| 查看: 900 | 回复: 3 | ||
游子8921铁杆木虫 (知名作家)
游子8921
|
[求助]
请帮我做下酶的MD
|
|
我不是纯粹搞分子模拟的，也没有关于分子模拟的相关软件。gromacs， amber都没有。但是我现在做的这个酶需要跑下MD以获得比较合理的初始结构，我从PDB数据库中得到的构象太模糊。有高手指点说是需要做下MD。请会做的高手帮忙，我在做实验遇到很大困难。希望予以帮助。谢谢。PDB：3NX2 （这是带有底物的整个酶)，all2是我截取的活性中心，但我怀疑有遗漏的活性残基 |
回复此楼» 猜你喜欢
我在等一个没有答案的答案
已经有3人回复
-
半夜喝咖啡
已经有5人回复
-
面上本子正文33页，违规吗？会被低分嘛？
已经有6人回复
-
今年审到国自然15份，谈谈感受
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有7人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有7人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 做限制性酶切，请帮忙分析下
已经有10人回复
- 请高手帮我分析下我做的这个XRD 我想知道里面都有什么化合物
已经有7人回复
- 做电化学酶生物传感器检测农残的请进！讨论其应用及前景
已经有5人回复
- 酶基因表达量高，酶活性就一定高吗？（请大家帮帮忙，谢谢）
已经有12人回复
- 为什么我做的酶切连接总是不长斑呢？
已经有24人回复
- 【求助/交流】部分酶切的电泳图不知为何成这个样子？有经验的虫虫们帮忙解释一下吧！
已经有10人回复
- 【求助/交流】怎么做都提不出DNA，请高手帮一下忙喽！！！！
已经有52人回复
- 请帮忙看一下多个XRD的三维图谱在origin里怎么做？
已经有11人回复
- 【求助/交流】帮我看一下质粒单双酶切图！
已经有29人回复
- 【求助/交流】哪位帮我看看这个酶切电泳！！
已经有7人回复
- 【求助/交流】PCR总是做不出来，请帮忙分析下原因
已经有12人回复
- 【求助/交流】以连接产物做模板扩增此连接产物，有问题请教各位达人~麻烦您帮忙分析下
已经有9人回复
- 【请教】做磁性材料的麻烦帮忙看下这个图
已经有42人回复
duotojh
金虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 1066.6
- 红花: 5
- 帖子: 225
- 在线: 137.8小时
- 虫号: 1290636
- 注册: 2011-05-09
- 专业: 生物物理、生物化学与分子
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+6): 深有同感~自己动手，丰衣足食，这里许多人专业都不是做分子模拟的 2011-06-01 22:32:50
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-06-02 18:20:36
zh1987hs(金币+10): 应楼主要求，+10 2011-06-04 15:18:56
zh1987hs(金币+6): 深有同感~自己动手，丰衣足食，这里许多人专业都不是做分子模拟的 2011-06-01 22:32:50
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-06-02 18:20:36
zh1987hs(金币+10): 应楼主要求，+10 2011-06-04 15:18:56
| 内容已删除 |
2楼2011-06-01 21:52:50
yongma2008
木虫 (著名写手)
论文？苦！主。
- 模拟EPI: 1
- 应助: 34 (小学生)
- 金币: 2091.6
- 散金: 1670
- 红花: 15
- 帖子: 1610
- 在线: 398.5小时
- 虫号: 1091013
- 注册: 2010-09-06
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-06-03 08:59:18
御剑江湖(金币+2): BB太少了，哈哈 2011-06-03 08:59:35
zh1987hs(金币+10): 应楼主要求，+10 2011-06-04 15:19:12
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-06-03 08:59:18
御剑江湖(金币+2): BB太少了，哈哈 2011-06-03 08:59:35
zh1987hs(金币+10): 应楼主要求，+10 2011-06-04 15:19:12
|
建议安装gromacs自己做一下，不很难的 简易教程： http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2871421 |
3楼2011-06-02 18:49:13
4楼2011-06-05 22:47:35
精华III:
