| 查看: 2127 | 回复: 7 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
AUTODOCK对接步骤求助(附图）
|
|||
|
最近学习AUTODOCK软件的使用，遇到以下几个问题： 1.大分子和小分子相隔太远，所建盒子无法把两者都包括到一起。如图1. 2.完成自动对接前的dpf文件设置后，进行对接。弹出下图2，无法完成对接。想通过Browse按钮进行改变，结果根本找不到相应的dpf文件。（包括前几步在内,每次设置好的文件图标都如图3所示）。    [ Last edited by 可米kemi on 2011-9-5 at 23:08 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子对接 |
» 猜你喜欢
化学308分求调剂
已经有17人回复
-
机械专硕273请求调剂
已经有4人回复
-
266求调剂
已经有12人回复
-
0703化学调剂 348分
已经有11人回复
-
293调剂
已经有11人回复
-
电子信息270求调剂
已经有7人回复
-
263求调剂
已经有5人回复
-
一志愿华南师范361分，化学求调剂
已经有8人回复
-
材料307分求大佬组收留
已经有8人回复
-
化学调剂求助
已经有9人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Run-autodock步骤求助
已经有6人回复
- 用AutoDock对接的结合能较小，可能是什么原因？
已经有7人回复
- 用AutoDock作分子对接前的小分子能量最小化问题
已经有6人回复
- Autodock对接构象有问题，请教
已经有7人回复
- 【求助】请教Autodock结果分析
已经有8人回复
- 【求助】Autodock分析请教
已经有17人回复
- 【求助】高手求助,Autodock4 最后一步无法对接,弄了几天!
已经有7人回复
- 【求助】autodock计算的结果重复性不好
已经有9人回复
- 【求助】用autodock做对接，请问里面格子大小及其中心的选择依据
已经有9人回复
- 【求助】急！autodock在windows下怎么进行对接啊？
已经有11人回复
- 【求助】autodock对接后小分子被打断的情况
已经有6人回复
- 【求助】能够计算结合自由能的分子对接软件除了autodock还有哪些？
已经有7人回复
- 【求助】AUTODOCK的一个问题
已经有6人回复
PSA
专家顾问 (著名写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 41 (小学生)
- 贵宾: 0.287
- 金币: 6557.6
- 散金: 1295
- 红花: 10
- 沙发: 2
- 帖子: 1157
- 在线: 392.7小时
- 虫号: 685572
- 注册: 2008-12-31
- 专业: 药物化学
- 管辖: 生物医药区
【答案】应助回帖
★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-09-07 14:30:08
可米kemi(金币+5): 这样，那个目标路径应该在documents and settings还是在python25里呢？谢谢。 2011-09-08 09:27:48
可米kemi(金币+10): 多谢指导，我按照你说的果然有效。然后，第一个问题，我拿事先用GAUSSIAN计算过的分子带进去算也解决了。 2011-09-14 08:51:09
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-09-07 14:30:08
可米kemi(金币+5): 这样，那个目标路径应该在documents and settings还是在python25里呢？谢谢。 2011-09-08 09:27:48
可米kemi(金币+10): 多谢指导，我按照你说的果然有效。然后，第一个问题，我拿事先用GAUSSIAN计算过的分子带进去算也解决了。 2011-09-14 08:51:09
|
按照我的一点点经验，你的路径有问题，我认为。 启动ADT要在目标路径里，而不是通过快捷方式，而且你所用的受体配体文件等所有准备文件也要在这个路径里的 希望对你有所提示 |
4楼2011-09-06 16:18:35
2楼2011-09-06 09:02:59
3楼2011-09-06 09:11:20
5楼2011-09-14 08:58:29
