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永不后悔2838

铁虫 (小有名气)

[交流] 为什么提取的DNA总是降解?已有27人参与

各位大侠,为什么我提取的DNA总是降解呢?用的是传统的苯酚-氯仿抽提的方法,最后一步加入冰乙醇沉淀的时候能看到大量的絮状沉淀,TE溶解过夜,琼脂糖胶检测时条带却是这样(如图)。分光光度计检测浓度和纯度都正常。实验室几个人提取都是这样,不知道是什么原因,所用的试剂已经重新配过,还是这个结果。请问有没有遇到过类似情况的,这是什么原因,怎么解决呢?请大家指点帮助~


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adslye

银虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
看天(金币+4): 鼓励回答 2011-08-18 23:50:56
gDNA降解无非两个原因:
1.细胞内DNA酶作用于gDNA,你的材料在放入提取液前没有在细胞破碎的情况下放久吧?
2.机械力作用:有很剧烈的长时间涡旋吗?或者之类的。但一般也不会有事。

另外,至于PH,水饱和酚(PH4)条件下,gDNA溶于有机相,应该提不出来。TRIS饱和酚,如果过期也是蛋白除不尽。我觉得应该不是酚的问题。

我看你第二张图最后一孔gDNA正常,没降解。是同同批次,同操作吗?如果是,说明操作失误。

我的解决方法是:不要再去想了(这个实验真的很难做出降解)。换一个方法,买一个kit,gDNA提取试剂盒很便宜的。
6楼2011-08-18 19:14:12
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silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
注意你酚氯仿的PH值
2楼2011-08-18 14:27:01
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永不后悔2838

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
1楼: Originally posted by 永不后悔2838 at 2011-08-18 14:25:07:
各位大侠,为什么我提取的DNA总是降解呢?用的是传统的苯酚-氯仿抽提的方法,最后一步加入冰乙醇沉淀的时候能看到大量的絮状沉淀,TE溶解过夜,琼脂糖胶检测时条带却是这样(如图)。分光光度计检测浓度和纯度都正 ...

非常感谢,那个都是从公司买的,而且也换过不同的,结果还一样,请问还有别的可能吗?
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3楼2011-08-18 17:38:06
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永不后悔2838

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by silicare at 2011-08-18 14:27:01:
注意你酚氯仿的PH值

非常感谢,那个都是从公司买的,而且也换过不同的,结果还一样,请问还有别的可能吗?
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4楼2011-08-18 17:39:01
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