应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】求助差分电荷密度的脚本！
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
461/1返回列表
查看: 5900  |  回复: 45
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

haowenping

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】求助差分电荷密度的脚本！

各位大虾，本人最近一直想找一个处理查分电荷密度的脚本，有的希望大家发一个给我。顺便说一下我的做差分电荷密度的方法不知道这样是不是行：我做的也是吸附，首先我做了一次静态计算，里面没有设置NGFX,NGFY,NGFZ参数。下一步我就是把这四个输入文件放到一个文件夹下面，只是修改了其中的INCAR的ICHARG=12，同样并没有设置NGFX,NGFY,NGFZ参数，这样又得到了一个CHACAR。不知道这样可不可以希望大家给点建议，很是感激了，我也很急。如果我这个方法是对的希望，有人能发一个处理这个的脚本，我的邮箱是hwp22651304@163.com。收到后重金感谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-04-13 08:51:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

enola

捐助贵宾 (正式写手)
★ ★
haowenping(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 谢谢指教 2011-04-13 22:33:51
haowenping(金币+2): 非常感谢，这个是不是要在linux下安装？ 2011-04-14 08:54:43
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-13 08:51:38:
各位大虾，本人最近一直想找一个处理查分电荷密度的脚本，有的希望大家发一个给我。顺便说一下我的做差分电荷密度的方法不知道这样是不是行：我做的也是吸附，首先我做了一次静态计算，里面没有设置NGFX,NGFY,NGF ...

lev00在下面链接：
http://www.cmmp.ucl.ac.uk/~lev/codes/lev00/index.html
安装钱要先安装ifort和icc
安装好运行lev00，就会有选项，是计算两个CHGCAR的差值的。
我想是应该把NGFX， NGFY， NGFZ固定
赞一下(4人) 回复此楼
5楼2011-04-13 16:54:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songdewang

金虫 (小有名气)
★ ★
haowenping(金币+10): 谢谢！你传个好用的给我吧！ 2011-04-14 08:55:42
zzy870720z(金币+2): 谢谢详细指点 2011-04-14 09:03:32
引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-13 16:29:55:
你用lev00或者origin将两个CHGCAR文件相减即可

方法1，将OUTCAR、POSCAR、CHGCAR-a、CHGCAR-b存在一个目录，在该目录下运行lev00，然后根据提示选择V（vasp），OUTCAR、POSCAR、然后就是M，然后进去好像是第六项就是做差值的。我们平时画面电荷密度用的是D！
方法2，在origin下面建立一个worksheet，第一列和第二列是电荷密度的坐标值，第三列是CHGCAR-a的电荷密度值，第四列是CHGCAR-b的电荷密度值，然后第五列你设置为第三列与第四列的差就行了
赞一下(2人) 回复此楼
8楼2011-04-14 08:25:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
怎么都没人回答下吗？自己顶一下！
赞一下 回复此楼
2楼2011-04-13 14:48:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songdewang

金虫 (小有名气)
★ ★
haowenping(金币+1):谢谢参与
haowenping(金币+2): 谢谢！还望给出更多的提示！ 2011-04-13 16:35:51
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-04-13 22:33:38
你用lev00或者origin将两个CHGCAR文件相减即可
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2011-04-13 16:29:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-13 16:29:55:
你用lev00或者origin将两个CHGCAR文件相减即可

你好，你能否发个lev00给我呢？我有origin但是不知道怎么用啊，我知道是要将2个CHGCAR相减，只是不会处理啊！希望能详细点！
赞一下 回复此楼
4楼2011-04-13 16:35:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bird007

荣誉版主 (职业作家)
★ ★
haowenping(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-04-13 22:34:07
haowenping(金币+2): 非常感谢！ 2011-04-14 08:55:02
论坛里有VESTA处理的，你搜下
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2011-04-13 17:33:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songdewang

金虫 (小有名气)
你先去网站下载，没有的话我给你传一个
赞一下 回复此楼
9楼2011-04-14 08:39:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-14 08:39:09:
你先去网站下载，没有的话我给你传一个

希望你能传个给我，我的邮箱是hwp22651304@163.com，真的很感激了！
赞一下 回复此楼
10楼2011-04-14 08:56:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-14 08:25:30:
方法1，将OUTCAR、POSCAR、CHGCAR-a、CHGCAR-b存在一个目录，在该目录下运行lev00，然后根据提示选择V（vasp），OUTCAR、POSCAR、然后就是M，然后进去好像是第六项就是做差值的。我们平时画面电荷密度用的是D！ ...

