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xiaoyingw金虫 (小有名气)
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[求助]
VMD 统计某个分子周围水分子数目随时间的变化
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| 请问大家，VMD 怎么统计某个分子10埃范围内水分子数目随时间的变化？ |
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9楼2014-09-25 20:09:18
liqingwen
木虫 (正式写手)
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+5): 谢谢 2011-10-18 20:15:17
xiaoyingw(金币+20): 2011-10-19 11:15:00
御剑江湖(金币+5): 谢谢 2011-10-18 20:15:17
xiaoyingw(金币+20): 2011-10-19 11:15:00
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试试这个脚本吧： set outfile [open ***.dat w]; set nf [molinfo top get numframes] for { set i 1 } { $i<=$nf } { incr i 1} { set atom [atomselect top "该分子10A以内的水分子"] $atom frame $i $atom update set com [$atom num] puts $outfile "$i $com" } close $outfile |
2楼2011-10-18 18:10:54
wally8962
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3楼2011-10-19 09:36:46
xiaoyingw
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4楼2011-10-19 11:14:47
