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NO.24Kobe

金虫 (小有名气)

[交流] 分子对接前配体是怎么处理的啊-例如用AD做

最近对分子对接比较感兴趣，想玩下我用的是AD，结果按说明做时，配体老是出问题，望高人们指点迷津！谢谢啦！
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1楼 2011-06-02 08:43:17
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NO.24Kobe

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2011-06-03 13:12:36:
配体用chem3D弄成MOL2格式，配体是不应该用pdb格式的！

我现在对pdb格式有点了解了，但是AD3.05说明书里是说要生成pdb的，我先按您的建议转换下，试试吧！
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9楼2011-06-03 15:53:21
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★
NO.24Kobe(金币+1):谢谢参与
NO.24Kobe(金币+1): 2011-06-03 08:27:27
你说的AD是Autodock？还有这缩写，我玩了不短时间的Autodock，还真不知道，孤陋寡闻了。
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2楼2011-06-02 18:46:45
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zmywahrheit

金虫 (初入文坛)
★ ★ ★
NO.24Kobe(金币+1):谢谢参与
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-06-03 22:10:10
打开配体,选则Torsion,保存
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2011-06-02 21:30:30
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zh1987hs

金虫 (著名写手)
★ ★
NO.24Kobe(金币+1):谢谢参与
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-06-03 22:10:16
问题问的不太明确，别人怎么回答你呢？呵呵~
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2011-06-02 22:11:02
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