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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 关于吸附的差分电荷密度图如何分析
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袁庭

金虫 (正式写手)

[求助] 关于吸附的差分电荷密度图如何分析

RT,做了一个吸附的差分电荷密度图，但是图画出来了不会分析，希望各位大神帮帮忙，底物是Au，反应物是噻吩。第一次做差分电荷密度，不知道切面有没有问题。谢谢了

未命名333.jpg
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1楼 2013-05-04 00:03:48
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

DFPT

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
差分电荷只能定性的分析成键（更准确说，化合物中电子相对于未成化合物时的转移情况）方式，不能用于定量比较成键强弱。吸附的强弱至少要从结合能/吸附能的角度来讨论。
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010-8393-9164
7楼2013-05-05 10:07:58
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普通回帖

袁庭

金虫 (正式写手)
这个图可以说明S和Au表面相互作用了么
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2楼2013-05-04 00:04:37
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袁庭

金虫 (正式写手)
或者能否从电子云的大小来判断吸附的强弱
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3楼2013-05-04 00:24:52
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袁庭

金虫 (正式写手)
这个是我做的三个不同面上的吸附的差分电荷密度图，想问下，能判断出那个吸附最强么？有什么依据，谢谢了！

未命名123.jpg
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4楼2013-05-04 00:37:49
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袁庭

金虫 (正式写手)
求大神。。
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5楼2013-05-04 07:50:39
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gaolugang

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
袁庭: 金币+30, ★★★很有帮助, 10 2013-05-05 10:46:50
建议楼主先把charge difference density的颜色scale调小一些。然后放大到金属和有机分子志坚的区域进行观察。这样才能看清电荷的转移。请楼主看我贴的graphene附件图片。红色是正值，表示电子转移进来，形成bonding. 蓝色表示电子转移出去。

至于成键的强弱，不能简单有charg dieffence来说明。我觉得可以用bonding energy来说明。成见前的金属和有机物的能量和减去成见后的系统总能量，就是bonding energy.

建议楼主可以做一些dipole 计算，来对吸附进行分析，参见 PHYSICAL REVIEW B 74 , 073414 ff 2006 ffi

cdp.png
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6楼2013-05-05 04:45:44
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袁庭

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by gaolugang at 2013-05-05 04:45:44
建议楼主先把charge difference density的颜色scale调小一些。然后放大到金属和有机分子志坚的区域进行观察。这样才能看清电荷的转移。请楼主看我贴的graphene附件图片。红色是正值，表示电子转移进来，形成bonding ...

我调过了，麻烦您看下，这样可以了么

123.jpg
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8楼2013-05-05 10:49:10
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袁庭

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by gaolugang at 2013-05-05 04:45:44
建议楼主先把charge difference density的颜色scale调小一些。然后放大到金属和有机分子志坚的区域进行观察。这样才能看清电荷的转移。请楼主看我贴的graphene附件图片。红色是正值，表示电子转移进来，形成bonding ...

我是在吸附能、电荷分析都有结论的基础下，想用差分电荷密度去更加直观的表示成键
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9楼2013-05-05 10:50:10
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袁庭

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by DFPT at 2013-05-05 10:07:58
差分电荷只能定性的分析成键（更准确说，化合物中电子相对于未成化合物时的转移情况）方式，不能用于定量比较成键强弱。吸附的强弱至少要从结合能/吸附能的角度来讨论。

我是在吸附能、电荷分析都有结论的基础下，想用差分电荷密度去更加直观的表示成键
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10楼2013-05-05 10:51:12
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