你好，我的步骤是这样的，先算了一次静态自洽计算，建了一个scf文件夹，然后呢，又算了一次非静态自洽，文件夹是suf，只是呢，我该用哪个OUTCAR？期待你的回答，不甚感激！
赞一下 回复此楼
11楼2011-04-14 09:25:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songdewang

金虫 (小有名气)
haowenping(金币+5): 谢谢了！收到了，哈哈！ 2011-04-14 13:02:16
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-14 08:56:06:
希望你能传个给我，我的邮箱是hwp22651304@163.com，真的很感激了！

已经发送了
回复此楼
12楼2011-04-14 10:53:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songdewang

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-14 09:25:43:
你好，我的步骤是这样的，先算了一次静态自洽计算，建了一个scf文件夹，然后呢，又算了一次非静态自洽，文件夹是suf，只是呢，我该用哪个OUTCAR？期待你的回答，不甚感激！

我觉得应该用静态计算的OUTCAR，你再问问旁人
赞一下(1人) 回复此楼
13楼2011-04-14 10:55:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-14 10:53:51:
已经发送了

很感谢，谢谢你！
回复此楼
14楼2011-04-14 13:02:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔火江枫

金虫 (小有名气)
★
haowenping(金币+1):谢谢参与
haowenping(金币+5): 2011-04-14 16:53:55
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2129228
这个方法比较容易
赞一下(1人) 回复此楼
15楼2011-04-14 15:55:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-14 15:55:48:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2129228
这个方法比较容易

谢谢！他说的这个方法好像就是跟这个还是差不多的，他也让用lev00。只是我现在还在摸索着，怎么用这个！不知道你是否有lev00的手册什么的，能否发一下吗？
赞一下 回复此楼
16楼2011-04-14 16:13:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-14 10:55:06:
我觉得应该用静态计算的OUTCAR，你再问问旁人

你好，我还是想问下你，我把lev00安装上了，不知道你有没有lev00的说明方法的，能否分享下吗？我现在想画画图什么的！
赞一下 回复此楼
17楼2011-04-14 16:15:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔火江枫

金虫 (小有名气)
★
haowenping(金币+5): 非常感谢！ 2011-04-14 16:25:51
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-04-14 19:30:35
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-14 16:13:18:
谢谢！他说的这个方法好像就是跟这个还是差不多的，他也让用lev00。只是我现在还在摸索着，怎么用这个！不知道你是否有lev00的手册什么的，能否发一下吗？

那个帖子是我写的，做2D的图可以有两种方法，VESTA在windows下处理，点点鼠标就可以，缺点是标尺没有刻度值，lev00在linux环境下，而且用命令处理，再用origin作图，比较复杂，适合经验丰富的去做，暂时不用摸索lev00了。用VESTA一般可以满足要求，另外emuch还有一个方法处理CHGCAR在MS里可以视图http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2382900&fpage=1
赞一下(1人) 回复此楼
18楼2011-04-14 16:21:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-14 16:21:38:
那个帖子是我写的，做2D的图可以有两种方法，VESTA在windows下处理，点点鼠标就可以，缺点是标尺没有刻度值，lev00在linux环境下，而且用命令处理，再用origin作图，比较复杂，适合经验丰富的去做，暂时不用摸索 ...

你好，谢谢你的回答，像你说的那样，用VESTA的时候，就能很好的用吗？你能否发一个给我？还有你现在都是用什么画图的呢？如果你是用lev00画图，那我还是希望我能用它来画图，所以希望有些什么问题就问问你！
赞一下 回复此楼
19楼2011-04-14 16:28:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-14 16:21:38:
那个帖子是我写的，做2D的图可以有两种方法，VESTA在windows下处理，点点鼠标就可以，缺点是标尺没有刻度值，lev00在linux环境下，而且用命令处理，再用origin作图，比较复杂，适合经验丰富的去做，暂时不用摸索 ...

