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wangjianru

新虫 (初入文坛)

[求助] cube generate failed, 已有2人参与

对一个250多个原子的分子构型优化等正常结束后,在画分子轨道时,.chk文件无法打开,于是将.chk文件转换为.fch文件,并将independent改为independant,可以打开,但想画分子轨道图时,老是提示:data for alpha Mo cofficients on fchk file has wrong length\type ......,cube generate failed,没法画出分子轨道,请帮忙,多谢
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wangjianru

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by sobereva at 2014-01-20 22:53:53
显然是输入格式错误。对于Windows版,不分大小写,路径输入错了也不会导致自动退出。启动后,诸如输入d:\K_ON\MIO.fch就载入了此文件。(实际上,屏幕上已经给出了例子了,可见这样的提示Input file path (for exam ...

呵呵,好严肃啊,多谢啊,我会再去试试。这两天采用了3楼的的做法,即将优化好的结构重新做了一次单点计算,果然可以打开.chk文件,但就是homo和lumo的能量与之前优化好的能量不同,之前的homo为-0.21958.而现在加了iop(3/32=2)之后重新做的单点的homo为-0.21956.所以想知道这样可以吗
7楼2014-01-22 10:57:48
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查看全部 10 个回答

zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2014-01-03 20:32:26
可以将fch文件读入multiwfn,写一个你指定的MO的cub文件,这cub文件再读入GV中画出该MO来。

[ Last edited by zhou2009 on 2014-1-22 at 16:20 ]
2楼2014-01-02 19:13:12
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-01-03 20:32:31
可以重新做一次单点计算,用guess=read读取之前的初猜,同时写上IOp(3/32=2)避免去除线性依赖的基函数。重新得到的fch就用了。

更好的方法是用Multiwfn(http://multiwfn.codeplex.com)来读取fch文件观看轨道。载入fch文件后进主功能0就行了,界面右下角选择要看的轨道,速度远快于Gaussview。另外也可以用Multiwfn主功能5产生轨道的cube文件,再用gv、VMD、molekel等程序载入后看等值面。(还可以用其主功能200里的功能3一次性计算并导出一批轨道的cube文件)

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2014-01-02 19:19:55
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wangjianru

新虫 (初入文坛)

zhou2009: 编辑内容 2014-01-22 16:34
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2014-01-02 19:13:12
可以将fch文件读入mutjiwfn,写一个你指定的MO的cub文件,这cub文件再读入GV中画出该MO来。

具体怎么操作啊,我打开multiwfn,输入路径及文件.fch,一点回车什么都没了,怎么回事啊,怎样写我cub文件啊,请帮忙示例下,第一次使用mutjiwfn,

[ Last edited by zhou2009 on 2014-1-22 at 16:34 ]
4楼2014-01-20 15:26:04
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