| 查看: 4039 | 回复: 9 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
xiaoyingw金虫 (小有名气)
|
[求助]
VMD 统计某个分子周围水分子数目随时间的变化
|
|||
| 请问大家，VMD 怎么统计某个分子10埃范围内水分子数目随时间的变化？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 编程 | VMD 可视化软件 |
» 猜你喜欢
磺酰氟产物，毕不了业了！
已经有4人回复
-
论文终于录用啦！满足毕业条件了
已经有16人回复
-
求个博导看看
已经有19人回复
-
投稿Elsevier的杂志（返修），总是在选择OA和subscription界面被踢皮球
已经有8人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 微量紫外测DNA OD260\OD280的比值
已经有8人回复
- 公司返回的双向测通的序列个人如何拼接啊？
已经有9人回复
- T7载体的IPTG诱导
已经有10人回复
- ds中的分子优化
已经有5人回复
- 用Multiwfn、Gaussview、Molekel、VMD观看龙虾、盆景、骨盆、大脑
已经有16人回复
- [求助]有没有比不锈钢更硬的高分子材料
已经有7人回复
- 半年的平板 摇不起来了怎么办啊 急急急
已经有8人回复
- 质谱确定分子量正确但打氢谱时却无样品峰
已经有10人回复
- 想问下双螺杆挤出和密炼机的原理是什么？
已经有5人回复
- 如何从已知细胞中P出某个基因，并加上酶切位点？
已经有8人回复
- 原核表达问题
已经有14人回复
nnipp
金虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1003.5
- 散金: 16
- 红花: 3
- 帖子: 172
- 在线: 234.5小时
- 虫号: 376554
- 注册: 2007-05-19
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
8楼2011-11-30 10:28:38
liqingwen
木虫 (正式写手)
独行者
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1272.9
- 散金: 121
- 红花: 3
- 帖子: 406
- 在线: 156.6小时
- 虫号: 777960
- 注册: 2009-05-23
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+5): 谢谢 2011-10-18 20:15:17
xiaoyingw(金币+20): 2011-10-19 11:15:00
御剑江湖(金币+5): 谢谢 2011-10-18 20:15:17
xiaoyingw(金币+20): 2011-10-19 11:15:00
|
试试这个脚本吧： set outfile [open ***.dat w]; set nf [molinfo top get numframes] for { set i 1 } { $i<=$nf } { incr i 1} { set atom [atomselect top "该分子10A以内的水分子"] $atom frame $i $atom update set com [$atom num] puts $outfile "$i $com" } close $outfile |
2楼2011-10-18 18:10:54
wally8962
木虫 (著名写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 5366.7
- 红花: 2
- 帖子: 1062
- 在线: 471.1小时
- 虫号: 600024
- 注册: 2008-09-12
- 性别: GG
- 专业: 生物力学
3楼2011-10-19 09:36:46
xiaoyingw
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 959.1
- 散金: 146
- 帖子: 299
- 在线: 68.5小时
- 虫号: 738649
- 注册: 2009-04-02
- 性别: MM
- 专业: 生物物理化学
4楼2011-10-19 11:14:47