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lgc020305

银虫 (正式写手)

[求助] 阴离子 GAUSSIAN 计算电荷设置,如硫酸根,是-2 还是2- ----------急急急

如题,问个小白的问题啊
如果一个配合物如[Cu(NH3)4]2+
在高斯计算中电荷设置为2+ 还是+2,G09是不是2默认为点带个正电荷?

急急急。。。
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astringent

铜虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lgc020305: 金币+5 2013-03-17 05:10:59
在高斯计算中电荷设置为2即可,你要是想写-2价的离子,就写-2
2楼2013-03-17 02:20:48
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lgc020305

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by astringent at 2013-03-17 02:20:48
在高斯计算中电荷设置为2即可,你要是想写-2价的离子,就写-2

阴离子电荷不应该是n-吗?2-
-2好像是化合价?
如硫酸根带2个单位负电荷--所以2-
但GAUSSIAN 应该是-2?
3楼2013-03-17 05:13:16
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celine蔡

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
lgc020305: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-03-26 06:20:35
引用回帖:
3楼: Originally posted by lgc020305 at 2013-03-17 05:13:16
阴离子电荷不应该是n-吗?2-
-2好像是化合价?
如硫酸根带2个单位负电荷--所以2-
但GAUSSIAN 应该是-2?...

gaussian设置电荷应该是-2
4楼2013-03-22 21:59:51
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阿克飞顿

金虫 (正式写手)

楼楼可以把你的输入文件贴出来给俺看看不,刚开始学高斯,各种迷茫,说明书也看不懂
5楼2015-09-24 20:49:40
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lgc020305

银虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 阿克飞顿 at 2015-09-24 20:49:40
楼楼可以把你的输入文件贴出来给俺看看不,刚开始学高斯,各种迷茫,说明书也看不懂

例子:参考基本格式,电荷-2 和2- G09都可以算的,自己可以用小分子多试验,检验关键词的用处和区别。

%nproc=12
%mem=10GB
%chk=1.chk
#p pbe1pbe/genecp/ opt gfinput freq scf=(xqc,conver=6,maxcycle=1024)

here are the coordinates for complex301

0 1
Fe       2.080121279   -0.000000000    0.000000000
O       -2.335685730    3.280962706    2.046452284
C       -1.626547337    2.791960716   -1.318255424
O       -2.335685730    3.280962706   -2.046452284
C       -0.054338958   -2.518320560    0.772602499
C        0.177237615   -0.956088305    0.782971084
H        0.585275352   -1.000750184    1.823215842
C       -1.051468968    0.370976418    1.237415910
H       -1.034996629    0.550995052    2.324843168
C       -2.404025793   -0.031349748    0.674971640
C     (坐标有缺失,机组有缺失!!)

Fe     0
S   1   1.00
      0.3630000000E-01       0.1000000000E+01
P   3   1.00
      0.1948000000E+02      -0.4702820000E-01
      0.2389000000E+01       0.6248841000E+00
      0.7795000000E+00       0.4722542000E+00
P   4   1.00
      (机组有缺失!!)
P   1   1.00
      0.2200000000E-01       0.1000000000E+01
D   4   1.00
      0.3708000000E+02       0.3290000000E-01
      0.1010000000E+02       0.1787418000E+00
      0.3220000000E+01       0.4487657000E+00
      0.9628000000E+00       0.5876361000E+00
D   1   1.00
      0.2262000000E+00       0.1000000000E+01
F   1   1.00
      2.4620000              1.0000000
****
O     0
6-31G(d')
****
C     0
6-31G(d')
****
H     0
6-31G(d')
****

Fe
lanl2dz
阴离子 GAUSSIAN 计算电荷设置,如硫酸根,是-2 还是2-  ----------急急急
g09.jpg

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6楼2015-09-24 21:32:13
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阿克飞顿

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by lgc020305 at 2015-09-24 21:32:13
例子:参考基本格式,电荷-2 和2- G09都可以算的,自己可以用小分子多试验,检验关键词的用处和区别。

%nproc=12
%mem=10GB
%chk=1.chk
#p pbe1pbe/genecp/ opt gfinput freq scf=(xqc,conver=6,maxcycle=10 ...

嗯,谢谢您。我有个疑问一直搞不懂。首先如您的图中所示,体系的电荷设置为2,这个意思是整个体系的电荷为+2价,而实际优化出来的结果,过渡金属离子不一定就是+2价,甚至相差甚远。但在配合物中,配合物所表现出来的价态是由中心金属离子赋予的吧??这样的话,岂不是计算结果与实际不符了。另外,多重度的选择是通过比较不同多重度下的能量大小来判断吧??

发自小木虫Android客户端
7楼2015-09-24 21:51:05
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lgc020305

银虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 阿克飞顿 at 2015-09-24 21:51:05
嗯,谢谢您。我有个疑问一直搞不懂。首先如您的图中所示,体系的电荷设置为2,这个意思是整个体系的电荷为+2价,而实际优化出来的结果,过渡金属离子不一定就是+2价,甚至相差甚远。但在配合物中,配合物所表现出来 ...

1. 体系的电荷
G09只能设定整体电荷,无法指定电荷(参考其他软件)
2. 多重度的选择
可以测试不同的多重度,也要结合实验数据,例如实验上可以测 H-NMR,那么若设定自重读=3 (一个单电子)就错了。如是实验上可测EPR,那么若设定自重读=1 (无单电子)也错了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

8楼2015-09-24 22:02:54
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阿克飞顿

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by lgc020305 at 2015-09-24 22:02:54
1. 体系的电荷
G09只能设定整体电荷,无法指定电荷(参考其他软件)
2. 多重度的选择
可以测试不同的多重度,也要结合实验数据,例如实验上可以测 H-NMR,那么若设定自重读=3 (一个单电子)就错了。如是实验上可 ...

好的,明白了

发自小木虫Android客户端
9楼2015-09-24 22:07:12
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