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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » HyperChem/NWChem » 【求助】关于卟啉衍生物的分子结构以及它在Hyperchem中的优化问题
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chem虫虫

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于卟啉衍生物的分子结构以及它在Hyperchem中的优化问题 已有1人参与

哪位高手帮我看看这种卟啉衍生物的分子结构图：
TMPyP4:5, 10,15,20-Tetra(N-methyl-4-pyridyl)porphyrinc hloride,
            氯化 5 ,10 ,15 ,20 一四 一（N一甲基一4-吡啶基)卟啉，
我自己画了结构图，我想知道对着没，氯原子的连接位置是否正确。
还有我想知道，它在hyperchem中该用哪种方法优化？谢谢
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1楼 2009-10-28 10:14:44
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)
yjcmwgk(金币+0,VIP+0):汗，你说我的id我也不拍你啊。上次吓着你啦？哈哈不好意思 10-28 12:34
用HYPERCHEM不好办，GAUSSIAN是常用于此的手段，某一版主是这方面的专家，不说ID是怕拍砖。
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2楼2009-10-28 11:25:47
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
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lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 10-28 20:07
==gjf文件开始==
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xx

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==gjf文件结束==
自己下载一个高斯，算吧

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-10-28 at 12:40 ]
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3楼2009-10-28 12:38:26
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
引用回帖:
Originally posted by yytsnake at 2009-10-28 11:25:
用HYPERCHEM不好办，GAUSSIAN是常用于此的手段，某一版主是这方面的专家，不说ID是怕拍砖。

这个构型有D2对称性
如果保持对称性优化，Windows应该能算得动吧？
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4楼2009-10-28 12:39:40
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tiechong

金虫 (著名写手)
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 10-29 11:31
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2009-10-28 12:39:

这个构型有D2对称性
如果保持对称性优化，Windows应该能算得动吧？

以前算过一个tetraphenylporphyrin, 跟这个结构差不多，meso位置上的苯环是不垂直于porphyrin环的， 有一个偏转角度， 达不到D2对称性，这个结构的吡啶也不一定会跟porphyrin环垂直， 只有C2，我感觉最好nonsym
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5楼2009-10-29 08:23:23
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 10-29 11:31
引用回帖:
Originally posted by tiechong at 2009-10-29 08:23:
以前算过一个tetraphenylporphyrin, 跟这个结构差不多，meso位置上的苯环是不垂直于porphyrin环的， 有一个偏转角度， 达不到D2对称性，这个结构的吡啶也不一定会跟porphyrin环垂直， 只有C2，我感觉最好no ...

你说得对，确实meso位的苯环与Porphyrin环确实不垂直

但是不垂直照样可以达到D2对称性。如果真垂直了，就不是D2对称性了。如果真垂直了，对称性可就提高到D2h了。
没事儿别用nosymm。就算是用symm(pg=?,axis=?)也尽量别用nosymm。除非你的计算资源宽裕到“计算资源不浪费，就觉得不舒服”的地步

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-10-29 at 09:12 ]
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6楼2009-10-29 09:09:52
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chem虫虫

铜虫 (小有名气)
谢谢各位大侠的指导，我会好好学习看看的
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7楼2009-10-29 10:19:11
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chongchong11

至尊木虫 (著名写手)

Senior Engineer
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
就这么一个东东还得付费，，呵呵！！！
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Nature+Science=Wisdom
8楼2010-07-25 21:54:43
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