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小雪sherry

金虫 (小有名气)


[交流] 酶切连接转化

最近在做PET-28a与目的片段连接,首先目的片段是连T载体切下来的,然后把目的片段连到载体上,转化得到的菌落特别少,两三个,提质粒大小不对,做了半年这个试验了,怎么都做不好,急啊。还有最近做目的片段连T载体,转化后有蓝白斑,挑取白斑,提质粒,电泳大小也不对,怎么办啊 ,各位大侠给个意见啊,自己做了半年多了,感觉手法没问题,感受态一是买的,应该也没问题啊,为啥总做不好呢,快没信心了
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yang0071

木虫 (职业作家)


★ ★ ★
小雪sherry(金币+1):谢谢参与
dhd997(金币+2): 提了好多问题,都很重要 2011-07-09 09:39:20
小雪sherry(金币+2): 做了阳性对照,确定感受态没有问题,连接体系15微升,T4连接酶,我觉得这些都没问题的啊,重新来一次吧 2011-07-11 07:56:58
做转化时,阳性对照呢?  感觉很多时候是不准的

估计是连接效率低,连接体系是多少的?什么酶?时间?温度?
转化时 加液量多少? 热休克温控?时间?
2楼2011-07-09 09:37:02
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青菜小虫

银虫 (著名写手)


★ ★ ★
小雪sherry(金币+1):谢谢参与
1949stone(金币+2): 小虫很活跃啊 鼓励 2011-07-09 11:07:03
小雪sherry(金币+1): 同样的啊 我也是这样,连了好几次了,每次都是长了几个菌落,很郁闷 2011-07-11 08:01:29
我觉得应该是目的片段没有连接上吧,我最近也在做这个实验,不过我们的感受态是自己制备的,我们是用inoue法制备的超级感受态,目的片段都连到T载体上了。但是从T载体上切下来的目的片段往PMC18 质粒上也是不好连。
3楼2011-07-09 09:53:07
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小雪sherry(金币+1):谢谢参与
小雪sherry(金币+1): 恩恩 有道理 2011-07-11 08:01:53
个人认为应该是连接的问题,你可以挑白色的单克隆进行先PCR验证,如果能够P出来,那么再提取质粒,进行酶切验证;

蓝白斑筛选长出来的单克隆不一定正确,挑白色单克隆划到平板上,划之前先在板子上涂一些X-Gal,这样也可以排除假阳性的。。。

祝实验顺利!
4楼2011-07-09 15:35:17
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小雪sherry(金币+1):谢谢参与
你片段用什么酶扩的?记住用Taq酶扩,千万别用高保真的酶,那样扩出来尾部是没有A的,所以没法连接T载体;T载体是买的还是自己做的?
5楼2011-07-09 15:46:10
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jiangyhai

金虫 (著名写手)


★ ★ ★
小雪sherry(金币+1):谢谢参与
dhd997(金币+2): good 2011-07-09 18:20:11
T载体上的目的片段经过测序没?电泳质粒通过大小判断不太可靠,除非你的目的片段很大。不知道有没有用T7引物进行PCR鉴定。还有就是分析目的片段中的限制内切酶位点。表达载体的鉴定也可以通过菌落PCR的方法来初步判断目的片段的插入情况。希望对你有帮助。
6楼2011-07-09 15:48:36
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friya0910

新虫 (正式写手)


★ ★ ★
小雪sherry(金币+1):谢谢参与
西瓜(金币+2): 欢迎交流。我们实验室是菌落PCR不可靠……所以都用一种快速提质粒的方法看大小,再挑大的质粒去酶切验证。 2011-07-10 21:41:53
引用回帖:
Originally posted by 小雪sherry at 2011-07-09 09:24:11:
最近在做PET-28a与目的片段连接,首先目的片段是连T载体切下来的,然后把目的片段连到载体上,转化得到的菌落特别少,两三个,提质粒大小不对,做了半年这个试验了,怎么都做不好,急啊。还有最近做目的片段连T载 ...

个人觉得提质粒跑电泳看大小不太可靠,我一般都是先做菌落PCR,确定目的片段连进去了,再提质粒的!最保险的还是测序验证一下比较好吧!
7楼2011-07-10 19:16:16
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小雪sherry

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by friya0910 at 2011-07-10 19:16:16:
个人觉得提质粒跑电泳看大小不太可靠,我一般都是先做菌落PCR,确定目的片段连进去了,再提质粒的!最保险的还是测序验证一下比较好吧!

我的片段是接近700了 应该能看出大小来的,我试试PCR吧,这样可以省点试剂盒提质粒
8楼2011-07-11 08:05:47
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小雪sherry

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by jiangyhai at 2011-07-09 15:48:36:
T载体上的目的片段经过测序没?电泳质粒通过大小判断不太可靠,除非你的目的片段很大。不知道有没有用T7引物进行PCR鉴定。还有就是分析目的片段中的限制内切酶位点。表达载体的鉴定也可以通过菌落PCR的方法来初步 ...

T载体的我还没有测过序,但是我用酶把片段从T载体上切下来了啊 如果没连上也应该切不下来啊 试试菌落pcr吧 谢谢
9楼2011-07-11 08:07:31
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小雪sherry

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by 空谷幽风 at 2011-07-09 15:46:10:
你片段用什么酶扩的?记住用Taq酶扩,千万别用高保真的酶,那样扩出来尾部是没有A的,所以没法连接T载体;T载体是买的还是自己做的?

用的是TAKARA的Tag酶,T 载体还能自己做吗,教教我吧,还省钱了
10楼2011-07-11 08:09:13
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青菜小虫

银虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by 青菜小虫 at 2011-07-09 09:53:07:
我觉得应该是目的片段没有连接上吧,我最近也在做这个实验,不过我们的感受态是自己制备的,我们是用inoue法制备的超级感受态,目的片段都连到T载体上了。但是从T载体上切下来的目的片段往PMC18 质粒上也是不好连。

不要丧失信心,多做几次,菌落pcr的时候多挑几个菌检测,加油!
11楼2011-07-11 08:46:20
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by 小雪sherry at 2011-07-11 08:09:13:
用的是TAKARA的Tag酶,T 载体还能自己做吗,教教我吧,还省钱了

你还是买成品的吧,自己做的质量没保证,再说商品化的也不值钱
12楼2011-07-11 21:07:58
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