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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

[交流] 【原创经验篇】由一个简单的酶切重组载体想到的.......... 已有20人参与

不得不承认,有时候做实验确实运气有很大关系;前段时间,做啥出啥,那叫一个顺利呀。。。 可是最近,有些低迷,就拿很简单的一个双酶切,耽搁了偶2天时间,如果让小老板知道了,那完了,狂风暴雨一般呀。。。

本人原帖:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3350346&fpage=1
首先感谢回复的各位童鞋们,你们的建议很有用,我谢谢了,随后BB一一奉上,请注意查收!

目前本人双酶切已经彻底搞定,目的基因已经成功连接至载体上了,其实即便没有双酶切的图我也可以证明,见后面!
虽说一个简单的双酶切,没什么大不了的,确实没有什么大不了的,可是小问题往往能够反映出大智慧。。。相信一个谨慎的科研者在细节上肯定做的很好,正如最近一部比较火爆的电视剧《裸婚时代》:细节打败爱情,同样我这里想说的是:细节打败实验,如果你留心一下,看看你们实验室大家平时的做实验的习惯,你便可以看出来这个人的实验结果以及种种。。。我们实验室便是如此!

貌似扯得有些远了,其实想说的就是细节这个东西,尤其在科研上,很重要,非常重要!不要因为它小便觉得无所谓,便觉得小case,其实不然,小细节做好了,那么大事绝对成矣,只不过是迟早的事!

   其实酶切这个东西吧,看似简单,其实讲究很多。。。当然各种方法体系网上到处都是,包括公司的说明书上,这里我讲的是我的一些想法,还请各位指正!
就拿我这酶切验证重组载体吧,首先大体说说基本步骤:
1:双酶切载体,然后电泳看是否切开,如果没有切开,有可能是酶太少,也有可能是作用时间不够,切忌这个时候不能直接纯化然后去做连接,当然了可以做连接,但是成功率太低,浪费了东西不说,宝贵的时间也会浪费,所以一定要保证载体酶切的很干净,一点拖尾都不能有,然后纯化一下,当然了纯化是个浓缩的过程,比如我切50ul的体系,最后纯化的时候,终体积20-30ul即可,然后点样看看怎么样?这一块有一个小细节,就是点完样之后,可以把其它的纯化产物继续加到柱子上(现在大家基本都用试剂盒进行纯化吧,所以离心柱你懂的)!让它继续.....

2:酶切基因,其实这一步很简单,没有什么特殊要求,过夜酶切或者切它8 9 10个小时都行,随后进行纯化,纯化终体积见上面;最后点样看亮度。。。

3:连接:连接之前呢,先将载体和基因混合,热活化一下,即45度10min,然后加连接酶,buffer,ddH2O;体系不用我说了,大家应该很清楚了,我的原则呢,基因比载体多些。。。

4:转化:转化前45度活化10min,然后转化进大肠杆菌感受态。。。涂布于加抗生素的板子上,这一步因载体不同,抗性标记也不同,筛选标记也不同,常见的就是蓝白斑筛选了,涂布X-gal少不了,过夜培养,一般18-24h,之后长出来的很少有对的。。。挑几个疑似连接上的单克隆划线第二天验证。。。

5:验证:<1>PCR,可以作为初步筛选,用几个菌的裂解液当模板进行PCR,原来坛子上有人建议用快检的方法,也可以;PCR出来点样,有条带的那基本就对了;
                <2>能P出来的菌,提质粒,然后双酶切验证,验证对了基本你的克隆也就搞定了,下一步呢?可以测你想要的很多数据了。。。。因各种实验不同,以下就不赘述了。。。。

目前本人已经成功进行双酶切验证了,至于什么问题呢,大家如果感兴趣,见上面链接,直接上图
   
泳道1:marker
泳道2:载体digest
泳道3:gene digest
泳道4,5:重组载体 digest

我连接的这个片段500bp,虽说不大,可是做一个漂亮的双酶切,得到底下那条基因的条带还是比较难的,不过今天我重新提了质粒,质粒比较亮,然后多切了一些,这才勉强得到这张图,大家轻拍。。。呵呵!

所以大家如果以后连接小片段的话,尤其是小片段练到大载体上的话,提取的重组质粒一定要亮,质量一定要大,不然做双酶切验证那是何其的困难啊。。。我原先提取的重组载体不是很亮,然后双酶切,只有上面载体的条带,底下基因的那条木有啊,就是木有,你说郁闷不郁闷?所以切记:质粒一定要亮!
    当然了,酶切验证的体系呢,一般10ul就可以了,但是如果片段小的话,就像我这种情况,也可以切20ul体系的。。。

说了这么多,其实是本人的一些心得吧,拿来与大家分享,希望大家实验都顺利进行,每天像打鸡血一样进行实验,实验结果刷刷刷的往出蹦。。。呵呵呵!

[ Last edited by 天使托 on 2011-7-1 at 22:33 ]
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527702467

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by erryzhen at 2011-07-02 16:29:26:
楼主说的“连接之前呢,先将载体和基因混合,热活化一下,即45度10min”适用于所有的载体和目的片段吗?我以前没试过~望指点迷津!

我也想问问楼主,热活化有什么作用?
8楼2011-07-02 16:46:21
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查看全部 32 个回答

gwbk

木虫 (正式写手)

0.8

实验做出来最开心~幸福。
2楼2011-07-01 23:07:14
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
送鲜花一朵
恭喜啊,呵呵~天使君的经验很好啊!
3楼2011-07-01 23:56:54
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xiaoweiwei121

荣誉版主 (文坛精英)

这潭水蓝的深邃

优秀区长优秀区长优秀版主优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖

最近犯了一个错误
ok吧
以后明白该怎么去做了
思考和讨论是绝对不可少的啊
4楼2011-07-02 05:08:13
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