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vigaryang

木虫 (正式写手)

[求助] 关于结构优化中的对称性问题

如果要优化一个像NH3这种明确知道对称性的分子,是不是在优化时需要事先指定优化过程中对称性不变?如果是的话,是通过symmetry(pg=?)实现呢,还是在分子内坐标输入部分设置变量实现?网上查了一下,发现很难见到与symmetry(pg=?)这个命令有关的信息,不知是为什么。难道对于这种分子也不需要指定对称性吗,而任由其自由优化吗。谢谢。
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

引用回帖:
在我的某一个计算中,初始构型和结束构型都是Oh对称(在gaussview中搭建初始分子时通过point group菜单控制了对称性),但我在.log文件中搜索point group关键词时,发现中间这些构型的point group都是C1。不知这正常不。

如果你在log文件中搜索point group,看到gaussian判定为C1,那么它就按C1优化,也就是没有对称性。原因有二:
1、gaussian对于对称性的判定是比较笨的,尤其Oh它经常是判定不出来的,这个应该是个bug,不知道g09改善了没有;
2、就是判定标准的问题,如果不用内坐标的形式,那么即便gview给出正确的对称性,但gaussian的标准与gview不同,也可能给出不同的结果。通常是由于笛卡尔坐标的精度有限导致的。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
7楼2011-05-25 14:32:38
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zhficcas

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-05-23 08:43:08
vigaryang(金币+2): 2011-05-23 21:48:17
通过内坐标来控制变量, 这个NH3可能还要引入虚原子来精确定义二面角.
2楼2011-05-23 06:20:29
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vigaryang

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhficcas at 2011-05-23 06:20:29:
通过内坐标来控制变量, 这个NH3可能还要引入虚原子来精确定义二面角.

为什么不用symmetry(pg=?)呢?
3楼2011-05-23 06:47:46
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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)

关于对称性方面也是我迷惑的 关注一下。
为了消除虚频有种尝试是忽略对称性(nosymm)这是不是以降低计算精度为代价呢?
4楼2011-05-23 09:59:46
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