还有，刚才那个在ms下面处理的情况的那个不能下载，能否发个给我？我的邮箱是hwp22651304@163.com.谢了！
赞一下 回复此楼
20楼2011-04-14 16:30:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-14 15:55:48:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2129228
这个方法比较容易

你好，我按照你说的那个方法做了下，下面是我在做静态自洽时候设置的一些参数：SYSTEM=AAAAA
ENCUT=650
ISTART=0
ICHARG=2
ISMEAR=0
SIGMA=0.2
ISPIN=2
PREC=A
LREAL=Auto
NELM=200
NELMDL=-5
NELMIN=2
EDIFF=1E-6
NGX=82
NGY=82
NGZ=179
NGXF=164
NGYF=164
NGZF=358

NSIM=4
NELMIN=4

#IBRION=1
#ISIF=4
#EDIFFG=-0.01
#NSW=200
LCHARG=.T.
LWAVE=.T.
然后按照你说的那样做了一次非静态自洽计算，我只是改变了一下这个参数里的ICHARG，把它设置为12。不知道这样坐行不行，希望得到你的指点！感激涕零了
赞一下 回复此楼
21楼2011-04-14 16:56:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songdewang

金虫 (小有名气)
haowenping(金币+2): 谢谢了！ 2011-04-14 21:17:36
嗯，我给你传一个说明的PDF。其实你运行lev00，按照提示操作一步步往下就可以了！
赞一下 回复此楼
22楼2011-04-14 20:51:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-14 20:51:05:
嗯，我给你传一个说明的PDF。其实你运行lev00，按照提示操作一步步往下就可以了！

谢谢你了！
回复此楼
23楼2011-04-14 21:17:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔火江枫

金虫 (小有名气)
★
franch(金币+1): 鼓励交流 2011-04-15 20:44:51
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-14 16:30:19:
还有，刚才那个在ms下面处理的情况的那个不能下载，能否发个给我？我的邮箱是hwp22651304@163.com.谢了！

软件发给你了，请查收
赞一下(1人) 回复此楼
24楼2011-04-15 11:10:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔火江枫

金虫 (小有名气)
★
haowenping(金币+20): 非常感谢！ 2011-04-15 14:51:03
franch(金币+1): 谢谢指点 2011-04-15 20:45:08
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-14 16:56:44:
你好，我按照你说的那个方法做了下，下面是我在做静态自洽时候设置的一些参数：SYSTEM=AAAAA
ENCUT=650
ISTART=0
ICHARG=2
ISMEAR=0
SIGMA=0.2
ISPIN=2
PREC=A
LREAL=Auto
NELM=200
NELMDL=-5
NELMI ...

不知道你做的什么体系，方面说吗？我个人认为体系不同采用的方法要略有不同。比如做表面物种的吸附，基底不能非自洽计算，所以电荷做差的公式要改成：Slab_ads -  ads  -  Slab_clean  ,你要得到三个CHGCAR，然后依次做差。
赞一下(1人) 回复此楼
25楼2011-04-15 11:19:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 11:19:04:
不知道你做的什么体系，方面说吗？我个人认为体系不同采用的方法要略有不同。比如做表面物种的吸附，基底不能非自洽计算，所以电荷做差的公式要改成：Slab_ads -  ads  -  Slab_clean  ,你要得到三个CHGCAR，然 ...

你好，非常感谢你！真的，我做的是表面吸附，请你建议下，我应该用那个做的比较好？谢谢！
赞一下 回复此楼
26楼2011-04-15 14:54:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔火江枫

金虫 (小有名气)
★
haowenping(金币+10): 谢谢！ 2011-04-15 15:45:26
franch(金币+1): 谢谢指点 2011-04-15 20:45:22
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-15 14:54:07:
你好，非常感谢你！真的，我做的是表面吸附，请你建议下，我应该用那个做的比较好？谢谢！

如果是想得到表面吸附物种与基底原子的成键，需要三个CHGCAR：CHGCAR1 是吸附物种和基底优化后做单点得到，CHGCAR2是把CONCAR中基底原子删掉，并相应修改INCAR，POTCAR，只算单点得到，CHGCAR3，把CONTCAR中吸附分子删掉，同样修改INCAR，POTCAR，再做单点得到（注意：后面两个的INCAR 中要增加NGFX,NGFY,NGFZ，与第一个计算保持一样）。然后，将三个CHGCAR做差得到CHGDIFF。最后，处理CHGDIFF有多种方法，最简单的是用VESTA（这个没有教程，自己摸索），第二个方法可以用lev00，配合origin做图，lev00教程里有这个方法的说明。第三个方法用emuch上流传的MS读取charge density的方法做（emuch搜索）。
赞一下(1人) 回复此楼
27楼2011-04-15 15:23:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 15:23:18:
如果是想得到表面吸附物种与基底原子的成键，需要三个CHGCAR：CHGCAR1 是吸附物种和基底优化后做单点得到，CHGCAR2是把CONCAR中基底原子删掉，并相应修改INCAR，POTCAR，只算单点得到，CHGCAR3，把CONTCAR中吸附 ...

