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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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lilirong2009

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】凝胶电泳 已有7人参与

我提的大肠杆菌基因组总DNA 跑0.7%的琼脂糖凝胶电泳后 点样孔中仍有部分亮点,是什么原因啊?  (附上图
另外,之前我曾用48000bp的DNA做marker跑大肠杆菌基因组总DNA凝胶电泳,从电泳图上看基因组总DNA跑得比marker远,但是我从网上查的大肠杆菌基因组总DNA长度是400多万bp,这是什么原因呢?

[ Last edited by lilirong2009 on 2010-8-13 at 12:58 ]
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ben1147

木虫 (正式写手)

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看天(金币+1):鼓励 2010-08-13 13:49:44
marker一般是线状
大肠杆菌基因组是环状吧

点样孔里有东西的话,可能是样品不够纯,裹着DNA

[ Last edited by ben1147 on 2010-8-13 at 13:57 ]
2楼2010-08-13 13:41:39
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wjswj

木虫 (正式写手)

小木虫领金币专业户

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看天(金币+2):鼓励回答 2010-08-13 13:49:54
为什么喜欢把胶倒过来看呢?是用试剂盒提的吧?跟marker比的大小不用管它,这么多提的还不错了,就是有一些些杂质没去干净,多糖啊,蛋白质之类的,再用酚氯仿抽提一次试试。
金币是赌出来的
3楼2010-08-13 13:43:01
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violet.zhou

木虫 (小有名气)

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scelab(金币+2):欢迎多来交流!:tiger06: 2010-08-13 18:37:50
用试剂盒提的话,不至于样品不纯导致跑成这样的结果吧。不过可以试下胶回收以后再跑下电泳。建议跑电泳的时候一定要跑marker。
4楼2010-08-13 14:41:57
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lilirong2009

铜虫 (小有名气)

不是用试剂盒提的啊,手提的!  另外,大肠杆菌基因组DNA有多大啊
5楼2010-08-13 15:19:35
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holyala

木虫 (著名写手)

砖家

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scelab(金币+1):欢迎多来交流!:tiger06: 2010-08-13 18:37:58
引用回帖:
Originally posted by lilirong2009 at 2010-08-13 15:19:35:
不是用试剂盒提的啊,手提的!  另外,大肠杆菌基因组DNA有多大啊

完整性较好的话,不论什么物种的gDNA电泳大小都为23kb左右,当然也会有一定偏差,但基本上都在λ Hind III marker最大的那个条带附近。
6楼2010-08-13 15:35:44
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lilirong2009

铜虫 (小有名气)

用酚氯仿再处理了,结果DNA都不见了
7楼2010-08-15 10:55:58
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lilirong2009

铜虫 (小有名气)

今天又重新提取了,除多糖和蛋白的步骤都增加了,乙醇洗液多洗了几遍,可是上样量0.5微升的时候点样孔里面还是亮的,杯具啊!可是纯度都在1.8左右啊。

[ Last edited by lilirong2009 on 2010-8-15 at 20:07 ]
8楼2010-08-15 10:59:32
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wjswj

木虫 (正式写手)

小木虫领金币专业户

…………………………


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
都不见了??悲剧啊,沉淀的时候把DNA倒掉了吧。提得时候可以试着放大体积,那样杂质除的也能干净点。另外浓度太高也有可能出现胶孔亮,电泳的样品可以稀释一下。
金币是赌出来的
9楼2010-08-16 09:53:36
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lilirong2009

铜虫 (小有名气)

谢谢楼上
10楼2010-08-17 07:59:50
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