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haowenping

木虫 (著名写手)


[交流] 【求助】求助差分电荷密度的脚本!

各位大虾,本人最近一直想找一个处理查分电荷密度的脚本,有的希望大家发一个给我。顺便说一下我的做差分电荷密度的方法不知道这样是不是行:我做的也是吸附,首先我做了一次静态计算,里面没有设置NGFX,NGFY,NGFZ参数。下一步我就是把这四个输入文件放到一个文件夹下面,只是修改了其中的INCAR的ICHARG=12,同样并没有设置NGFX,NGFY,NGFZ参数,这样又得到了一个CHACAR。不知道这样可不可以希望大家给点建议,很是感激了,我也很急。如果我这个方法是对的希望,有人能发一个处理这个的脚本,我的邮箱是hwp22651304@163.com。收到后重金感谢!
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enola

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★ ★
haowenping(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 谢谢指教 2011-04-13 22:33:51
haowenping(金币+2): 非常感谢,这个是不是要在linux下安装? 2011-04-14 08:54:43
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-13 08:51:38:
各位大虾,本人最近一直想找一个处理查分电荷密度的脚本,有的希望大家发一个给我。顺便说一下我的做差分电荷密度的方法不知道这样是不是行:我做的也是吸附,首先我做了一次静态计算,里面没有设置NGFX,NGFY,NGF ...

lev00在下面链接:
http://www.cmmp.ucl.ac.uk/~lev/codes/lev00/index.html
安装钱要先安装ifort和icc
安装好运行lev00,就会有选项,是计算两个CHGCAR的差值的。
我想是应该把NGFX, NGFY, NGFZ固定
5楼2011-04-13 16:54:47
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songdewang

金虫 (小有名气)


★ ★
haowenping(金币+10): 谢谢!你传个好用的给我吧! 2011-04-14 08:55:42
zzy870720z(金币+2): 谢谢详细指点 2011-04-14 09:03:32
引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-13 16:29:55:
你用lev00或者origin将两个CHGCAR文件相减即可

方法1,将OUTCAR、POSCAR、CHGCAR-a、CHGCAR-b存在一个目录,在该目录下运行lev00,然后根据提示选择V(vasp),OUTCAR、POSCAR、然后就是M,然后进去好像是第六项就是做差值的。我们平时画面电荷密度用的是D!
方法2,在origin下面建立一个worksheet,第一列和第二列是电荷密度的坐标值,第三列是CHGCAR-a的电荷密度值,第四列是CHGCAR-b的电荷密度值,然后第五列你设置为第三列与第四列的差就行了
8楼2011-04-14 08:25:30
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普通回帖

haowenping

木虫 (著名写手)


怎么都没人回答下吗?自己顶一下!
2楼2011-04-13 14:48:04
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songdewang

金虫 (小有名气)


★ ★
haowenping(金币+1):谢谢参与
haowenping(金币+2): 谢谢!还望给出更多的提示! 2011-04-13 16:35:51
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-04-13 22:33:38
你用lev00或者origin将两个CHGCAR文件相减即可
3楼2011-04-13 16:29:55
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-13 16:29:55:
你用lev00或者origin将两个CHGCAR文件相减即可

你好,你能否发个lev00给我呢?我有origin但是不知道怎么用啊,我知道是要将2个CHGCAR相减,只是不会处理啊!希望能详细点!
4楼2011-04-13 16:35:32
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bird007

荣誉版主 (职业作家)


★ ★
haowenping(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-04-13 22:34:07
haowenping(金币+2): 非常感谢! 2011-04-14 08:55:02
论坛里有VESTA处理的,你搜下
7楼2011-04-13 17:33:46
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songdewang

金虫 (小有名气)


你先去网站下载,没有的话我给你传一个
9楼2011-04-14 08:39:09
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-14 08:39:09:
你先去网站下载,没有的话我给你传一个

希望你能传个给我,我的邮箱是hwp22651304@163.com,真的很感激了!
10楼2011-04-14 08:56:06
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-14 08:25:30:
方法1,将OUTCAR、POSCAR、CHGCAR-a、CHGCAR-b存在一个目录,在该目录下运行lev00,然后根据提示选择V(vasp),OUTCAR、POSCAR、然后就是M,然后进去好像是第六项就是做差值的。我们平时画面电荷密度用的是D! ...

你好,我的步骤是这样的,先算了一次静态自洽计算,建了一个scf文件夹,然后呢,又算了一次非静态自洽,文件夹是suf,只是呢,我该用哪个OUTCAR?期待你的回答,不甚感激!
11楼2011-04-14 09:25:43
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songdewang

金虫 (小有名气)


haowenping(金币+5): 谢谢了!收到了,哈哈! 2011-04-14 13:02:16
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-14 08:56:06:
希望你能传个给我,我的邮箱是hwp22651304@163.com,真的很感激了!

