24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1776  |  回复: 5
本帖产生 1 个 MolEPI ,点击这里进行查看

fancrystalli

新虫 (初入文坛)

[求助] 土壤中含有农药,提取的土壤DNA进行PCR扩增,农药会抑制PCR反应吗

最近在做土壤微生态研究,目的是研究土壤中添加农药后对土壤中微生物的影响,取样在农药施用一个月内,具体残留还未做。现在用的是MOBIO公司的power DNA提取试剂盒,按照大多数人的说法,这已经是很好的而且用的很广的土壤DNA提取试剂盒了,提取出来的DNA电泳可见,但就是PCR得不到目的条带,阳性对照成功扩增出,采用降落PCR,将样品进行过10~50倍的稀释,仍扩增失败。想请教有经验的前辈,会不会是因为土壤中的农药残留对PCR产生了抑制,如果是的话,应该怎样处理?在此,先谢谢大家了。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

【分子生物】EPI帖

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3): 鼓励应助。楼主说的对照可能不是土壤样品吧。 2011-06-15 21:47:40
农药应该不会抑制PCR反应,因为你的阳性对照能P出来

可能还是引物有问题
2楼2011-06-15 19:55:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwbk

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5, EPI+1): good! 2011-06-15 21:50:56
农药一般不会抑制DNA聚合酶活性,而抑制胆碱酯酶活性的较多,农药大多是神经毒剂,一般导致昆虫过度兴奋而死,反过来说,几乎没有农药设计DNA聚合酶为靶点。而除草剂一般分为激素类、光合抑制类、阻抑氨基酸、脂类合成、抑制细胞分裂等,也不会抑制DNA聚合酶。

再说,你用的试剂盒我也在用,相当好。提纯的DNA不会带有土壤中DNA以外的物质,水除外。
3楼2011-06-15 20:41:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fancrystalli

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by cdl007 at 2011-06-15 19:55:00:
农药应该不会抑制PCR反应,因为你的阳性对照能P出来

可能还是引物有问题

阳性对照是纯细菌的染色体DNA,引物用的是16S V3区通用引物,阳性对照已经扩增出来了,引物应该没问题吧
4楼2011-06-16 09:22:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yabing0324

金虫 (职业作家)

现在扩出来了没呢?祝好运
5楼2011-07-04 11:21:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jzhe961

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

好多农药都是脂溶性的,提取DNA时进入氯仿相而被除去。
6楼2011-07-04 11:56:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fancrystalli 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 调剂 +13 小张ZA 2026-04-10 14/700 2026-04-10 08:49 by 孙小小12457
[考研] 08600生物与医药-327 +10 18755400796 2026-04-05 10/500 2026-04-10 08:14 by kangsm
[考研] 085601初试330分找调剂 +10 流心奶黄包l 2026-04-09 10/500 2026-04-10 08:14 by Sammy2
[考研] 273求调剂 +42 麦小叮当 2026-04-06 49/2450 2026-04-10 08:08 by kangsm
[考研] 314求调剂 +21 wakeluofu 2026-04-09 22/1100 2026-04-10 07:51 by 1753564080
[考研] 22408调剂求助 +3 毂12 2026-04-09 5/250 2026-04-09 23:21 by zhouyuwinner
[考研] 计算机类求调剂,22408-274分 +5 上岸de小虫 2026-04-09 6/300 2026-04-09 20:48 by xujun0624
[考研] 一志愿鲁东大学071000生物学学硕初试分数276求调剂 +19 慕绝cc 2026-04-09 23/1150 2026-04-09 17:14 by 段伟艳
[考研] 化学调剂求助 +14 LULONG1 2026-04-03 19/950 2026-04-09 10:43 by chenxi233
[考研] 0860004 求调剂 309分 +6 Yin DY 2026-04-09 6/300 2026-04-09 10:19 by 啊李999
[考研] 软件工程求调剂22软工296分求调剂,接受跨调 +4 yangchen2017 2026-04-08 5/250 2026-04-08 21:56 by 土木硕士招生
[考研] 0703调剂,一志愿天津大学319分 +23 haaaabcd 2026-04-05 26/1300 2026-04-08 16:19 by luoyongfeng
[考研] 331求调剂 +5 张元一 2026-04-07 6/300 2026-04-07 22:13 by hemengdong
[考研] 316求调剂 +7 yyx想调剂 2026-04-05 7/350 2026-04-07 14:31 by shdgaomin
[考研] 295求调剂 +18 xndjjj 2026-04-04 19/950 2026-04-07 11:02 by wangjy2002
[考研] 求调剂 +4 电气小神童 2026-04-04 6/300 2026-04-07 00:14 by guanxin1001
[考研] 327考研调剂推荐 +6 呜呜呜呜呢 2026-04-06 6/300 2026-04-06 21:39 by 啵啵啵0119
[考研] 297分083200求助 +9 aekx 2026-04-05 9/450 2026-04-06 20:57 by flysky1234
[考研] 298求调剂 +7 manman511 2026-04-05 7/350 2026-04-05 10:29 by 唐沐儿
[考研] 本科985,专业0812分336求调剂 +4 莫莫很行 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:31 by zhq0425
信息提示
请填处理意见