: 2
- Ìû×Ó: 30
- ÔÚÏß: 101.5Сʱ
- ³æºÅ: 1229268
- ×¢²á: 2011-03-11
- רҵ: ¸ß·Ö×ÓÎïÀíÓë¸ß·Ö×ÓÎïÀí»¯
¡¾´ð°¸¡¿Ó¦Öú»ØÌû
¡ï ¡ï
ghcacj(½ð±Ò+2): лл 2011-10-26 10:57:15
shijipei(½ð±Ò+5): лл 2011-10-26 15:59:14
ghcacj(½ð±Ò+2): лл 2011-10-26 10:57:15
shijipei(½ð±Ò+5): лл 2011-10-26 15:59:14
| pdbÎļþ´æ´¢µÄÊÇÔ×ÓµÄÃû³Æ£¬ËùÔڲлùÒÔ¼°Ô×ÓµÄ×ø±ê£¬psfÊÇÔ×ӵļüÁ¬ÐÅÏ¢£¬velÊÇ´æ´¢Ô×ÓµÄËÙ¶ÈÐÅÏ¢...£¬½¨ÒéÄã¿´Ò»¿´namd-tutorialµÄ¸½Â¼ |
2Â¥2011-10-26 09:59:00
cuiyoutian88
½ð³æ (СÓÐÃûÆø)
- Ó¦Öú: 3 (Ó×¶ùÔ°)
- ½ð±Ò: 890.1
- É¢½ð: 27
- Ìû×Ó: 262
- ÔÚÏß: 198.5Сʱ
- ³æºÅ: 1193813
- ×¢²á: 2011-01-21
- ÐÔ±ð: GG
- רҵ: ÉúÎﻯѧ
¡ï
ghcacj(½ð±Ò+1): лл 2011-11-03 09:42:53
ghcacj(½ð±Ò+1): лл 2011-11-03 09:42:53
| È¥¹ÙÍøÉÏÏÂÔØtutorial£¬ÀïÃæÓи½Â¼ËµÃ÷ |
3Â¥2011-11-02 22:43:36














»Ø¸´´ËÂ¥