你好，谢谢你的回答，我还想问下：也就是说，我先总体的做了一次静态自洽计算。得到了CHGCAR1，然后呢，我把吸附原子去掉只剩下基底原子了，此时，我是要改变POTCAR的，但是INCAR中是要设置NGXF，NGYF,NGZF参数的，这些参数应该怎么设置？有什么标准没？如果把他设置成为NGX，NGY,NGZ的2倍行不行？这样得到了CHGCAR2文件。第三步就是把基底原子都删除，只做吸附原子的静态计算，（如果我只吸附了一个原子，是不是就只用这一个原子的静态计算），此时的INCAR中，我是不是直接用第二步的INCAR文件中设置的参数？这样我就得到了CHGCAR3。我还想问下，应该怎么将这三个电荷作差呢？怎么才能得到你说的那个CHGDIFF文件呢？希望继续指教，谢谢！
赞一下 回复此楼
28楼2011-04-15 15:59:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔火江枫

金虫 (小有名气)
★
franch(金币+1): 鼓励交流 2011-04-15 20:45:43
haowenping(金币+5): 谢谢！ 2011-04-15 21:30:12
haowenping(金币+5): 谢谢,只是我又遇到了新的问题，希望你能帮忙解决下！ 2011-04-16 09:05:34
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-15 15:59:36:
你好，谢谢你的回答，我还想问下：也就是说，我先总体的做了一次静态自洽计算。得到了CHGCAR1，然后呢，我把吸附原子去掉只剩下基底原子了，此时，我是要改变POTCAR的，但是INCAR中是要设置NGXF，NGYF,NGZF参数 ...

NGXF，NGYF,NGZF由第一个CHGCAR读取，分别写在后两个INCAR中，做差的方法原理是矩阵相减，具体的脚本你可以在网上找一下，好像http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/#DOS，有perl的脚本，试试看吧
赞一下(1人) 回复此楼
29楼2011-04-15 19:00:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 19:00:33:
NGXF，NGYF,NGZF由第一个CHGCAR读取，分别写在后两个INCAR中，做差的方法原理是矩阵相减，具体的脚本你可以在网上找一下，好像http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/#DOS，有perl的脚本， ...

谢谢你！谢谢指教了！都是很实用的东西！
赞一下 回复此楼
30楼2011-04-15 21:30:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stractor

金虫 (著名写手)
★ ★
haowenping(金币+1):谢谢参与
sunyang1988(金币+1): 谢谢交流 2011-04-16 10:14:22
呵呵，我还是用oringin处理。原来软件做的图比我的漂亮。
赞一下(2人) 回复此楼
31楼2011-04-16 05:34:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 19:00:33:
NGXF，NGYF,NGZF由第一个CHGCAR读取，分别写在后两个INCAR中，做差的方法原理是矩阵相减，具体的脚本你可以在网上找一下，好像http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/#DOS，有perl的脚本， ...

你好，我想问你下，怎么将从CHGCAR中读出NGXF,NGYF,NGZF？如果我现在读出了NG（X,Y,Z)F,那么我只用将他们设置在INCAR中，计算的时候分别改一下POTCAR文件，然后将得到的CHGCAR1，CHGCAR2，CHGCAR3文件放一个目录下，用chgdiff.pl CHGCAR1 CHGCAR2 CHGCAR3就ok了吗？
赞一下 回复此楼
32楼2011-04-16 08:26:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 19:00:33:
NGXF，NGYF,NGZF由第一个CHGCAR读取，分别写在后两个INCAR中，做差的方法原理是矩阵相减，具体的脚本你可以在网上找一下，好像http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/#DOS，有perl的脚本， ...

你好，我下载了个chgdiff.pl，但是我应该怎么用呢？你说的chgdiff.pl chargcar1 chgcar2，但是我应该怎么样运行这个呢？在什么系统下运行呢？是在dos下，还是在linux下？在linux下我又该如何，安装上这个命令呢？希望你能回答下，谢谢！
赞一下 回复此楼
33楼2011-04-16 09:05:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔火江枫

金虫 (小有名气)
★
sunyang1988(金币+1): 谢谢指点 2011-04-16 10:14:41
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-16 09:05:46:
你好，我下载了个chgdiff.pl，但是我应该怎么用呢？你说的chgdiff.pl chargcar1 chgcar2，但是我应该怎么样运行这个呢？在什么系统下运行呢？是在dos下，还是在linux下？在linux下我又该如何，安装上这个命令呢 ...

