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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求助：大肠杆菌基因组的提取
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nestzhao

木虫 (小有名气)

[求助] 求助：大肠杆菌基因组的提取

最近进行大肠杆菌基因组的提取，提出来以后电泳结果不是很满意：基因组提完以后，进行电泳检测，上样的时候，总有种往外要飘出来的感觉，跑完电泳以后，基因组的条带亮度很亮，但是有种边缘很虚的感觉，不是很规则的条带，在2k左右会有一个条带，亮度不是很高，其他情况都正常。（质粒是用试剂盒提的，以前已经用过几次，都是正常的，电泳时marker的条带也是正常的）。
向请大家请教一下，这是什么原因？？
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给力2011
1楼 2011-06-22 18:49:34
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ty1987

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3): 鼓励应助 2011-06-22 21:41:40
nestzhao(金币+2): 2011-06-22 21:46:15
"上样的时候，总有种往外要飘出来的感觉"，貌似是杂质含量比较多，DNA纯度不高，另外染色体一般不会断到2KB啊，请问楼主提染色体的目的是什么，如果是调基因的话，可以直接PCR获得目的基因，有时作为模板，对于染色体要求并不是很高。
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2楼2011-06-22 20:28:49
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zboter

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

看不懂，你是在提基因组还是质粒
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3楼2011-06-22 20:48:53
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lilirong2009

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
nestzhao(金币+1): 2011-06-24 14:49:46
西瓜(金币+3): 鼓励应助 2011-06-24 16:16:48
飘是因为乙醇没有挥发干净，我之前做的时候也是这样的。我也在提取大肠杆菌基因组DNA，但是现在提取的都是降解的，很是不解
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4楼2011-06-24 14:42:29
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nestzhao

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by lilirong2009 at 2011-06-24 14:42:29:
飘是因为乙醇没有挥发干净，我之前做的时候也是这样的。我也在提取大肠杆菌基因组DNA，但是现在提取的都是降解的，很是不解

我最近提的感觉也有点降解的，跑PCR也会有杂带。
以前都是正常的，还是同一个菌的，真不知道是为什么
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给力2011
5楼2011-06-24 14:52:09
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lilirong2009

铜虫 (小有名气)
有同感，以前随便怎么提都不讲解，现在总不行，楼主有什么经验分享一下，帮我度过难关
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6楼2011-06-25 13:34:52
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nestzhao

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by lilirong2009 at 2011-06-25 13:34:52:
有同感，以前随便怎么提都不讲解，现在总不行，楼主有什么经验分享一下，帮我度过难关

我也没啥经验可言，一直都很不顺，唉
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给力2011
7楼2011-06-25 13:47:49
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