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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 差分电荷密度图的分析，这个图对吗？
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hanyanli0475

铜虫 (小有名气)

[求助] 差分电荷密度图的分析，这个图对吗？

各位高手大家好，这是我计算得出来的差分电荷密度图，总感觉怪怪的，这是掺杂体系，我已经保证在相减时原子坐标是一样的了。从图中看出，在纳米带以外的地方也有电荷分布，似乎是掺杂原子的部分电荷分布。我自己的理解是，掺杂原子后，体系局域性增强了。这样理解对吗？还有是不是我这个图根本就有问题呢？请大家指点迷津啊。

2013-02-02 08:21:13的屏幕截图.png
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1楼2013-02-02 08:23:42
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lfhuang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hanyanli0475: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-02-03 08:34:16
liliangfang: 金币+2, 谢谢交流 2013-02-09 10:07:53
这个图可以说明电荷从参杂原子跑到周围C原子上了，蓝色代表减少，红色代表增多（参N？），这个图应该还是挺漂亮的吧。这里只能看到电荷转移情况，和局域不局域没有太强烈的依赖关系吧？
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先进使役材料计算（https://aidme.nimte.ac.cn）
3楼2013-02-02 23:11:45
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lfhuang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
hanyanli0475: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-02-03 21:31:52
liliangfang: 金币+2, 谢谢交流 2013-02-09 10:08:01
引用回帖:
4楼: Originally posted by hanyanli0475 at 2013-02-03 08:34:05
那您的意思是，这个图还是合理的了？？您有类似的文献，能提供一下吗？呵呵。但是，我已经加了真空层，怎么还能跑到别的原子上呢，我也试图把真空层加厚过，但是结构优化时，结构就变形了。现在还是疑惑中。请您在 ...

（1）具体我不知道您处理什么问题，但是至少我能从您这个图上看到电子转移的信息，从这个角度看，应该说您的图还是合理的吧。差分电荷怎么算，在于您的定义，定义好了，能从里面看出许多信息。除了我在您另外一个帖子推荐的文章：
http://iopscience.iop.org/0953-8984/25/5/055304 (图6，Li原子和Zigzag-GNR之间的电荷转移)
在另外一篇文章里也有不同的差分电荷定义：
http://prb.aps.org/abstract/PRB/v86/i12/e125433 （图5，H+graphene上的参杂电荷分布）
不同的定义能看出不同的信息。

（2）在您这个图里，没有电荷跑到别的原子上了，是您在pp.in中设定的区域将电荷分布给截断了。如果您这里真空方向是z轴，您可以将pp.in中的x0(3)变成一个负值，去足够大但不过大的e3。将电荷密度（蓝色部分）完全包含在设定的区域。
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5楼2013-02-03 21:07:47
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普通回帖

hanyanli0475

铜虫 (小有名气)
大家帮帮忙呗？呵呵，自己先顶一下了。呵呵。
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什么时候能算完！！！！
2楼2013-02-02 19:38:50
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hanyanli0475

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lfhuang at 2013-02-02 23:11:45
这个图可以说明电荷从参杂原子跑到周围C原子上了，蓝色代表减少，红色代表增多（参N？），这个图应该还是挺漂亮的吧。这里只能看到电荷转移情况，和局域不局域没有太强烈的依赖关系吧？

那您的意思是，这个图还是合理的了？？您有类似的文献，能提供一下吗？呵呵。但是，我已经加了真空层，怎么还能跑到别的原子上呢，我也试图把真空层加厚过，但是结构优化时，结构就变形了。现在还是疑惑中。请您在帮帮忙，呵呵。
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什么时候能算完！！！！
4楼2013-02-03 08:34:05
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hanyanli0475

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lfhuang at 2013-02-03 21:07:47
（1）具体我不知道您处理什么问题，但是至少我能从您这个图上看到电子转移的信息，从这个角度看，应该说您的图还是合理的吧。差分电荷怎么算，在于您的定义，定义好了，能从里面看出许多信息。除了我在您另外一个帖 ...

非常感谢您这个详细的回答。我试试。我算差分电荷密度，就是想看一下，掺杂后电荷的转移情况，和掺杂原子周围的电荷分布情况。
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什么时候能算完！！！！
6楼2013-02-03 21:33:17
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hanyanli0475

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lfhuang at 2013-02-03 21:07:47
（1）具体我不知道您处理什么问题，但是至少我能从您这个图上看到电子转移的信息，从这个角度看，应该说您的图还是合理的吧。差分电荷怎么算，在于您的定义，定义好了，能从里面看出许多信息。除了我在您另外一个帖 ...

您好，我的真空方向是x，y方向，z方向是周期的。但是，我照着您说的，类似的改了一下x0(1)和x0(2)，把它们取了负值，并且足够大，但不大于e1和e2，但是结果还是一样的，没有什么改观，我分别改了x0(1)和x0(2)，也同时改了，都试了试，但是，还是不行，您能再帮我想想办法吗？谢谢您哈。
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7楼2013-02-26 21:50:52
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lfhuang

木虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by hanyanli0475 at 2013-02-26 21:50:52
您好，我的真空方向是x，y方向，z方向是周期的。但是，我照着您说的，类似的改了一下x0(1)和x0(2)，把它们取了负值，并且足够大，但不大于e1和e2，但是结果还是一样的，没有什么改观，我分别改了x0(1)和x0(2)，也同 ...


这个问题属于细节问题，建议检查程序运行的每一个步骤是否准确（多核对说明书和参数表）。
其实不用改也行，在xcrysden显示里，多显示一个周期就可以了。
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hanyanli0475
先进使役材料计算（https://aidme.nimte.ac.cn）
8楼2013-02-28 05:30:20
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hanyanli0475

铜虫 (小有名气)
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引用回帖:
8楼: Originally posted by lfhuang at 2013-02-28 05:30:20

这个问题属于细节问题，建议检查程序运行的每一个步骤是否准确（多核对说明书和参数表）。
其实不用改也行，在xcrysden显示里，多显示一个周期就可以了。...

好的，谢谢您。
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9楼2013-02-28 10:11:59
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goldenfisher

金虫 (著名写手)

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hanyanli0475: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-02-28 10:45:39
结构优化应该对真空层有一个收敛过程才对，换句话说，真空层越厚，结构优化越好。而你的结构则变了，好像有问题。
第二，如果你的真空层方向的原子坐标是0附近的值，建议你平移一下，到原胞中间去。
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10楼2013-02-28 10:22:15
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