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游子8921铁杆木虫 (知名作家)
游子8921
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[求助]
请帮我做下酶的MD
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我不是纯粹搞分子模拟的，也没有关于分子模拟的相关软件。gromacs， amber都没有。但是我现在做的这个酶需要跑下MD以获得比较合理的初始结构，我从PDB数据库中得到的构象太模糊。有高手指点说是需要做下MD。请会做的高手帮忙，我在做实验遇到很大困难。希望予以帮助。谢谢。PDB：3NX2 （这是带有底物的整个酶)，all2是我截取的活性中心，但我怀疑有遗漏的活性残基 |
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yongma2008
木虫 (著名写手)
论文？苦！主。
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御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-06-03 08:59:18
御剑江湖(金币+2): BB太少了，哈哈 2011-06-03 08:59:35
zh1987hs(金币+10): 应楼主要求，+10 2011-06-04 15:19:12
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建议安装gromacs自己做一下，不很难的 简易教程： http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2871421 |
3楼2011-06-02 18:49:13
4楼2011-06-05 22:47:35