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friya0910

新虫 (正式写手)

[交流] 质粒是否需要酶切后再电泳? 已有5人参与

将连接有目的片段的质粒做双酶切,跑电泳的时候想加一个空质粒,那这个空质粒是不是应该先单酶切一下啊?不然跑出来的不是线性的话就和前面双酶切的就没有可比性了啊?
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

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dhd997(金币+2): good 2011-07-05 08:00:19
如果是同尾酶,那么用A和B切外源片段,用A和C切载体,连接之后克隆子的酶切位点变为A和D,B和C切口连接之后变为D的位点?
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
6楼2011-07-05 01:05:10
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

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dhd997(金币+5, EPI+1): 辛苦,一并奖励了 2011-07-05 19:16:27
我现在只是把目的片段连接到了pMD19-T载体上,还没做到双酶切重组质粒这一步,我现在就想把目的片段从pMD19-T载体上切下来,切完之后跑胶需不需要加一个空载体做对照啊?

原来是TA克隆,目的是看有没有连接上外源片段。你没有必要双酶切那么费事的,单酶切就可以了。你这样做是需要加一个对照的,对照应该为空载体,选用的酶切位点最好是外源片段上没有的位点,同时在载体上只有一个位点,这样切出来无论是有没有带有外源片段,都是一条带,但是带有外源片段的质粒条带会大于不带外源片段的质粒。

如果是只在外源片段上有但是载体上没有的位点,那么如果酶失效了,或者其它原因导致酶切不成功,那么质粒就不被切开,判断起来就稍微麻烦了些。


还有一个问题是我才发现pMD19-T载体在TA克隆位点后居然有我的下游引物的酶切位点BamHI 这样会不会影响酶切啊?最后双酶切以后会是3条带吗?

不一定是三条带,如果两个位点之间相隔很近,那么切出来的条带会很短,跑胶的时候会跑出去根本看不见,毕竟在多克隆位点处的酶切位点是很密集的。你选用的鉴别方法可以再仔细考虑一下,包括单酶切还是双酶切,选用什么酶。
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9楼2011-07-05 18:48:56
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