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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】内标的引物内是否允许二聚体?
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biofeixue

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】内标的引物内是否允许二聚体?

最近看了一篇影响因子为11的文章,里面的引物是有两个错误,为什么可以这样?
The TUB2 (for ß-tubulin) gene was used as an internal control in RT-PCR.
Sense： 5’-GTTCTCGATGTTGTTCGTAAG-3’   
Anti： 5’-TGTAAGGCTCAACCACAGTAT-3’




[ Last edited by biofeixue on 2011-4-5 at 06:18 ]
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1楼 2011-04-05 06:05:29
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jiangzhiang

铁杆木虫 (正式写手)
★
1949stone(金币+1): 似的 有些时候的确是藏着不告诉 2011-04-05 11:35:54
biofeixue(金币+2): 2011-04-06 05:40:11
能扩出来就是好引物当然不排除是不想告诉读者
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2楼2011-04-05 09:54:35
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★
1949stone(金币+6): 高人 2011-04-05 15:55:21
biofeixue(金币+2): 2011-04-06 05:40:24
引用回帖:
Originally posted by biofeixue at 2011-04-05 06:05:29:
最近看了一篇影响因子为11的文章,里面的引物是有两个错误,为什么可以这样?
The TUB2 (for ß-tubulin) gene was used as an internal control in RT-PCR.
Sense： 5’-GTTCTCGATGTTGTTCGTAAG-3’   
...

如果是用于荧光定量PCR的内参，这对引物不合格，呵呵~
不过如果是半定量的话，问题就不大了。
我也晒对文献上的引物，荧光定量PCR的Actin内参，比你的烂多了……

一看这分析结果，果断自己设计了一对100分的。
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3楼2011-04-05 12:33:21
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
biofeixue(金币+2): 2011-04-06 05:39:30
引用回帖:
Originally posted by biofeixue at 2011-04-05 06:05:29:
最近看了一篇影响因子为11的文章,里面的引物是有两个错误,为什么可以这样?
The TUB2 (for ß-tubulin) gene was used as an internal control in RT-PCR.
Sense： 5’-GTTCTCGATGTTGTTCGTAAG-3’   
...

话说编辑和审稿人也不可能一一去check引物的啦。做出来的结果说得通就行。
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4楼2011-04-05 12:34:52
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dreaming0816

金虫 (著名写手)
biofeixue(金币+2): 2011-04-06 05:39:23
只要二聚体和目的片段没在一起，跑电泳能分别开就可以啦
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5楼2011-04-05 12:36:29
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
biofeixue(金币+2): 2011-04-06 05:39:16
引用回帖:
Originally posted by dreaming0816 at 2011-04-05 12:36:29:
只要二聚体和目的片段没在一起，跑电泳能分别开就可以啦

如果用于荧光定量PCR，二聚体、错配产物这些都能产生荧光信号，会干扰定量结果滴。
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6楼2011-04-05 12:43:22
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yj-lzx

荣誉版主 (文坛精英)
★ ★
1949stone(金币+2): 鼓励 2011-04-05 15:55:44
biofeixue(金币+2): 2011-04-06 05:39:10
只要能扩出目的片段，即使有二聚体也无所谓啊~~~
而且这篇文章的引物二聚体<50bp，很明显可以跟目的片段区分开来~~~
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7楼2011-04-05 13:55:51
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jhu132llh

荣誉版主 (知名作家)
★
amisking(金币+1, EPI+1): 鼓励发帖交流。 2011-04-05 19:24:41
biofeixue(金币+2): 2011-04-06 05:38:58
引用回帖:
Originally posted by biofeixue at 2011-04-05 06:05:29:
最近看了一篇影响因子为11的文章,里面的引物是有两个错误,为什么可以这样?
The TUB2 (for &szlig;-tubulin) gene was used as an internal control in RT-PCR.
Sense： 5’-GTTCTCGATGTTGTTCGTAAG-3’   
...

话说这种结果还是很多的
只要能P出来
人家是不管这个的。
大牛杂志的编辑都是大牛，谁有心情给去验证引物


这个还是好的
好多的文章叙述方法的时候通常都是语出不详，模模糊糊的
已到关键地方他就不说了
你也拿他没办法
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8楼2011-04-05 17:16:49
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