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NAMD的top文件对结果的影响
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NAMD计算环糊精的衍生物以及小分子的包和作用 当中环糊精衍生物的top文件听说需要自己构建 看了官方给的new force field文档 当中对于构建过程也还是不太清除 现在有一个问题 对于自己构建的top文件，他的精确度对于后续结果的影响有多大？ 是不是top文件只是给定一个初始构象 具体的还要在NAMD当中再优化？ |
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