24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2258  |  回复: 14

曹艳辉

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】为什么内切酶总是切不开我的DNA 已有11人参与

为什么内切酶总是切不开我的DNA,我用了好多种酶进行酶切,但是最后还是切不开,是怎么回事啊?请哪位高手指点一下。
回复此楼
KAMA-what done is done!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong1981

金虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
很多也切不动?你水有没有问题啊,再有,你DNA是什么?质粒?基因组?说不清无真相~
2楼2010-05-31 11:10:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

goodwish

木虫 (正式写手)

木虫书呆子


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
说清楚一点,这样没法回答。你用的是什么样的DNA,从哪儿的来的,酶是什么牌子的。
生命的海洋里,我是蓝色的一滴
3楼2010-05-31 11:16:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jasco

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
9494,什么dna,怎么得到的,用什么酶,怎么切的。。。。。
4楼2010-05-31 11:31:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fungixx

至尊木虫 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
不太明确啊,切质粒还是基因组。。。。
几年前踏上火车那一刻都还没有意识到,从此故乡只有冬夏,再无春秋
5楼2010-05-31 11:33:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ququr008

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+4):good! 2010-05-31 12:50:34
影响因素很多:

下面是一道考研题及答案,请参考。

影响限制性内切核酸酶活性的因素

1 DNA纯度
在DNA样品中若含有蛋白质,或没有去除干净制备过程中所用的乙醇、EDTA、SDS、酚、氯仿和某些高浓度金属离子,均会降低限制酶的催化活性,甚至使限制酶不起作用。

2 核酸内切限制酶的缓冲液
核酸内切限制酶的标准缓冲液包括氯化镁、氯化钠或氯化钾、Tris-HCL、巯基乙醇或二硫苏糖醇(DTT)以及牛血清白蛋白(BSA)等。
使用所有限制酶均可发挥活性的一种缓冲液。
不同限制性内切酶对NaCl浓度的要求不同,这是不同限制酶缓冲液组成上的一个主要的不同。据此可分为高盐、中盐和低盐缓冲液,在进行双酶解或多酶解时,若这些酶切割可在同种缓冲液中作用良好,则几种酶可同时酶切;若这些酶所要求的缓冲液有所不同,可采用以下三种方法进行消化反应:先用要求低盐缓冲液的限制性内切酶消化DNA,然后补足适量的NaCl,再用要求高盐缓冲液的限制酶消化;
先用一种酶进行酶解,然后用乙醇沉淀酶解产物,再重悬于另一缓冲液中进行第二次酶解。

3 酶切消化反应的温度
DNA消化反应的温度,是影响限制内切酶活性的一个重要因素。不同的核酸内切限制酶,具有各自的最适反应温度。多数限制内切酶的最适反应温度是37℃,少数限制性内切酶的最适反应温度高于或低于37℃。

4 DNA的分子结构
DNA分子构型对核酸内切限制酶的活性有很大影响,如消化超螺旋的DNA比消化线性DNA用酶量要高出许多倍。
有些限制酶在消化它们自己的处于不同部位的限制位点,其效率也有明显差异。
限制性内切酶反应的终止 通常是采用65℃条件下温浴5min;
加终止反应液(如0.5mol/L的EDTA使之在溶液中的终浓度达到10 mol/L)螯合Mg2+,以终止反应。
6楼2010-05-31 12:13:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天空与飞鸟

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
长见识了
7楼2010-05-31 13:04:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

曹艳辉

新虫 (初入文坛)

首先谢谢各位好心人了!我是用苯酚氯仿混合抽提两次,-20度无水乙醇沉淀一小时,75%乙醇再沉淀,用双蒸水悬浮的染色体,我的基因组是放线菌的,最终提取的基因组蛋白质含量很高,怎样才能降解这些蛋白质啊?
KAMA-what done is done!
8楼2010-05-31 13:24:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ben1147

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
scelab(金币+5):正解~~~ 2010-05-31 22:36:07
引用回帖:
Originally posted by 曹艳辉 at 2010-05-31 13:24:31:
首先谢谢各位好心人了!我是用苯酚氯仿混合抽提两次,-20度无水乙醇沉淀一小时,75%乙醇再沉淀,用双蒸水悬浮的染色体,我的基因组是放线菌的,最终提取的基因组蛋白质含量很高,怎样才能降解这些蛋白质啊?