已经发送了
12楼2011-04-14 10:53:51
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songdewang

金虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-14 09:25:43:
你好,我的步骤是这样的,先算了一次静态自洽计算,建了一个scf文件夹,然后呢,又算了一次非静态自洽,文件夹是suf,只是呢,我该用哪个OUTCAR?期待你的回答,不甚感激!

我觉得应该用静态计算的OUTCAR,你再问问旁人
13楼2011-04-14 10:55:06
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-14 10:53:51:
已经发送了

很感谢,谢谢你!
14楼2011-04-14 13:02:31
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渔火江枫

金虫 (小有名气)



haowenping(金币+1):谢谢参与
haowenping(金币+5): 2011-04-14 16:53:55
15楼2011-04-14 15:55:48
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-14 15:55:48:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2129228
这个方法比较容易

谢谢!他说的这个方法好像就是跟这个还是差不多的,他也让用lev00。只是我现在还在摸索着,怎么用这个!不知道你是否有lev00的手册什么的,能否发一下吗?
16楼2011-04-14 16:13:18
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-14 10:55:06:
我觉得应该用静态计算的OUTCAR,你再问问旁人

你好,我还是想问下你,我把lev00安装上了,不知道你有没有lev00的说明方法的,能否分享下吗?我现在想画画图什么的!
17楼2011-04-14 16:15:33
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渔火江枫

金虫 (小有名气)



haowenping(金币+5): 非常感谢! 2011-04-14 16:25:51
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-04-14 19:30:35
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-14 16:13:18:
谢谢!他说的这个方法好像就是跟这个还是差不多的,他也让用lev00。只是我现在还在摸索着,怎么用这个!不知道你是否有lev00的手册什么的,能否发一下吗?

那个帖子是我写的,做2D的图可以有两种方法,VESTA在windows下处理,点点鼠标就可以,缺点是标尺没有刻度值,lev00在linux环境下,而且用命令处理,再用origin作图,比较复杂,适合经验丰富的去做,暂时不用摸索lev00了。用VESTA一般可以满足要求,另外emuch还有一个方法处理CHGCAR在MS里可以视图http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2382900&fpage=1
18楼2011-04-14 16:21:38
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-14 16:21:38:
那个帖子是我写的,做2D的图可以有两种方法,VESTA在windows下处理,点点鼠标就可以,缺点是标尺没有刻度值,lev00在linux环境下,而且用命令处理,再用origin作图,比较复杂,适合经验丰富的去做,暂时不用摸索 ...

你好,谢谢你的回答,像你说的那样,用VESTA的时候,就能很好的用吗?你能否发一个给我?还有你现在都是用什么画图的呢?如果你是用lev00画图,那我还是希望我能用它来画图,所以希望有些什么问题就问问你!
19楼2011-04-14 16:28:53
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-14 16:21:38:
那个帖子是我写的,做2D的图可以有两种方法,VESTA在windows下处理,点点鼠标就可以,缺点是标尺没有刻度值,lev00在linux环境下,而且用命令处理,再用origin作图,比较复杂,适合经验丰富的去做,暂时不用摸索 ...

还有,刚才那个在ms下面处理的情况的那个不能下载,能否发个给我?我的邮箱是hwp22651304@163.com.谢了!
20楼2011-04-14 16:30:19
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-14 15:55:48:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2129228
这个方法比较容易

你好,我按照你说的那个方法做了下,下面是我在做静态自洽时候设置的一些参数:SYSTEM=AAAAA
ENCUT=650
ISTART=0
ICHARG=2
ISMEAR=0
SIGMA=0.2
ISPIN=2
PREC=A
LREAL=Auto
NELM=200
NELMDL=-5
NELMIN=2
EDIFF=1E-6
NGX=82
NGY=82
NGZ=179
NGXF=164
NGYF=164
NGZF=358

NSIM=4
NELMIN=4

#IBRION=1
#ISIF=4
#EDIFFG=-0.01
#NSW=200
LCHARG=.T.
LWAVE=.T.
然后按照你说的那样做了一次非静态自洽计算,我只是改变了一下这个参数里的ICHARG,把它设置为12。不知道这样坐行不行,希望得到你的指点!感激涕零了
21楼2011-04-14 16:56:44
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songdewang

金虫 (小有名气)


haowenping(金币+2): 谢谢了! 2011-04-14 21:17:36
嗯,我给你传一个说明的PDF。其实你运行lev00,按照提示操作一步步往下就可以了!
22楼2011-04-14 20:51:05
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by songdewang at 2011-04-14 20:51:05:
嗯,我给你传一个说明的PDF。其实你运行lev00,按照提示操作一步步往下就可以了!