这个脚本是perl模块下的，linux下很容易
赞一下(1人) 回复此楼
34楼2011-04-16 09:49:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-16 09:49:12:
这个脚本是perl模块下的，linux下很容易

你好，谢谢你的回答！只是能不能详细点呢？在linux下具体要些什么样的操作呢？我是不是要下载一个linux下的perl？
赞一下 回复此楼
35楼2011-04-16 10:12:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★
haowenping(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-16 10:12:19:
你好，谢谢你的回答！只是能不能详细点呢？在linux下具体要些什么样的操作呢？我是不是要下载一个linux下的perl？

一般的linux系统都能直接运行
赞一下(1人) 回复此楼
36楼2011-04-16 10:15:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2011-04-16 10:15:05:
一般的linux系统都能直接运行

版主你好，谢谢你！只是我想在linux下怎么就不能直接用呢？直接用了chgdiff.pl的时候没能够直接用的呀！说命令没找到，急求！
赞一下 回复此楼
37楼2011-04-16 11:19:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
haowenping(金币+3): 谢谢了！ 2011-04-16 14:51:43
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-16 11:19:27:
版主你好，谢谢你！只是我想在linux下怎么就不能直接用呢？直接用了chgdiff.pl的时候没能够直接用的呀！说命令没找到，急求！

有什么错误提示吗
赞一下 回复此楼
38楼2011-04-16 14:09:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2011-04-16 14:09:51:
有什么错误提示吗

谢谢你的回答，错误提示是这样的，command not found!请问是不是我的linux下没有这个？我用的是fedora！
赞一下 回复此楼
39楼2011-04-16 14:50:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
haowenping(金币+3): 谢谢！ 2011-04-16 16:42:51
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-16 14:50:53:
谢谢你的回答，错误提示是这样的，command not found!请问是不是我的linux下没有这个？我用的是fedora！

你没有把chgidff.pl的路径添加到.bashrc中，不然就直接给出绝对路径运行
赞一下 回复此楼
40楼2011-04-16 15:48:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2011-04-16 15:48:43:
你没有把chgidff.pl的路径添加到.bashrc中，不然就直接给出绝对路径运行

谢谢sunyang版主，这个确实是的，我并没有把chgdiff.pl添加到.bashrc下面，但是如果我要把他添加到.bashrc下面，该怎么做，还有，你说的直接给出绝对路径又是怎么一个情况。我把chgdiff.pl放在/home/charge下，我该如何用你说的绝对路径运行呢？
赞一下 回复此楼
41楼2011-04-16 16:42:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渔火江枫

金虫 (小有名气)
★
sunyang1988(金币+1): 谢谢提示 2011-04-16 17:53:34
haowenping(金币+2): 谢谢！ 2011-04-17 10:20:05
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-16 16:42:34:
谢谢sunyang版主，这个确实是的，我并没有把chgdiff.pl添加到.bashrc下面，但是如果我要把他添加到.bashrc下面，该怎么做，还有，你说的直接给出绝对路径又是怎么一个情况。我把chgdiff.pl放在/home/charge下， ...

你可以把chgdiff.pl和CHGCAR放在同一个目录下，用perl chgdiff.pl 执行命令试一试
赞一下(1人) 回复此楼
42楼2011-04-16 17:45:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
haowenping(金币+2): 谢谢！ 2011-04-17 10:20:16
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-16 16:42:34:
谢谢sunyang版主，这个确实是的，我并没有把chgdiff.pl添加到.bashrc下面，但是如果我要把他添加到.bashrc下面，该怎么做，还有，你说的直接给出绝对路径又是怎么一个情况。我把chgdiff.pl放在/home/charge下， ...

把路径添加到.bashrc 然后source .bashrc就可以了
赞一下 回复此楼
43楼2011-04-16 17:54:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CXC_小草

银虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by songdewang at 2011-04-13 16:29:55:
你用lev00或者origin将两个CHGCAR文件相减即可

请问可以传一份lev00安装包及安装教程吗，xiexie !以前有一份2.46版本的，但对这侯爷爷的教程一直安装不成功!我的邮箱：cxcxiaocao@163.com，谢谢！
赞一下(1人) 回复此楼
44楼2011-11-16 16:07:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CXC_小草

银虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
27楼: Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 15:23:18:
如果是想得到表面吸附物种与基底原子的成键，需要三个CHGCAR：CHGCAR1 是吸附物种和基底优化后做单点得到，CHGCAR2是把CONCAR中基底原子删掉，并相应修改INCAR，POTCAR，只算单点得到，CHGCAR3，把CONTCAR中吸附 ...