氯仿抽提两次怎么会还有很多蛋白呢?吸上清的时候吸到中间层了?

酚:氯仿抽提完以后要拿氯仿单独抽一次,把水相中残余的酚抽提掉(苯酚微溶于水)

如果确认样品里蛋白多的话,用蛋白酶K消化一下,再用酚氯仿、氯仿抽提。

感觉提DNA的步骤可能有问题,不应该有这么多蛋白的。前面提取的步骤里有没有用溶菌酶或者蛋白酶?

另外乙醇沉淀以后75%乙醇洗的时候尽量把沉淀悬起来,再多泡一会,还可以洗两次,每次都要把上次残余的液体吸干净,尽量把盐离子除的干净一点,防止影响酶切体系的离子浓度

[ Last edited by ben1147 on 2010-5-31 at 15:24 ]
9楼2010-05-31 15:21:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yedwill

新虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
建议先用蛋白酶消化后再纯化后酶切
10楼2010-05-31 15:22:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 曹艳辉 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 某211大学教师把个人教师官方主页改成:我跑了我跑了我跑了!官宣跑路! +4 zju2000 2026-05-21 5/250 2026-05-24 09:35 by songwz
[考博] 26/27申博自荐 10+4 ZXW0202 2026-05-22 9/450 2026-05-24 08:47 by bjvtcliu
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 hvkbtfonbv 2026-05-23 3/150 2026-05-24 08:01 by 9ps9vgkqva
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 pmo95bazuy 2026-05-23 7/350 2026-05-24 06:35 by fpo5ljpv91
[基金申请] 河北省自然科学基金 +5 Peterchao 2026-05-18 7/350 2026-05-23 16:57 by articlefan
[基金申请] 揭秘青基评审内幕:几个A才能顺利中标 +3 国自然国社科中 2026-05-23 4/200 2026-05-23 15:37 by 2000zf36392
[基金申请] 青B发送上会通知了吗 +5 chemBioBro 2026-05-22 7/350 2026-05-23 12:35 by zhuifengzhy
[考博] 博士申请 +3 焦晓明 2026-05-21 3/150 2026-05-23 11:26 by mlc840311
[论文投稿] 投稿求助,期刊 +4 希冀,有书读 2026-05-20 8/400 2026-05-22 10:16 by 希冀,有书读
[文学芳草园] 献血感触 +7 呀呀好傻 2026-05-19 13/650 2026-05-21 20:15 by 呀呀好傻
[基金申请] 面上本子正文33页,违规吗?会被低分嘛? +14 1234567wang 2026-05-17 16/800 2026-05-21 17:58 by 脆脆的饼干
[基金申请] 国自然评分 +4 无名者登山 2026-05-20 5/250 2026-05-21 16:35 by swuq
[基金申请] 国自然上会要求 +7 无名者登山 2026-05-18 11/550 2026-05-21 15:50 by draco1987
[基金申请] 提交了我也来说说感想 +9 fummck 2026-05-20 10/500 2026-05-21 14:17 by draco1987
[基金申请] 评审有感 +15 popular289 2026-05-18 26/1300 2026-05-21 10:35 by 西葫芦炒鸡蛋
[考博] 云南大学材料与能源学院解琳课题组钙钛矿博士招生 +4 光伏爱好者 2026-05-17 6/300 2026-05-21 01:37 by 17520222914
[有机交流] 反应很差,大量原料没有反应 5+3 Mr.Zot 2026-05-19 8/400 2026-05-20 22:19 by Equinoxhua
[考博] 如果工作了想读博,可以边工作边读全日制嘛? 30+3 铁达火车 2026-05-18 5/250 2026-05-20 09:33 by tfang
[考博] 博士申请 +5 星…… 2026-05-18 6/300 2026-05-18 23:49 by 糊糊涂涂好
[硕博家园] 我在等一个没有答案的答案 +3 Love_MH 2026-05-17 3/150 2026-05-18 02:22 by 竹林孤影
信息提示
请填处理意见