| 查看: 2286 | 回复: 7 | ||||
| 本帖产生 2 个 BioEPI ，点击这里进行查看 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
[交流]
测序结果的疑问
|
||||
|
前面利用CODEHOPE设计了简并引物，克隆一个基因片段。现在测序结果已经出来，令我很疑惑。 割胶回收后连接PMD18载体后，涂平板，挑单菌过夜摇菌，之后提质粒酶切，送去测序。 现在问题来了，同一个平板出来的克隆，测序结果不同，有80%左右的相似性。BLAST后都与相关基因具有比较高的同源性。 现在一共送去了11个克隆测序，目前粗粗看了一下至少有4个不同的片段，之间一般是具有80%左右的同源性。 请问这是怎么回事？基因家族？我要克隆的这个基因是具有基因家族的传统的，拟南芥等植物里一般有4-8个基因家族是很正常的。 还是测序问题？ 令外问一个令我不解的问题，植物的基因组应该是固定的吧，那么那么多基因家族，对应的外显子应该不同，怎么能一一对应基因组DNA呢？ 望大家解惑，谢谢！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 经验 |
» 猜你喜欢
广西大学-广州大学招聘博士后 欢迎广大优秀人才！！！
已经有11人回复
-
闲聊
已经有3人回复
-
江苏省自然基金 什么时候出结果
已经有4人回复
-
如何查询2026年获批项目名称？
已经有3人回复
-
两块石头
已经有10人回复
-
科研人应该花精力去思考如何解决问题，而不是去凝练问题
已经有19人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有15人回复
-
面上没中，邀请各位路过的虫友分析一下分数
已经有13人回复
-
初秋的晨风
已经有6人回复
-
Ei源刊怎么投
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请教一个关于测序结果的问题
已经有19人回复
- PCR后测序，blast最高匹配度只有32%
已经有3人回复
- 中国高通量测序仪现状调查
已经有10人回复
- 测序结果比对问题
已经有16人回复
- 关于酶切验证克隆的一点点小疑问！
已经有5人回复
- 克隆测序的问题
已经有3人回复
- 测序的问题
已经有24人回复
- 【求助/交流】3'RACE 结果有问题～～～
已经有8人回复
- 【求助/交流】克隆测序问题
已经有6人回复
- 【求助/交流】基因测序结果分析问题
已经有9人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
【征稿中！】2026年机械、制造技术与材料国际会议 (MEMTM 2026)
+1/328
-
招收大湾区大学-哈工深联培博士1名
+1/193
-
2027级博士研究生——质谱分析
+5/40
-
求一份中国科学技术大学 吴燕峰老师的 实验流体力学 课件
+1/35
-
上海交通大学膜分离-纳流控课题组诚聘博士后2-3名
+1/25
-
美国弗吉尼亚大学Yang Lab招收Research Scientist, 博后、博士生、技术员、访问学者
+1/21
-
评职称需要，卖发明专利了:D有技术储备需求的设备厂商可联系
+1/18
-
哈工大马樱招收2027级计算机类博士生
+1/18
-
招聘电池方向博士
+1/11
-
宁波市中医药研究院招聘科研助理！
+1/8
-
招聘材料计算，分子动力学模拟相关讲师
+1/6
-
合肥工业大学许婷婷老师招收2027年入学博士研究生，有机/高分子合成背景
+1/4
-
澳门大学、澳理工联合培养博士招生（2027）
+1/3
-
考博求助
+1/3
-
天津大学浙江研究院2026年第二批招聘公告：高分子等方向特聘青年研究员/博士后
+1/3
-
横向课题结题时企业突然问专利归谁，合同里没约定的话默认算谁的？
+1/2
-
招聘材料计算，分子动力学模拟兼职讲师
+1/2
-
新加坡国立大学Sibudjing Kawi教授课题组part-time PhD（热催化/等离子体催化方向）
+1/2
-
Paris Saclay university, Dallerac教授团队招收2027CSC–Saclay合作奖学金博士生
+1/2
-
赣南师范大学先进封装前沿材料课题组科研助理招聘公告
+1/2
6楼2011-07-05 17:22:05
★ ★ ★ ★
shizishanshang(金币+1):谢谢参与
silicare(金币+3, EPI+1): 前提是PCR没有突变 2011-07-05 12:12:51
shizishanshang(金币+2): 谢谢啊，看着BLAST结果头晕着呢 2011-07-05 17:22:40
shizishanshang(金币+1):谢谢参与
silicare(金币+3, EPI+1): 前提是PCR没有突变 2011-07-05 12:12:51
shizishanshang(金币+2): 谢谢啊，看着BLAST结果头晕着呢 2011-07-05 17:22:40
|
肯定不是测序的问题。对于植物来说最大的可能是因为大的基因家族,也有可能是选择性剪切.不知道你说得相似性是怎么算出来的,是SNP还是有插入或者确实的片段？做过blast没有呢，可以试一下用clustalx或者seqman等比一下看看。 怎么能一一对应基因组DNA呢？这句话没看明白你是什么意思，你是问如何去对应还是已经对应了你不理解为什么？ 你可以通过比对基因组序列和mRNA序列来分析你这些序列所对应的基因组的结构的，这个可以帮助你确定他们是基因家族还是选剪以及是如何剪切的。植物的基因组有多倍体。 另外还有个问题，不知道的模板是DNA还是cDNA. |
2楼2011-07-05 10:39:32
★ ★ ★ ★
shizishanshang(金币+1):谢谢参与
silicare(金币+3, EPI+1): 有一定道理 2011-07-05 12:13:39
shizishanshang(金币+1): 恩，问了一下公司说测序肯定没有问题，我的片段大约850bp，测通的 2011-07-05 17:23:19
shizishanshang(金币+2): 已经证明是基因家族，全长已经得到，既是做荧光定量不好设计引物了 2011-10-04 15:15:03
shizishanshang(金币+1):谢谢参与
silicare(金币+3, EPI+1): 有一定道理 2011-07-05 12:13:39
shizishanshang(金币+1): 恩，问了一下公司说测序肯定没有问题，我的片段大约850bp，测通的 2011-07-05 17:23:19
shizishanshang(金币+2): 已经证明是基因家族，全长已经得到，既是做荧光定量不好设计引物了 2011-10-04 15:15:03
|
测序对结果也是有较大影响的，并非楼上说的肯定不是测序的问题。 一般的测序仪在600以内保证没问题，800左右及以上就不准确了，尤其是技术不过关的企业。 你通过兼并引物扩出来的片段我感觉更多的像是基因家族的多个成员，毕竟他们有着相似度很高的保守区段，当然也不排除其他的可能…… |
3楼2011-07-05 10:45:59
4楼2011-07-05 10:50:48