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hanyanli0475

铜虫 (小有名气)

[求助] 差分电荷密度图的分析,这个图对吗?

各位高手大家好,这是我计算得出来的差分电荷密度图,总感觉怪怪的,这是掺杂体系,我已经保证在相减时原子坐标是一样的了。从图中看出,在纳米带以外的地方也有电荷分布,似乎是掺杂原子的部分电荷分布。我自己的理解是,掺杂原子后,体系局域性增强了。这样理解对吗?还有是不是我这个图根本就有问题呢?请大家指点迷津啊。

2013-02-02 08:21:13的屏幕截图.png
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lfhuang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
hanyanli0475: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-02-03 08:34:16
liliangfang: 金币+2, 谢谢交流 2013-02-09 10:07:53
这个图可以说明电荷从参杂原子跑到周围C原子上了,蓝色代表减少,红色代表增多(参N?),这个图应该还是挺漂亮的吧。这里只能看到电荷转移情况,和局域不局域没有太强烈的依赖关系吧?
先进使役材料计算(https://aidme.nimte.ac.cn)
3楼2013-02-02 23:11:45
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lfhuang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
hanyanli0475: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-02-03 21:31:52
liliangfang: 金币+2, 谢谢交流 2013-02-09 10:08:01
引用回帖:
4楼: Originally posted by hanyanli0475 at 2013-02-03 08:34:05
那您的意思是,这个图还是合理的了??您有类似的文献,能提供一下吗?呵呵。但是,我已经加了真空层,怎么还能跑到别的原子上呢,我也试图把真空层加厚过,但是结构优化时,结构就变形了。现在还是疑惑中。请您在 ...

(1)具体我不知道您处理什么问题,但是至少我能从您这个图上看到电子转移的信息,从这个角度看,应该说您的图还是合理的吧。差分电荷怎么算,在于您的定义,定义好了,能从里面看出许多信息。除了我在您另外一个帖子推荐的文章:
http://iopscience.iop.org/0953-8984/25/5/055304 (图6,Li原子和Zigzag-GNR之间的电荷转移)
在另外一篇文章里也有不同的差分电荷定义:
http://prb.aps.org/abstract/PRB/v86/i12/e125433 (图5,H+graphene上的参杂电荷分布)
不同的定义能看出不同的信息。

(2)在您这个图里,没有电荷跑到别的原子上了,是您在pp.in中设定的区域将电荷分布给截断了。如果您这里真空方向是z轴,您可以将pp.in中的x0(3)变成一个负值,去足够大但不过大的e3。将电荷密度(蓝色部分)完全包含在设定的区域。
先进使役材料计算(https://aidme.nimte.ac.cn)
5楼2013-02-03 21:07:47
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普通回帖

hanyanli0475

铜虫 (小有名气)

大家帮帮忙呗?呵呵,自己先顶一下了。呵呵。
什么时候能算完!!!!
2楼2013-02-02 19:38:50
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hanyanli0475

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lfhuang at 2013-02-02 23:11:45
这个图可以说明电荷从参杂原子跑到周围C原子上了,蓝色代表减少,红色代表增多(参N?),这个图应该还是挺漂亮的吧。这里只能看到电荷转移情况,和局域不局域没有太强烈的依赖关系吧?

那您的意思是,这个图还是合理的了??您有类似的文献,能提供一下吗?呵呵。但是,我已经加了真空层,怎么还能跑到别的原子上呢,我也试图把真空层加厚过,但是结构优化时,结构就变形了。现在还是疑惑中。请您在帮帮忙,呵呵。
什么时候能算完!!!!
4楼2013-02-03 08:34:05
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hanyanli0475

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by lfhuang at 2013-02-03 21:07:47
(1)具体我不知道您处理什么问题,但是至少我能从您这个图上看到电子转移的信息,从这个角度看,应该说您的图还是合理的吧。差分电荷怎么算,在于您的定义,定义好了,能从里面看出许多信息。除了我在您另外一个帖 ...

非常感谢您这个详细的回答。我试试。我算差分电荷密度,就是想看一下,掺杂后电荷的转移情况,和掺杂原子周围的电荷分布情况。
什么时候能算完!!!!
6楼2013-02-03 21:33:17
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hanyanli0475

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by lfhuang at 2013-02-03 21:07:47
(1)具体我不知道您处理什么问题,但是至少我能从您这个图上看到电子转移的信息,从这个角度看,应该说您的图还是合理的吧。差分电荷怎么算,在于您的定义,定义好了,能从里面看出许多信息。除了我在您另外一个帖 ...

您好,我的真空方向是x,y方向,z方向是周期的。但是,我照着您说的,类似的改了一下x0(1)和x0(2),把它们取了负值,并且足够大,但不大于e1和e2,但是结果还是一样的,没有什么改观,我分别改了x0(1)和x0(2),也同时改了,都试了试,但是,还是不行,您能再帮我想想办法吗?谢谢您哈。
什么时候能算完!!!!
7楼2013-02-26 21:50:52
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lfhuang

木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by hanyanli0475 at 2013-02-26 21:50:52
您好,我的真空方向是x,y方向,z方向是周期的。但是,我照着您说的,类似的改了一下x0(1)和x0(2),把它们取了负值,并且足够大,但不大于e1和e2,但是结果还是一样的,没有什么改观,我分别改了x0(1)和x0(2),也同 ...


这个问题属于细节问题,建议检查程序运行的每一个步骤是否准确(多核对说明书和参数表)。
其实不用改也行,在xcrysden显示里,多显示一个周期就可以了。

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先进使役材料计算(https://aidme.nimte.ac.cn)
8楼2013-02-28 05:30:20
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hanyanli0475

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by lfhuang at 2013-02-28 05:30:20

这个问题属于细节问题,建议检查程序运行的每一个步骤是否准确(多核对说明书和参数表)。
其实不用改也行,在xcrysden显示里,多显示一个周期就可以了。...

好的,谢谢您。
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9楼2013-02-28 10:11:59
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goldenfisher

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
hanyanli0475: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-02-28 10:45:39
结构优化应该对真空层有一个收敛过程才对,换句话说,真空层越厚,结构优化越好。而你的结构则变了,好像有问题。
第二,如果你的真空层方向的原子坐标是0附近的值,建议你平移一下,到原胞中间去。
10楼2013-02-28 10:22:15
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