前辈你好，关于lev00，同学给我传了个2.46版本的，我根据侯爷爷的lev00处理电荷密度的教程，在进行安装变异的时候，运行lev00.comp生成可执行的lev00程序的时候老是出错说什么tools_strings出错，不知道怎么回事，很是无助，后面的工作也做不下去，内心一片惶恐，求前辈指导，或传一份lev00的安装包及安装教程，邮箱：cxcxiaocao@163.com,万分感谢！
赞一下(1人) 回复此楼
45楼2011-11-16 16:16:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

问天麦饼

捐助贵宾 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
27楼: Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 15:23:18
如果是想得到表面吸附物种与基底原子的成键，需要三个CHGCAR：CHGCAR1 是吸附物种和基底优化后做单点得到，CHGCAR2是把CONCAR中基底原子删掉，并相应修改INCAR，POTCAR，只算单点得到，CHGCAR3，把CONTCAR中吸附分 ...

你好，我想问下，如果是想看形成界面后电荷的转移，做CHGCAR2,CHGCAR3的时候，输入文件还是界面结构优化后的CONTCAR吗？是不是应该为单独优化衬底（或者吸附层）的CONTCAR？
赞一下 回复此楼
46楼2014-04-22 18:51:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
xksong19826楼
2011-04-13 17:09   回复  
haowenping(金币+1):谢谢参与
bingmou(金币-1): 2011-04-13 19:02:42
相关版块跳转 我要订阅楼主 haowenping 的主题更新
461/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 346分的生物与医药08600求调剂 +5 常雨阳上岸 2026-04-05 6/300 2026-04-05 13:42 by imissbao
[考研] 生物与医药调剂 +3 十七sa 2026-04-05 3/150 2026-04-05 13:28 by jp9609
[考研] 调剂 +3 好好读书。 2026-04-02 3/150 2026-04-05 13:02 by arrow8852
[考研] 生物学308分求调剂（一志愿华东师大） +8 相信必会光芒万� 2026-04-05 10/500 2026-04-05 12:19 by Hdyxbekcb
[考研] 0703化学调剂325分 +9 15771691647 2026-04-04 9/450 2026-04-05 11:39 by 猪会飞
[考研] 电子信息调剂交叉学科有推荐吗 +6 jhtfeybgj 2026-04-01 9/450 2026-04-05 11:13 by 猪会飞
[考研] 化学357分，考研调剂 +10 .Starry. 2026-04-04 11/550 2026-04-05 10:57 by cql1109
[考研] 求调剂 +7 xzghyuj 2026-04-04 7/350 2026-04-04 22:25 by oooqiao
[考研] [调剂信息]085408光电信息 求调剂 总分291分数一英一 +3 iz11az 2026-04-02 3/150 2026-04-04 19:09 by 蓝云思雨
[考研] 土木304求调剂 +4 兔突突突， 2026-03-31 4/200 2026-04-04 13:34 by 1753564080
[考研] 320求调剂 +3 农业工程与信息� 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:40 by 土木硕士招生
[考研] 319求调剂 +18 太容易1018 2026-04-01 18/900 2026-04-03 11:18 by linyelide
[考研] 274求调剂 +10 薛定谔的虎。 2026-04-01 10/500 2026-04-03 10:13 by tianyyysss
[考研] 312求调剂 +6 小小墨123 2026-04-02 7/350 2026-04-03 07:32 by jsw79
[考博] 材料工程专业硕士申博 +3 麟正宇 2026-03-30 3/150 2026-04-02 15:04 by greychen00
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-04-02 4/200 2026-04-02 13:03 by yulian1987
[考研] 298求调剂 +4 什么是胖头鱼 2026-03-30 6/300 2026-04-01 22:06 by 客尔美德
[考研] 085600 一志愿9 总分351 求调剂学校 +7 czhcz 2026-03-31 9/450 2026-04-01 19:24 by 无际的草原
[考研] 合肥区域性重点一本招收调剂 +4 6266jl 2026-03-30 8/400 2026-03-31 18:43 by 6266jl
[考研] 269求调剂 +4 我想读研11 2026-03-31 4/200 2026-03-31 10:04 by cal0306
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