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starry99

木虫 (正式写手)

[求助] 高斯计算中离子电荷的处理

我最近在做gaussian计算离子液体的一些性质,遇到了如下问题:
1、gaussian中离子到底如何表示,gaussian中每个原子仅仅以坐标的形式给出,在输入文件第二行给出的电荷数gaussian是如何知道电荷如何分布的呢。如果对于一个咪唑离子液体,+电荷分布在N上,但是输入文件没有体现出来N的形式电荷。而输出的文件中Mulliken电荷却显示+离子均匀的分布在5元环上,貌似形成了大派键,,两个N的电荷分布竟然是一样的。如果觉得是因为5元环上其他的电子共轭到N上的空轨道也能解释,不知道这样的结果能不能让人信服
2、如果我要处理正负电荷在一起的体系,那么电荷又如何表示呢,我将正负电荷中心对应然后优化构型,因为二者电荷为0我电荷项就设为0。优化的结果觉得构型看起来还是不错的,我把他们当成整体的分子,计算Dipole和Molar Volume但是与文献对应不上不知道为什么。
希望大牛能够帮帮小弟,谢谢~~
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jianqin

金虫 (正式写手)

我也遇到和楼主同样的问题,如果我要研究质谱中某一分子离子(带正电荷)的几何构象和能量,用chemdraw画好结构,再用chem3D生成3D结构,输入gaussian计算,得到的构象结果用chem3D打开,正电荷就不见了,而gaussianView中更是看不到正电荷。
6楼2011-07-04 22:16:49
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