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doudou3689

木虫 (正式写手)

[求助] MS里电荷密度差分图的单位是什么 已有1人参与

求教大家一个电荷密度差分的问题。我们用VASP算电荷密度差分后单位是什么？在MS里画电荷密度差分图的时候，二维切面slice需要调整color mapping数值，这个值通常是正负几百，但文献中这个图例数值是正负10E-1到10E-3左右，单位是e/A3。我不知道在MS里设置的这个值单位是什么，怎么换算到e/A3？另外，还是在MS里做三维电荷密度差分图时，对isosurface所设置的iso-value单位是什么？
O(∩_∩)O~~

MS里电荷密度差分图的单位是什么
1.JPG


MS里电荷密度差分图的单位是什么-1
2.JPG
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1楼 2014-04-03 10:58:04
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mazuju028

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-04-07 22:03:15
doudou3689: 金币+50, ★★★很有帮助 2014-04-09 10:02:30
根据VASP说明书上所说：
“CHGCAR file
This file contains the lattice vectors, atomic coordinates, the total charge density multiplied by the volume     on the fine FFT-grid (NG(X,Y,Z)F).”
“Please do not forget to divide by the volume before visualizing the file!”

所以用VASP得到的CHGCAR的单位是e, 要获得真正意义的电荷密度，需要除以晶胞体积。
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2楼2014-04-03 12:26:57
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doudou3689

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mazuju028 at 2014-04-03 12:26:57
根据VASP说明书上所说：
“CHGCAR file
This file contains the lattice vectors, atomic coordinates, the total charge density multiplied by the volume     on the fine FFT-grid (NG(X,Y,Z)F).”
“Please ...

是不是在MS的color mapping所设置的值上再除以体积？那么对于slab模型来说真空层也计算在内吗？同一个结构用不同真空层得到的电荷密度不就不一样了？谢谢！
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3楼2014-04-03 14:24:15
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mazuju028

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by doudou3689 at 2014-04-03 14:24:15
是不是在MS的color mapping所设置的值上再除以体积？那么对于slab模型来说真空层也计算在内吗？同一个结构用不同真空层得到的电荷密度不就不一样了？谢谢！...

只要是采用VASP计算得到的CHGCAR，都是需要除以POSCAR中所表示晶胞的体积。如果有真空层，CHGCAR应该很多地方为0.
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4楼2014-04-03 14:38:43
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doudou3689

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by mazuju028 at 2014-04-03 14:38:43
只要是采用VASP计算得到的CHGCAR，都是需要除以POSCAR中所表示晶胞的体积。如果有真空层，CHGCAR应该很多地方为0....

非常感谢您的帮助，但我还是不太清楚怎么处理。CHGCAR里有5列数据，怎么去除以体积呢？如果要把结果可视化，是要除了体积之后再转成.grd文件吗？
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5楼2014-04-04 10:15:14
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mazuju028

木虫 (正式写手)
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-04-07 22:03:30
引用回帖:
5楼: Originally posted by doudou3689 at 2014-04-04 10:15:14
非常感谢您的帮助，但我还是不太清楚怎么处理。CHGCAR里有5列数据，怎么去除以体积呢？如果要把结果可视化，是要除了体积之后再转成.grd文件吗？...

其实什么都不处理，在最后标度时，如果是-100到100， 除以体积就行了，
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6楼2014-04-04 11:49:49
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doudou3689

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by mazuju028 at 2014-04-04 11:49:49
其实什么都不处理，在最后标度时，如果是-100到100， 除以体积就行了，...

还有个问题就是在3D图里设置的iso-value值怎么转化成e/A3？这时候不应该除以体积了吧，比如2维图里是-100到100，iso-value值大约是在10以下的，他俩不是一个数量级。这个等密度面代表的也是电荷密度，那它和二维图的值为什么不一样呢？
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7楼2014-04-04 12:28:21
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信之1973
8楼2014-04-07 10:08:32
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秋天很晴天

新虫 (小有名气)
楼主，请问一下您现在清楚MS里差分电荷密度图的单位是什么了吗？从回复里我找不到答案~
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9楼2015-10-14 15:52:26
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