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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » AUTODOCK对接步骤求助(附图）
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可米kemi

银虫 (小有名气)

[求助] AUTODOCK对接步骤求助(附图）

最近学习AUTODOCK软件的使用，遇到以下几个问题：
    1.大分子和小分子相隔太远，所建盒子无法把两者都包括到一起。如图1.
       2.完成自动对接前的dpf文件设置后，进行对接。弹出下图2，无法完成对接。想通过Browse按钮进行改变，结果根本找不到相应的dpf文件。（包括前几步在内,每次设置好的文件图标都如图3所示）。






[ Last edited by 可米kemi on 2011-9-5 at 23:08 ]
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1楼 2011-09-05 22:12:20
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可米kemi

银虫 (小有名气)
自己顶起，坐等高手解答。
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2楼2011-09-06 09:02:59
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可米kemi

银虫 (小有名气)
可是，虽然路径是找到了，可是点击launch,进行自动对接，会跳出：
autodock4:can,t create log file E:\Python25\Lib\site-packages\MGLTOOLSPckgs\AutoDockTOOLS\BIN\CD-FLUS.dlg
请问，这又是怎么回事呢？
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5楼2011-09-14 08:58:29
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可米kemi

银虫 (小有名气)
谢谢，各位的帮忙，我已经知道原因了。相同条件下，我拿我同学那里就可以。估计应该是之前在学习AUTODOCK的时候，对这个软件装了又拆，拆了又装，在C盘里可能某个地方还有残留，不兼容。
    所以，借下来考虑的是：要不，心一狠，电脑重装；要不借其他电脑安装了。
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7楼2011-09-15 20:58:50
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