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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » cube generate failed，
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wangjianru

新虫 (初入文坛)

[求助] cube generate failed， 已有2人参与

对一个250多个原子的分子构型优化等正常结束后，在画分子轨道时，.chk文件无法打开，于是将.chk文件转换为.fch文件，并将independent改为independant,可以打开，但想画分子轨道图时，老是提示：data for alpha Mo cofficients on fchk file has wrong length\type ......,cube generate failed，没法画出分子轨道，请帮忙，多谢
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1楼 2014-01-02 18:16:10
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2014-01-03 20:32:26
可以将fch文件读入multiwfn，写一个你指定的MO的cub文件，这cub文件再读入GV中画出该MO来。

[ Last edited by zhou2009 on 2014-1-22 at 16:20 ]
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2楼2014-01-02 19:13:12
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-01-03 20:32:31
可以重新做一次单点计算，用guess=read读取之前的初猜，同时写上IOp(3/32=2)避免去除线性依赖的基函数。重新得到的fch就用了。

更好的方法是用Multiwfn(http://multiwfn.codeplex.com)来读取fch文件观看轨道。载入fch文件后进主功能0就行了，界面右下角选择要看的轨道，速度远快于Gaussview。另外也可以用Multiwfn主功能5产生轨道的cube文件，再用gv、VMD、molekel等程序载入后看等值面。（还可以用其主功能200里的功能3一次性计算并导出一批轨道的cube文件）
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wangjianru
3楼2014-01-02 19:19:55
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wangjianru

新虫 (初入文坛)
zhou2009: 编辑内容 2014-01-22 16:34
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2014-01-02 19:13:12
可以将fch文件读入mutjiwfn，写一个你指定的MO的cub文件，这cub文件再读入GV中画出该MO来。

具体怎么操作啊，我打开multiwfn,输入路径及文件.fch,一点回车什么都没了，怎么回事啊,怎样写我cub文件啊，请帮忙示例下，第一次使用mutjiwfn,

[ Last edited by zhou2009 on 2014-1-22 at 16:34 ]
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4楼2014-01-20 15:26:04
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-01-23 00:21:13
引用回帖:
4楼: Originally posted by wangjianru at 2014-01-20 15:26:04
具体怎么操作啊，我打开mutjiwfn,输入路径及文件.fch,一点回车什么都没了，怎么回事啊,怎样写我cub文件啊，请帮忙示例下，第一次使用mutjiwfn,...

1、进入英语输入法；
2、用小写输入文件名；
3、为了避免路径写错，最好把multiwfn以及它的3个附件复制到.fch文件所在的文件夹中，这样免去写路径。
再试一下。

[ Last edited by zhou2009 on 2014-1-22 at 16:19 ]
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5楼2014-01-20 16:07:47
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-01-21 00:23:51
引用回帖:
4楼: Originally posted by wangjianru at 2014-01-20 15:26:04
具体怎么操作啊，我打开mutjiwfn,输入路径及文件.fch,一点回车什么都没了，怎么回事啊,怎样写我cub文件啊，请帮忙示例下，第一次使用mutjiwfn,...

显然是输入格式错误。对于Windows版，不分大小写，路径输入错了也不会导致自动退出。启动后，诸如输入d:\K_ON\MIO.fch就载入了此文件。(实际上，屏幕上已经给出了例子了，可见这样的提示Input file path (for example, E:\Fate_Zero\Saber.wfn)


Multiwfn的手册的第四章里给出了各类操作非常非常非常详细的例子，怎么生成格点数据在手册4.5节提供了一堆例子。

Multiwfn不叫mutjiwfn。
第一次使用Multiwfn建议先阅读《Multiwfn入门tips》（http://hi.baidu.com/sobereva/item/896ee3a19f6d7d3c020a4d76）
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6楼2014-01-20 22:53:53
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wangjianru

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sobereva at 2014-01-20 22:53:53
显然是输入格式错误。对于Windows版，不分大小写，路径输入错了也不会导致自动退出。启动后，诸如输入d:\K_ON\MIO.fch就载入了此文件。(实际上，屏幕上已经给出了例子了，可见这样的提示Input file path (for exam ...

呵呵，好严肃啊，多谢啊，我会再去试试。这两天采用了3楼的的做法，即将优化好的结构重新做了一次单点计算，果然可以打开.chk文件，但就是homo和lumo的能量与之前优化好的能量不同，之前的homo为-0.21958.而现在加了iop(3/32=2)之后重新做的单点的homo为-0.21956.所以想知道这样可以吗
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7楼2014-01-22 10:57:48
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wangjianru

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by sobereva at 2014-01-02 19:19:55
可以重新做一次单点计算，用guess=read读取之前的初猜，同时写上IOp(3/32=2)避免去除线性依赖的基函数。重新得到的fch就用了。

更好的方法是用Multiwfn(http://multiwfn.codeplex.com)来读取fch文件观看轨道。载 ...

多谢啊，第一个方法管用，第二个方法正在琢磨。只是第一的方法算出来的HOMO（-0.21956）和LUMO 与之前算出的HOMO(-0.21958)略有差别，这样也没关系吗？
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8楼2014-01-22 11:04:59
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zhou2009

版主 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sobereva at 2014-01-20 22:53:53
显然是输入格式错误。对于Windows版，不分大小写，路径输入错了也不会导致自动退出。启动后，诸如输入d:\K_ON\MIO.fch就载入了此文件。(实际上，屏幕上已经给出了例子了，可见这样的提示Input file path (for exam ...

对不起！打字时没开灯，将multiwfn打错了。
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9楼2014-01-22 16:40:10
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
引用回帖:
8楼: Originally posted by wangjianru at 2014-01-22 11:04:59
多谢啊，第一个方法管用，第二个方法正在琢磨。只是第一的方法算出来的HOMO（-0.21956）和LUMO 与之前算出的HOMO(-0.21958)略有差别，这样也没关系吗？...

没有关系。
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10楼2014-01-23 03:44:25
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