24小时热门版块排行榜    

查看: 879  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

flowers123

银虫 (小有名气)

[求助] 求助:关于二聚体的单点能

我前最近在算一个二聚体的单点能,用z-矩阵写的坐标,发现计算单体能量时,加不加nosymm,结果一样;但是计算总能量时,加了nosymm就低一点。
1、无论怎么调坐标总能量都是这两个值没有变化。
2、发现计算单体时,用笛卡尔坐标跟z矩阵还不一样呢!
3、是二聚体本来就是这样,还是我写错了。苦查资料没有结果,希望明白人指导一下。
提前致谢,稍后奉上金币!

[ Last edited by gmy1990 on 2011-7-11 at 18:14 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

盼望长成一只小菜鸟......
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mchen10

金虫 (正式写手)

★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-07-13 08:38:40
0.3 kca/mol很小了,差不多可以忽略(很多情况下)
可以提高收敛标准试试
更痛苦的是梦没醒路已经不能走了
6楼2011-07-13 04:29:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-07-11 22:27:52
flowers123(金币+5): 2011-07-12 20:30:40
虽然你的问题说明不够详细,但我看你对二聚体的单点能的计算还是对的。

计算单体能量时,加不加nosymm,结果应是一样的。

不加nosymm,是从分析分子的对称性从而减少一些计算量。加nosymm,无非是多了些重复计算而已,结果是一样的。些微的差别,是重复计算并不会完全对等,误差累积的结果。
3楼2011-07-11 22:10:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独唱团

金虫 (正式写手)

你说能量不一样,到底差多少,几电子伏?
4楼2011-07-12 03:40:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

flowers123

银虫 (小有名气)

其实差别还是很大的,用dz计算总能量加了nosymm之后比不加nosymm低了0.0005hatree,看起来不是很大,但是对结合能的影响非常明显达到10%!
我想问的是,二聚体计算总能量是不是都存在这个问题呢?
如果坐标写的不太对的话,修改坐标应该能是加不加nosymm的能量逐渐接近的吧,可是我的总能量一直保持这两个值不变。应该说明,我的坐标写的是正确的吧?
不好意思,麻烦各位帮我在分析一下,我明白之后,一定如数奉上金币。拜谢!
特别感谢zhou2009大侠,我下载过你提供的不少资料,在此一并谢过。
盼望长成一只小菜鸟......
5楼2011-07-12 20:45:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:03 by l0VvVHGBGRLv
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:03 by l0VvVHGBGRLv
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:02 by l0VvVHGBGRLv
[公派出国] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 11:32 by l0VvVHGBGRLv
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-30 11:18 by l0VvVHGBGRLv
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 07:28 by ZPa0EcMwuECS
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 11/550 2026-08-30 06:00 by ZPa0EcMwuECS
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 13/650 2026-08-30 05:38 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 01:58 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-30 01:03 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +4 tannykie 2026-08-29 4/200 2026-08-29 17:14 by lmz0216
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
信息提示
请填处理意见