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longwen36

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] Gaussian中怎么设定金属离子的带电等问题

刚学Gaussian，请问怎么在高斯中给金属离子设定电荷呀？
做的是金属离子的螯合，如图中Pb，想让它带2个正电荷变成Pb2+怎么弄呢？用的Gaussianview建模。

另外想再问下，我算25个原子做opt+freq，机器40min中能算完，现在增加到150个，增加6倍，预计要多长时间呢？

多谢！
Gaussian中怎么设定金属离子的带电等问题
Pb2+.jpg

补充：个人的做法是：
Gaussview中Edit->Atomic Group 然后修改

Gaussian中怎么设定金属离子的带电等问题-1

然后
Gaussian中怎么设定金属离子的带电等问题-2

不知道对不对？

问题比较多，刚学，菜鸟。求教上面的问题。

[ Last edited by longwen36 on 2013-7-28 at 23:29 ]
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1楼 2013-07-28 22:56:34
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子

【答案】应助回帖

★
csgt0: 金币+1, 应助指数+1, 多谢指导 2013-07-30 09:29:36
如果是为了计算螯合物的话，不能按上述方式设定，只需在整个分子的坐标的前面设定一个电荷值”2“即可，按你的体系看自旋多重度应该是1吧（即体系中没有单电子）。
计算时间无法预测。
另：计算结果里Pb离子并不一定就会带2个单位的正电荷，因为分子轨道理论认为电子是离域的，不会简单地固定绕着那个核运动。
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愿好运与快乐伴随你！
2楼2013-07-29 16:30:38
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longwen36

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by quantumor at 2013-07-29 16:30:38
如果是为了计算螯合物的话，不能按上述方式设定，只需在整个分子的坐标的前面设定一个电荷值”2“即可，按你的体系看自旋多重度应该是1吧（即体系中没有单电子）。
计算时间无法预测。
另：计算结果里Pb离子并不一 ...

您的意思是，如果是按fragment修改Pb离子的电荷数为2的话Pb2+的电荷是固定的？

如果在整体的分子上加两个电荷，按这样算下来，Pb离子电荷应该会小于+2？
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3楼2013-07-29 17:41:50
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子
★
csgt0: 金币+1, 谢谢 2013-07-30 09:29:42
fragment不适合你的体系的计算；最后的结果Pb离子的电荷一定会小于+2，这是电子离域本质的必然结果。
多看版里给初学者推荐的主要帖子（置顶的那些），慢慢学吧，你需要理论基础知识。
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愿好运与快乐伴随你！
4楼2013-07-30 08:30:52
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