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vigaryang

木虫 (正式写手)

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[求助] 关于结构优化中的对称性问题

如果要优化一个像NH3这种明确知道对称性的分子，是不是在优化时需要事先指定优化过程中对称性不变？如果是的话，是通过symmetry(pg=?)实现呢，还是在分子内坐标输入部分设置变量实现？网上查了一下，发现很难见到与symmetry(pg=?)这个命令有关的信息，不知是为什么。难道对于这种分子也不需要指定对称性吗，而任由其自由优化吗。谢谢。

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1楼2011-05-23 04:42:32

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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

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引用回帖:

在我的某一个计算中，初始构型和结束构型都是Oh对称（在gaussview中搭建初始分子时通过point group菜单控制了对称性），但我在.log文件中搜索point group关键词时，发现中间这些构型的point group都是C1。不知这正常不。

如果你在log文件中搜索point group，看到gaussian判定为C1，那么它就按C1优化，也就是没有对称性。原因有二：
1、gaussian对于对称性的判定是比较笨的，尤其Oh它经常是判定不出来的，这个应该是个bug，不知道g09改善了没有；
2、就是判定标准的问题，如果不用内坐标的形式，那么即便gview给出正确的对称性，但gaussian的标准与gview不同，也可能给出不同的结果。通常是由于笛卡尔坐标的精度有限导致的。