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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 再次求问，差分电荷密度图的定性分析
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silikiwi

金虫 (小有名气)

[求助] 再次求问，差分电荷密度图的定性分析

已经通过能量得出了结构稳定性的判断，想通过差分电荷密度图定性分析下不同结构稳定性差距的物理机制。如图。我知道可以从电负性的角度去解释，即两个电负性较大的原子在一起会有较大的库伦排斥力，而它们中间有一个电负性较弱的引入后会减弱这种库伦排斥力。我想知道的是能否从差分电荷密度图上，从电子转移上来定性的分析下原子间的相互作用。求帮助。
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1楼 2012-04-07 14:52:51
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

anlen0615

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
WDD880227: 金币+1, 谢谢指教 2012-11-28 14:35:31
引用回帖:
14楼: Originally posted by miao968 at 2012-11-28 09:17:44
请问你找到方法了吗

“在isosurface一项里可以设置你要分析的原子面”

楼上说 设置你要分析的原子面   怎么弄？没有分析原子面的选项哈...

view--->toolbars--->volume visualization, 可以调出creat slices,这样就可以选择2D 的electron density，然后选中这个slice，在properties中修改 slice crystal direction(修改所取面的晶向)，修改slice fractional postion(修改你所取的面的确定位置)，然后从工具栏选择color map, 即可得到想要的面的电荷密度。
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厚积而薄发！
15楼2012-11-28 14:02:04
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silikiwi

金虫 (小有名气)
★ ★
fzx2008: 金币+2, 谢谢交流！ 2012-05-08 12:17:48
还是来做个了结吧。差分电荷密度图确实能比较清楚的看出电子得失的情况，但仍只是一种定性的判定化学键的方法。至于我求问的其和体系能量的关系，这种图所能提供的信息更是有限。定量的办法是用VASP把Kohn-Sham总能中的经典Coulomb排斥能拆解出来进行对比。还有一种比较直观的判断成键作用的方法就是做Mulliken population analysis，直接看键布局数或原子布局数，但据说这种方法已经有些过时了。
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5楼2012-04-20 23:07:48
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silikiwi

金虫 (小有名气)
★ ★
sunyang1988: 金币+2, 谢谢帮助 2012-07-19 22:45:46
引用回帖:
7楼: Originally posted by wife332020 at 2012-07-14 20:16:37
请问这么漂亮的图是怎么做出来的啊？望指教，谢谢！！

这是做的差分电荷密度分析，用来比较直观的比较各原子的电子得失，但好像大多文章里边做的不是差分电荷图，而是直接做电荷密度图，不过方法是一样的。
可以在结构优化完成后，选择energy或properties里边的electron density一项进行运算，对话框下边有差分电荷密度计算的选项。计算完成后analysis→electron density→import，然后右键→display style，在isosurface一项里可以设置你要分析的原子面，在右键→color maps里边可以调节color mapping值来达到想要的色彩值区分效果。
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9楼2012-07-19 12:08:43
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anlen0615

银虫 (小有名气)
“在isosurface一项里可以设置你要分析的原子面”

楼上说 设置你要分析的原子面   怎么弄？没有分析原子面的选项哈
  请大侠赐教！  感谢万分！
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厚积而薄发！
13楼2012-09-20 11:29:32
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普通回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+1, 谢谢回帖交流！ 2012-04-07 19:01:17
silikiwi: 金币+5, ★有帮助, 谢谢 2012-04-07 22:19:43
可以按照您的理解进行分析啊，通过得失电子来研究相关变化，分析相关机理是很好的方法
能不能详细介绍一下这几幅图的含义？

[ Last edited by uuv2010 on 2012-4-7 at 19:10 ]
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2楼2012-04-07 18:40:26
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silikiwi

金虫 (小有名气)
★ ★
fzx2008: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-08 12:17:28
引用回帖:
2楼: Originally posted by uuv2010 at 2012-04-07 18:40:26:
可以按照您的理解进行分析啊，通过得失电子来研究相关变化，分析相关机理是很好的方法
能不能详细介绍一下这几幅图的含义？

是在晶硅中掺杂替代位的P原子，通过能量比较来判断P与间隙位的氧原子的相互作用及其相互作用对体系能量的影响。
最下边两幅图是P和O分别在第一和第二近邻位时的差分电荷密度。P-O直接键合时体系是不稳定的；而在第二近邻位键合时体系稳定。
P-O的相互作用导致体系能量变化及稳定性的差异肯定是与P，Si，O原子相互作用时的电荷相互作用相关的。问题是如何把图中电荷转移与体系稳定性联系起来。
我是初次做这种图，物理基础也比较薄弱，所以分析起来比较困难。
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3楼2012-04-07 22:24:01
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s20080718

金虫 (著名写手)

发现问题、分析问题、解决问题

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+1, 鼓励交流 2012-05-08 12:17:19
图做的很好很清晰，我是看文献就看不懂，希望高人闲暇时来解释，相互学习，帮楼主顶一个！
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解决问题的关键在于大家一起用心交流！
4楼2012-04-09 10:51:18
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呀呀

金虫 (正式写手)
求教，lz这个电荷密度图是怎么画的？能否说明一下？
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6楼2012-05-08 11:10:08
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wife332020

铁虫 (小有名气)
xueht987: 应助指数-1, 无应助请不要点应助回帖！ 2012-07-15 09:45:41
请问这么漂亮的图是怎么做出来的啊？望指教，谢谢！！
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7楼2012-07-14 20:16:37
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谷子超

金虫 (小有名气)
请问楼主 你这个图是怎么画的，用的什么软件，ms里需要哪个文件，感激不尽~
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8楼2012-07-17 08:45:50
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silikiwi

金虫 (小有名气)
★ ★
sunyang1988: 金币+2, 谢谢交流 2012-07-20 10:15:53
引用回帖:
8楼: Originally posted by 谷子超 at 2012-07-17 08:45:50
请问楼主 你这个图是怎么画的，用的什么软件，ms里需要哪个文件，感激不尽~

这是做的差分电荷密度分析，用来比较直观的比较各原子的电子得失，但好像大多文章里边做的不是差分电荷图，而是直接做电荷密度图，不过方法是一样的。
可以在结构优化完成后，选择energy或properties里边的electron density一项进行运算，对话框下边有差分电荷密度计算的选项。计算完成后analysis→electron density→import，然后右键→display style，在isosurface一项里可以设置你要分析的原子面，在右键→color maps里边可以调节color mapping值来达到想要的色彩值区分效果。
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10楼2012-07-19 12:09:08
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