谢谢你了!
23楼2011-04-14 21:17:57
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渔火江枫

金虫 (小有名气)



franch(金币+1): 鼓励交流 2011-04-15 20:44:51
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-14 16:30:19:
还有,刚才那个在ms下面处理的情况的那个不能下载,能否发个给我?我的邮箱是hwp22651304@163.com.谢了!

软件发给你了,请查收
24楼2011-04-15 11:10:09
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渔火江枫

金虫 (小有名气)



haowenping(金币+20): 非常感谢! 2011-04-15 14:51:03
franch(金币+1): 谢谢指点 2011-04-15 20:45:08
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-14 16:56:44:
你好,我按照你说的那个方法做了下,下面是我在做静态自洽时候设置的一些参数:SYSTEM=AAAAA
ENCUT=650
ISTART=0
ICHARG=2
ISMEAR=0
SIGMA=0.2
ISPIN=2
PREC=A
LREAL=Auto
NELM=200
NELMDL=-5
NELMI ...

不知道你做的什么体系,方面说吗?我个人认为体系不同采用的方法要略有不同。比如做表面物种的吸附,基底不能非自洽计算,所以电荷做差的公式要改成:Slab_ads -  ads  -  Slab_clean  ,你要得到三个CHGCAR,然后依次做差。
25楼2011-04-15 11:19:04
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 11:19:04:
不知道你做的什么体系,方面说吗?我个人认为体系不同采用的方法要略有不同。比如做表面物种的吸附,基底不能非自洽计算,所以电荷做差的公式要改成:Slab_ads -  ads  -  Slab_clean  ,你要得到三个CHGCAR,然 ...

你好,非常感谢你!真的,我做的是表面吸附,请你建议下,我应该用那个做的比较好?谢谢!
26楼2011-04-15 14:54:07
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渔火江枫

金虫 (小有名气)



haowenping(金币+10): 谢谢! 2011-04-15 15:45:26
franch(金币+1): 谢谢指点 2011-04-15 20:45:22
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-15 14:54:07:
你好,非常感谢你!真的,我做的是表面吸附,请你建议下,我应该用那个做的比较好?谢谢!

如果是想得到表面吸附物种与基底原子的成键,需要三个CHGCAR:CHGCAR1 是吸附物种和基底优化后做单点得到,CHGCAR2是把CONCAR中基底原子删掉,并相应修改INCAR,POTCAR,只算单点得到,CHGCAR3,把CONTCAR中吸附分子删掉,同样修改INCAR,POTCAR,再做单点得到(注意:后面两个的INCAR 中要增加NGFX,NGFY,NGFZ,与第一个计算保持一样)。然后,将三个CHGCAR做差得到CHGDIFF。最后,处理CHGDIFF有多种方法,最简单的是用VESTA(这个没有教程,自己摸索),第二个方法可以用lev00,配合origin做图,lev00教程里有这个方法的说明。第三个方法用emuch上流传的MS读取charge density的方法做(emuch搜索)。
27楼2011-04-15 15:23:18
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 15:23:18:
如果是想得到表面吸附物种与基底原子的成键,需要三个CHGCAR:CHGCAR1 是吸附物种和基底优化后做单点得到,CHGCAR2是把CONCAR中基底原子删掉,并相应修改INCAR,POTCAR,只算单点得到,CHGCAR3,把CONTCAR中吸附 ...

你好,谢谢你的回答,我还想问下:也就是说,我先总体的做了一次静态自洽计算。得到了CHGCAR1,然后呢,我把吸附原子去掉只剩下基底原子了,此时,我是要改变POTCAR的,但是INCAR中是要设置NGXF,NGYF,NGZF参数的,这些参数应该怎么设置?有什么标准没?如果把他设置成为NGX,NGY,NGZ的2倍行不行?这样得到了CHGCAR2文件。第三步就是把基底原子都删除,只做吸附原子的静态计算,(如果我只吸附了一个原子,是不是就只用这一个原子的静态计算),此时的INCAR中,我是不是直接用第二步的INCAR文件中设置的参数?这样我就得到了CHGCAR3。我还想问下,应该怎么将这三个电荷作差呢?怎么才能得到你说的那个CHGDIFF文件呢?希望继续指教,谢谢!
28楼2011-04-15 15:59:36
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渔火江枫

金虫 (小有名气)



franch(金币+1): 鼓励交流 2011-04-15 20:45:43
haowenping(金币+5): 谢谢! 2011-04-15 21:30:12
haowenping(金币+5): 谢谢,只是我又遇到了新的问题,希望你能帮忙解决下! 2011-04-16 09:05:34
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-15 15:59:36:
你好,谢谢你的回答,我还想问下:也就是说,我先总体的做了一次静态自洽计算。得到了CHGCAR1,然后呢,我把吸附原子去掉只剩下基底原子了,此时,我是要改变POTCAR的,但是INCAR中是要设置NGXF,NGYF,NGZF参数 ...

