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[求助]
AUTODOCK对接步骤求助(附图）
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最近学习AUTODOCK软件的使用，遇到以下几个问题： 1.大分子和小分子相隔太远，所建盒子无法把两者都包括到一起。如图1. 2.完成自动对接前的dpf文件设置后，进行对接。弹出下图2，无法完成对接。想通过Browse按钮进行改变，结果根本找不到相应的dpf文件。（包括前几步在内,每次设置好的文件图标都如图3所示）。    [ Last edited by 可米kemi on 2011-9-5 at 23:08 ] |
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 分子对接 |
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2楼2011-09-06 09:02:59
3楼2011-09-06 09:11:20
PSA
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【答案】应助回帖
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ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-09-07 14:30:08
可米kemi(金币+5): 这样，那个目标路径应该在documents and settings还是在python25里呢？谢谢。 2011-09-08 09:27:48
可米kemi(金币+10): 多谢指导，我按照你说的果然有效。然后，第一个问题，我拿事先用GAUSSIAN计算过的分子带进去算也解决了。 2011-09-14 08:51:09
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-09-07 14:30:08
可米kemi(金币+5): 这样，那个目标路径应该在documents and settings还是在python25里呢？谢谢。 2011-09-08 09:27:48
可米kemi(金币+10): 多谢指导，我按照你说的果然有效。然后，第一个问题，我拿事先用GAUSSIAN计算过的分子带进去算也解决了。 2011-09-14 08:51:09
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按照我的一点点经验，你的路径有问题，我认为。 启动ADT要在目标路径里，而不是通过快捷方式，而且你所用的受体配体文件等所有准备文件也要在这个路径里的 希望对你有所提示 |
4楼2011-09-06 16:18:35
5楼2011-09-14 08:58:29
huang0106
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