24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 773  |  回复: 7

flowers123

银虫 (小有名气)

[求助] 求助:关于二聚体的单点能

我前最近在算一个二聚体的单点能,用z-矩阵写的坐标,发现计算单体能量时,加不加nosymm,结果一样;但是计算总能量时,加了nosymm就低一点。
1、无论怎么调坐标总能量都是这两个值没有变化。
2、发现计算单体时,用笛卡尔坐标跟z矩阵还不一样呢!
3、是二聚体本来就是这样,还是我写错了。苦查资料没有结果,希望明白人指导一下。
提前致谢,稍后奉上金币!

[ Last edited by gmy1990 on 2011-7-11 at 18:14 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

盼望长成一只小菜鸟......
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

flowers123

银虫 (小有名气)

我该肿么办呢
盼望长成一只小菜鸟......
2楼2011-07-11 19:05:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-07-11 22:27:52
flowers123(金币+5): 2011-07-12 20:30:40
虽然你的问题说明不够详细,但我看你对二聚体的单点能的计算还是对的。

计算单体能量时,加不加nosymm,结果应是一样的。

不加nosymm,是从分析分子的对称性从而减少一些计算量。加nosymm,无非是多了些重复计算而已,结果是一样的。些微的差别,是重复计算并不会完全对等,误差累积的结果。
3楼2011-07-11 22:10:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独唱团

金虫 (正式写手)

你说能量不一样,到底差多少,几电子伏?
4楼2011-07-12 03:40:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

flowers123

银虫 (小有名气)

其实差别还是很大的,用dz计算总能量加了nosymm之后比不加nosymm低了0.0005hatree,看起来不是很大,但是对结合能的影响非常明显达到10%!
我想问的是,二聚体计算总能量是不是都存在这个问题呢?
如果坐标写的不太对的话,修改坐标应该能是加不加nosymm的能量逐渐接近的吧,可是我的总能量一直保持这两个值不变。应该说明,我的坐标写的是正确的吧?
不好意思,麻烦各位帮我在分析一下,我明白之后,一定如数奉上金币。拜谢!
特别感谢zhou2009大侠,我下载过你提供的不少资料,在此一并谢过。
盼望长成一只小菜鸟......
5楼2011-07-12 20:45:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mchen10

金虫 (正式写手)

★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-07-13 08:38:40
0.3 kca/mol很小了,差不多可以忽略(很多情况下)
可以提高收敛标准试试
更痛苦的是梦没醒路已经不能走了
6楼2011-07-13 04:29:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

flowers123

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by mchen10 at 2011-07-13 04:29:54:
0.3 kca/mol很小了,差不多可以忽略(很多情况下)
可以提高收敛标准试试

结合能是差0.3kca/mol,我现在就是纠结在能不能忽略上。10%啊,相当大了,我就是搞不明白,单体计算能量加不加nosymm都一样,偏偏计算二聚体,无论坐标怎么改都是有这么个差距
盼望长成一只小菜鸟......
7楼2011-07-13 10:33:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

flowers123

银虫 (小有名气)

我试试
盼望长成一只小菜鸟......
8楼2011-07-13 10:34:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 flowers123 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 295求调剂 +6 愿旅途永远坦然 2026-04-02 6/300 2026-04-02 21:57 by macy2011
[考研] 071000生物学调剂 +7 知昭蔓 2026-04-02 7/350 2026-04-02 21:47 by dongzh2009
[考研] 372分材料与化工(085600)一志愿湖南大学求调剂 +5 蓝笺片 2026-04-02 6/300 2026-04-02 21:37 by dongzh2009
[考研] 413求调剂 +3 柯某某 2026-03-31 3/150 2026-04-02 16:59 by zzsw+
[考研] 301求调剂 +4 细胞相关蛋白 2026-04-02 8/400 2026-04-02 16:30 by 271179835
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +12 hanamiko 2026-04-01 12/600 2026-04-02 14:51 by 5896
[考研] 一志愿郑大材料工程290求调剂 +20 Youth_ 2026-03-30 20/1000 2026-04-02 14:48 by 5896
[考研] 385分 生物学(071000)求调剂 +6 qf626 2026-04-01 6/300 2026-04-02 10:39 by guoweigw
[考研] 07生物学求调剂 一志愿同济大学359分 +3 LAMC. 2026-03-30 3/150 2026-04-02 10:26 by 18828373951
[考研] 材料求调剂 +10 呢呢妮妮 2026-04-01 13/650 2026-04-02 09:17 by olim
[考研] 302求调剂一志愿北航070300,本科郑大化学 +8 圣日耳曼条 2026-04-01 11/550 2026-04-02 07:40 by chemdavid
[考研] 279求调剂 +7 莫xiao 2026-04-01 7/350 2026-04-01 22:05 by 客尔美德
[考研] 322求调剂 +8 三水sss 2026-04-01 8/400 2026-04-01 10:19 by 唐沐儿
[考研] 求0861交通运输专硕or材料专硕调剂 +4 勒布朗@ 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:54 by 一只好果子?
[考研] 352分-085602-一志愿985 +6 海纳百川Ly 2026-03-29 6/300 2026-03-31 21:06 by yuq
[考研] 08工科,295,接受跨专业调剂 +6 lmnlzy 2026-03-30 6/300 2026-03-31 10:04 by cal0306
[考研] 283求调剂(080500) +14 A child 2026-03-27 14/700 2026-03-30 12:06 by 探123
[考研] 343求调剂 +6 爱羁绊 2026-03-29 6/300 2026-03-29 12:00 by 无际的草原
[考研] 298求调剂 +4 种圣赐 2026-03-28 4/200 2026-03-29 08:42 by q1092522407
[考研] 272求调剂 +7 脚滑的守法公民 2026-03-27 7/350 2026-03-27 17:23 by laoshidan
信息提示
请填处理意见