NGXF,NGYF,NGZF由第一个CHGCAR读取,分别写在后两个INCAR中,做差的方法原理是矩阵相减,具体的脚本你可以在网上找一下,好像http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/#DOS,有perl的脚本,试试看吧
29楼2011-04-15 19:00:33
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haowenping

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引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 19:00:33:
NGXF,NGYF,NGZF由第一个CHGCAR读取,分别写在后两个INCAR中,做差的方法原理是矩阵相减,具体的脚本你可以在网上找一下,好像http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/#DOS,有perl的脚本, ...

谢谢你!谢谢指教了!都是很实用的东西!
30楼2011-04-15 21:30:33
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stractor

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★ ★
haowenping(金币+1):谢谢参与
sunyang1988(金币+1): 谢谢交流 2011-04-16 10:14:22
呵呵,我还是用oringin处理。原来软件做的图比我的漂亮。
31楼2011-04-16 05:34:42
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 19:00:33:
NGXF,NGYF,NGZF由第一个CHGCAR读取,分别写在后两个INCAR中,做差的方法原理是矩阵相减,具体的脚本你可以在网上找一下,好像http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/#DOS,有perl的脚本, ...

你好,我想问你下,怎么将从CHGCAR中读出NGXF,NGYF,NGZF?如果我现在读出了NG(X,Y,Z)F,那么我只用将他们设置在INCAR中,计算的时候分别改一下POTCAR文件,然后将得到的CHGCAR1,CHGCAR2,CHGCAR3文件放一个目录下,用chgdiff.pl CHGCAR1 CHGCAR2 CHGCAR3就ok了吗?
32楼2011-04-16 08:26:59
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 19:00:33:
NGXF,NGYF,NGZF由第一个CHGCAR读取,分别写在后两个INCAR中,做差的方法原理是矩阵相减,具体的脚本你可以在网上找一下,好像http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/#DOS,有perl的脚本, ...

你好,我下载了个chgdiff.pl,但是我应该怎么用呢?你说的chgdiff.pl chargcar1 chgcar2,但是我应该怎么样运行这个呢?在什么系统下运行呢?是在dos下,还是在linux下?在linux下我又该如何,安装上这个命令呢?希望你能回答下,谢谢!
33楼2011-04-16 09:05:46
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渔火江枫

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sunyang1988(金币+1): 谢谢指点 2011-04-16 10:14:41
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-16 09:05:46:
你好,我下载了个chgdiff.pl,但是我应该怎么用呢?你说的chgdiff.pl chargcar1 chgcar2,但是我应该怎么样运行这个呢?在什么系统下运行呢?是在dos下,还是在linux下?在linux下我又该如何,安装上这个命令呢 ...

这个脚本是perl模块下的,linux下很容易
34楼2011-04-16 09:49:12
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-16 09:49:12:
这个脚本是perl模块下的,linux下很容易

你好,谢谢你的回答!只是能不能详细点呢?在linux下具体要些什么样的操作呢?我是不是要下载一个linux下的perl?
35楼2011-04-16 10:12:19
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haowenping(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-16 10:12:19:
你好,谢谢你的回答!只是能不能详细点呢?在linux下具体要些什么样的操作呢?我是不是要下载一个linux下的perl?

一般的linux系统都能直接运行
36楼2011-04-16 10:15:05
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2011-04-16 10:15:05:
一般的linux系统都能直接运行

版主你好,谢谢你!只是我想在linux下怎么就不能直接用呢?直接用了chgdiff.pl的时候没能够直接用的呀!说命令没找到,急求!
37楼2011-04-16 11:19:27
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haowenping(金币+3): 谢谢了! 2011-04-16 14:51:43
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-16 11:19:27:
版主你好,谢谢你!只是我想在linux下怎么就不能直接用呢?直接用了chgdiff.pl的时候没能够直接用的呀!说命令没找到,急求!

