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zaasyangyong

金虫 (正式写手)

[求助] 一个关于水稻基因图位克隆的问题诚挚恳求大牛解答

一个关于水稻基因图位克隆的问题诚挚恳求大牛解答

我在做一个类病变突变体的基因图位克隆。

首先,突变体和它的野生型杂交确定显隐性,F2分离群体内 突变型:野生型=1:3,卡方检测差异不显著,说明单基因隐性;

接着,用突变体和籼稻9311杂交,选F2有限群体进行粗定位,结果问题来了。选了突变型50个单株,无突变表型28个单株。全基因组筛到一个标记,在50个突变群体内,突变体的带型:9311的带型:杂合带型=40:1:9。感觉应该和这个标记有连锁。然而,在28个无突变表型群体内,突变体的带型:9311的带型:杂合带型=11:6:11。开始怀疑是不是单株取错了,又取了一批叶片,结果还是突变体的带型很多,和突变群体内的比例完全不是一个类型的趋势。

真是百思不得其解,恳求大牛解答,到底是肿么回事啊?
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算了
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zaasyangyong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
jhu132llh(金币+3, APEPI+1): good,感谢积极应助,很专业 2011-10-09 19:05:30
引用回帖:
5楼: Originally posted by qiafeixn at 2011-10-07 08:50:54:
1.抗病性是如何鉴定的?
2.标记用的什么方法?
3.经典遗传学上的“单基因隐性”和DNA序列水平上的基因不总是一一对应的。你有必要先弄清楚抗性形成的机制,才能解释你的结果。

谢谢赐教

1.不是做的抗性,辐射导致的直接类病变的表型,即像锈斑一样的,过敏性反应类似的表型。

2. 水稻的SSR标记。

3.关于抗性机制的问题,现在很多已克隆到基因的类病变突变体也不是太清楚;我想如果拿到基因的话,机制可能会略知一二。我是通过图位克隆来拿目的基因,那么图位克隆,一上来就是我前述的结果。这样,用机制来解释遗传结果,联合遗传来图位克隆目的基因,联合基因来探讨机制,好像是个圈啊。
算了
6楼2011-10-07 17:11:13
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zaasyangyong

金虫 (正式写手)

怎么没人说话啊?
算了
2楼2011-10-04 22:05:41
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zaasyangyong

金虫 (正式写手)

怎么没人来说说啊?
算了
3楼2011-10-05 21:49:49
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jhu132llh

荣誉版主 (知名作家)

大洪

国庆了
可能高人不在
在等等吧
青春的岁月,我们身不由己,只因这胸中燃烧的梦想!
4楼2011-10-06 18:35:10
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