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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » gaussian 是否可以画差分电荷密度
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chuchu6816

金虫 (正式写手)

[求助] gaussian 是否可以画差分电荷密度

请问gaussian 怎么画差分电荷密度？请各位大侠帮忙。
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1楼 2011-08-30 16:50:07
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

linzhongaiguo

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
zhou2009(金币+1): 2011-08-31 06:56:32
chuchu6816(金币+2): 2011-09-05 11:15:16
可以的，我们可以合作的。
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chuchu6816
DFT
2楼2011-08-30 20:36:34
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chuchu6816

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
zhou2009: 是的！ 2011-09-01 16:30:26
引用回帖:
2楼: Originally posted by linzhongaiguo at 2011-08-30 20:36:34:
可以的，我们可以合作的。

您好！ 差分电荷密度的 基本步骤 是什么啊 ？ 比如吸附剂（A） 吸附(B)前后的差分电荷密度 是如下步骤吗: 1,优化： AB   2，单点能 AB 产生 AB.cube AB.chk  3， 单点能 A A.cube         4， 单点能 B  B.cube      
然后：  A.cube + B.cube =C.cube     最后     AB.cube  - C.cube =diff.cube      最后在diff.cube 基础上上作图
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6楼2011-09-01 11:17:53
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普通回帖

jjf_sxnu

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-08-31 06:56:10
chuchu6816(金币+2): 2011-09-05 11:15:07
强烈推荐一个软件multiwfn，用来处理高斯的输出，画差分密度图自不在话下。
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chuchu6816
3楼2011-08-30 21:49:30
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
请问楼主何为差分电荷密度？画出来有什么用途吗？谢谢
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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
4楼2011-08-30 23:59:49
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MVP41

木虫 (小有名气)
gmy1990:编辑内容 2011-09-01 19:26
回帖已删！

[ Last edited by gmy1990 on 2011-9-1 at 19:26 ]
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5楼2011-08-31 17:06:12
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chuchu6816

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by jjf_sxnu at 2011-08-30 21:49:30:
强烈推荐一个软件multiwfn，用来处理高斯的输出，画差分密度图自不在话下。

您好！ 请问高斯输出的基本步骤是什么啊？
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7楼2011-09-01 11:18:50
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

chuchu6816(金币+6): 谢谢 2011-09-05 11:14:11
你在6楼说的步骤是对的。

只是要注意的是：
A、B在算单点能时，要取AB中的坐标；
AB、A、B在求CUBE时，要取同样的CUBE参数。
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8楼2011-09-01 16:38:56
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chuchu6816

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by zhou2009 at 2011-09-01 16:38:56:
你在6楼说的步骤是对的。

只是要注意的是：
A、B在算单点能时，要取AB中的坐标；
AB、A、B在求CUBE时，要取同样的CUBE参数。

谢谢！请问怎么设置在算单点能时的 cube 参数啊？ 我设置的是   
nosymm cube=density density=scf     int=grid=ultrafine  能产生diff.cube 但是在画图的时候 总是显示（Surface Buid failed.
Error Reading Cube File-    Imcomplete cube file）.    期待您的帮忙 。谢谢啊！
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9楼2011-09-01 19:53:14
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

你用cube=density，虽然能够得到cube，但由于你没有指定参数，参数是由gaussian根据分子空间自行选定的。那么，AB、A、B在求CUBE时，gaussian会根据分子空间自行选定三套完全不同的CUBE参数，就不能将CUBE相加、相减了，当然会出错。

要用关键词cube=(Orbitals,cards)，cards就是你要输入的参数。不管A、B是什么样的，都取AB的参数。
关于CUBE参数的取法，本论坛有许多讨论，可搜索一下。
也可看我编写的《量子化学图形显示手册》
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1616092
也可在Multiwfn中定CUBE参数，更方便一些，详见Multiwfn使用说明。
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10楼2011-09-02 09:40:44
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