有什么错误提示吗
38楼2011-04-16 14:09:51
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haowenping

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2011-04-16 14:09:51:
有什么错误提示吗

谢谢你的回答,错误提示是这样的,command not found!请问是不是我的linux下没有这个?我用的是fedora!
39楼2011-04-16 14:50:53
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haowenping(金币+3): 谢谢! 2011-04-16 16:42:51
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Originally posted by haowenping at 2011-04-16 14:50:53:
谢谢你的回答,错误提示是这样的,command not found!请问是不是我的linux下没有这个?我用的是fedora!

你没有把chgidff.pl的路径添加到.bashrc中,不然就直接给出绝对路径运行
40楼2011-04-16 15:48:43
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haowenping

木虫 (著名写手)


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Originally posted by sunyang1988 at 2011-04-16 15:48:43:
你没有把chgidff.pl的路径添加到.bashrc中,不然就直接给出绝对路径运行

谢谢sunyang版主,这个确实是的,我并没有把chgdiff.pl添加到.bashrc下面,但是如果我要把他添加到.bashrc下面,该怎么做,还有,你说的直接给出绝对路径又是怎么一个情况。我把chgdiff.pl放在/home/charge下,我该如何用你说的绝对路径运行呢?
41楼2011-04-16 16:42:34
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渔火江枫

金虫 (小有名气)



sunyang1988(金币+1): 谢谢提示 2011-04-16 17:53:34
haowenping(金币+2): 谢谢! 2011-04-17 10:20:05
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-16 16:42:34:
谢谢sunyang版主,这个确实是的,我并没有把chgdiff.pl添加到.bashrc下面,但是如果我要把他添加到.bashrc下面,该怎么做,还有,你说的直接给出绝对路径又是怎么一个情况。我把chgdiff.pl放在/home/charge下, ...

你可以把chgdiff.pl和CHGCAR放在同一个目录下,用perl chgdiff.pl 执行命令试一试
42楼2011-04-16 17:45:04
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haowenping(金币+2): 谢谢! 2011-04-17 10:20:16
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2011-04-16 16:42:34:
谢谢sunyang版主,这个确实是的,我并没有把chgdiff.pl添加到.bashrc下面,但是如果我要把他添加到.bashrc下面,该怎么做,还有,你说的直接给出绝对路径又是怎么一个情况。我把chgdiff.pl放在/home/charge下, ...

把路径添加到.bashrc 然后source .bashrc就可以了
43楼2011-04-16 17:54:05
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CXC_小草

银虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
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3楼: Originally posted by songdewang at 2011-04-13 16:29:55:
你用lev00或者origin将两个CHGCAR文件相减即可

请问可以传一份lev00安装包及安装教程吗,xiexie !以前有一份2.46版本的,但对这侯爷爷的教程一直安装不成功!我的邮箱:cxcxiaocao@163.com,谢谢!
44楼2011-11-16 16:07:08
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CXC_小草

银虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
27楼: Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 15:23:18:
如果是想得到表面吸附物种与基底原子的成键,需要三个CHGCAR:CHGCAR1 是吸附物种和基底优化后做单点得到,CHGCAR2是把CONCAR中基底原子删掉,并相应修改INCAR,POTCAR,只算单点得到,CHGCAR3,把CONTCAR中吸附 ...

前辈你好,关于lev00,同学给我传了个2.46版本的,我根据侯爷爷的lev00处理电荷密度的教程,在进行安装变异的时候,运行lev00.comp生成可执行的lev00程序的时候老是出错说什么tools_strings出错,不知道怎么回事,很是无助,后面的工作也做不下去,内心一片惶恐,求前辈指导,或传一份lev00的安装包及安装教程,邮箱:cxcxiaocao@163.com,万分感谢!
45楼2011-11-16 16:16:39
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问天麦饼

捐助贵宾 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
27楼: Originally posted by 渔火江枫 at 2011-04-15 15:23:18
如果是想得到表面吸附物种与基底原子的成键,需要三个CHGCAR:CHGCAR1 是吸附物种和基底优化后做单点得到,CHGCAR2是把CONCAR中基底原子删掉,并相应修改INCAR,POTCAR,只算单点得到,CHGCAR3,把CONTCAR中吸附分 ...

你好,我想问下,如果是想看形成界面后电荷的转移,做CHGCAR2,CHGCAR3的时候,输入文件还是界面结构优化后的CONTCAR吗?是不是应该为单独优化衬底(或者吸附层)的CONTCAR?
46楼2014-04-22 18:51:25
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简单回复
2011-04-13 17:09   回复  
haowenping(金币+1):谢谢参与
bingmou(金币-1): 2011-04-13 19:02:42
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